Original title: Structural and functional characterization of giant plant Ogre-like retrotransposons
Translated title: Structural and functional characterization of giant plant Ogre-like retrotransposons
Authors: STEINBAUEROVÁ, Veronika
Document type: Doctoral theses
Year: 2012
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Ogre elementy představují zvláštní skupinu rostlinných Ty3/gypsy LTR retrotranspozónů. Jejich charakteristickým rysem je přítomnost nadbytečného ORF s neznámou funkcí a nekódující sekvence nacházející se mezi proteázou a reverzní transkriptázou. Tato práce analyzuje sestřih této nekódující sekvence a zároveň se zabývá studiem nadbytečného ORF nejen u Ogre retrotranspozónů, ale i u celé skupiny Ty3/gypsy elementů. Ogre elements represent a distinct group of Ty3/gypsy LTR retrotransposons occurring in a range of dicot plants. They are characterized by two specific features ? presence of long extra open reading frame in 5´ untranslated region with unknown function and a non-coding sequence containing several stop codons separating protease and reverse transcriptase domains which was proposed to be removed by splicing. This thesis describes the functional analysis of intron splicing in Ogre retrotransposons. Further, it investigates additional coding information not only in Ogre retrotransposons but in the whole group of Ty3/gypsy retroelements.
Keywords: additional ORFs; gag-pol; LTR retrotransposons; plant genome; splicing; transcription; gag-pol; LTR retrotranspozóny; nadbytečný ORF; rostlinný genom; sestřih; transkripce
Citation: STEINBAUEROVÁ, Veronika. Structural and functional characterization of giant plant Ogre-like retrotransposons. České Budějovice, 2012. disertační práce (Ph.D.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/5078

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-112206


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses