Název: Okrasné parkové dřeviny zásobárnou virů čeledi Rhabdoviridae
Překlad názvu: The ornamental park tree species as a resource of the Rhabdoviridae family viruses
Autoři: PECKOVÁ, Lucie
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2012
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Viry čeledi Rhabdoviridae napadající rostlinné hostitele, byly dosud popisovány pouze u krytosemenných rostlin. V této práci byla poprvé studována rhabdovirová infekce u nahosemenné rostliny ? jinanu dvoulaločného. Přestože na žádném z náhodně vybraných rostlinných materiálech nebyly evidentní symptomy infekčního napadení, byla prostřednictvím molekulárních metod a detekčních primerů prokázána rhabdovirová infekce u šesti odebraných vzorků rostlinného materiálu. Získané nukleotidové a aminokyselinové sekvence porovnané se sekvencemi v GenBank potvrzují výskyt viru(ů) rodu Rhabdovirus. Sekvence vykazovaly určitou analogii s Strawberry crinkle virus řazeným mezi Cytorhabdoviry. Z analýz vyplynulo, že vzájemná homologie nukleotidových sekvencí jednotlivých izolátů je rozdílná a s velkou pravděpodobností byla ve vzorcích z jinanu dvoulaločného poprvé prokázána přítomnost dvou zatím neidentifikovaných virů. Definitivní zařazení bude záviset na získání a porovnání dalších sekvencí z genomu izolátů a na zjištění jejich některých biologických vlastností. Rhabdoviridae family viruses attacking the plant hosts were only described at the angiosperms. In this work, a gymnosperm rhabdoviridae infection was described for the first time ever ? specifically at Ginkgo biloba. Even though there were not observed any kinds of obvious infection symptoms on any of randomly chosen plant samples, through the molecular methods and detection primers the rhabdoviridae infection was proved at six of the plant samples. The acquired nucleotide and amino acid sequences, which were compared with the GenBank sequences, confirm the Rhabdoviridae family viruses occurrence. These given sequences demonstrated a certain analogy with a Strawberry crinkle virus assigned to the genus of Cytorhabdoviruses. The analyses proved a different reciprocal homology among the nucleotide sequences of the individual isolates, and in all likelihood an occurrence of two up to now unknown viruses in the Ginkgo biloba samples was proved for the first time. A definite categorization will be dependent on an acquisition and comparison of other sequences from the isolates genome and also on certain biological characteristics observation.
Klíčová slova: Jinan dvoulaločný (Ginkgo biloba); nukleotidové sekvence; rostlinné rhabdoviry; Strawberry crinkle virus; virová infekce; Ginkgo biloba; nucleotide sequences; plant rhabdoviruses; Strawberry crinkle virus; viral infection
Citace: PECKOVÁ, Lucie. Okrasné parkové dřeviny zásobárnou virů čeledi Rhabdoviridae. České Budějovice, 2012. diplomová práce (Mgr.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Pedagogická fakulta

Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/15466

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-112088


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce