Název:
Predikce vlivu aminokyselinových mutací na sekundární strukturu proteinů
Překlad názvu:
Prediction of the Effect of Amino Acid Substitutions on Secondary Structure of Proteins
Autoři:
Hyrš, Martin ; Vogel, Ivan (oponent) ; Bendl, Jaroslav (vedoucí práce) Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2013
Jazyk:
cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstrakt: [cze][eng]
V této práci zkoumám, jak mutace aminokyselionové sekvence proteinu poznamená jeho sekundární strukturu. Zjistil jsem, že sekundární struktura je vůči mutacím poměrně odolná, některé úseky si udrľí svoji strukturu, i když jejich sekvence je zcela odlišná. Tato odolnost se projevuje i u náhodných sekvencí, je to tedy obecná vlastnost sekvencí aminokyselin. Jednotlivé konformace jsou ke změnám způsobeným mutací různě citlivé. Citlivost proteinu vůči mutacím závisí na složení jeho struktury. V počátečních kapitolách jsou popsány vybrané metody predikce sekundární struktury.
In this thesis I investigate the effect of amino acid substitutions on secondary structure of proteins. I found that the secondary structure is relatively resistant to mutations, some regions hold the same secondary structure, even though their sequences are very different. Since this effect was observed also for random sequences, I conclude that it is a general property of the amino acid sequence. The particular elements of secondary structures are differentially sensitive to the changes caused by mutations. Protein's sensitivity to mutations depends on the composition of its secondary structure. Some methods of secondary structure prediction are described in the introductory section.
Klíčová slova:
evoluce in silico; Mutace proteinů; odolnost sekundární struktury vůči mutaci; predikce sekundární struktury proteinu; sekundární struktura proteinů; evolution in silico; prediction of secondary structure of proteins; Proteins' mutations; secondary structure of proteins; secondary structure resistance to a mutation
Instituce: Vysoké učení technické v Brně
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT. Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/53539