Institute of Animal Physiology and Genetics

Latest additions:
2019-12-09
08:15
Examination of the Spatial Structure of Pigs' Melanoma in Tissue Sections Based on Histology and Mass Spectrometry
Anýz, J. ; Vysloužilová, L. ; Horák, Vratislav ; Štěpánková, O. ; Vaculovič, T. ; Adam, V.
We examine the spatial structure of the melanoma in tissue sections. The pigs melanoma was examined in 10 tissue samples obtained from animals of age between 4 and 22 weeks. The tissue sections were measured by light microscopy and Laser Ablation Ion Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry to obtain spatial metal (Cu, Zn) distribution. The exploratory analysis of the tissue sections indicates there is clearly a pattern in the spatial structure. Different projections of the spatial structure of the melanoma are obtained by the different measurement methods. The spectral clustering on the data was utilized to describe the structure in the data. According to the clustering results, there are distinct clusters of observations in the histological data. The spatial elemental distribution of the metals Cu and Zn cannot be clustered -the data form one compact cluster. The clustering of the histological images produces clusters which are related to the annotation of the biological samples in broader terms -the differences between fibrous and cancerous tissue.

Detailed record
2019-02-26
15:24
Phenotypic Analyses of the HD Transgenic Minipig Model (A11609)
Ellederová, Zdeňka
The transgenic Huntington's disease minipigs (TgHD) express N‐terminal part of human mutated huntingtin (124Q) under the control of human huntingtin promoter. The founder animal, born in 2009, gave birth to four subsequent generations with an equal contribution of wild‐type (WT) and transgenic (TgHD) piglets in all litters. The model is being used for preclinical huntingtin lowering studies. Here we take different non-invasive and invasive approaches, some of which are unique for large animal models, to study the phenotype development comparing WT and TgHD siblings. We show gradual progression of the disease in these TgHD animals. Moreover, some biomarkers were identified. These markers could serve for monitoring of organism response to HD treatment to assess efficacy and safety in preclinical studies prior to human clinical trials.

Detailed record
2019-02-13
17:44
Sekvence variabilního úseku genu kódujícího aspartyl-tRNA syntázu vhodná pro klasifikaci a fylogenetické analýzy zástupců určitých rodů náležejících do řádu Lactobacillales
Killer, Jiří ; Mrázek, Jakub
Byl připraven a ověřen marker (aspartyl-tRNA syntáza) pro klasifikaci a fylogenetické analýzy zástupců rodů náležejících do řádu Lactobacillales. Umožňuje rychlé a přesné druhové stanovení mléčných bakterií. Předkládanou metodiku lze využít v základním výzkumu při klasifikaci a fylogenetických analýzách vybraných rodů bakterií mléčného kvašení. Především je určen pro rychlé analýzy v provozech mléčného průmyslu. \n

Detailed record
2019-02-13
17:44
Kvantifikace bakteriofága 936 v mléčných produktech metodou kvantitativní polymerázové řetězové reakce
Olša Fliegerová, Kateřina ; Mrázek, Jakub ; Štrosová, Lenka ; Němečková, I. ; Kopečný, Jan
Virulentní bakteriofágy stále představují vážnou hrozbu pro průmyslové fermentace mléka, a to i při časté dezinfekci a sterilizaci všech zařízení v mlékárenských provozech. Proto je spolehlivá metoda monitorování přítomnosti bakteriofágů, ale zejména jejich kvantifikace, nutnou součástí boje proti virové infekci. Tato práce popisuje kvantifikaci laktokokového bakteriofága 936 pomocí polymerázové řetězové reakce (qPCR) a aplikaci tohoto postupu na vzorky provozních zákysů a syrovátek. Metoda je založena na amplifikaci a fluorescenční detekci nárůstu počtu kopií úseku genu pro hlavní strukturální protein fága 936 a je tudíž nezávislá na kultivaci bakteriofága. Metoda qPCR je rychlá, citlivá, umožňuje kvantifikaci bakteriofága 936 v malých objemech průmyslových vzorků a v kterékoliv fázi fermentačního procesu.\n

Detailed record
2018-04-06
16:29
Výsledky testování nanomateriálů pro ošetření kožných ran
Juhás, Štefan ; Juhásová, Jana
Pomocí experimentů na miniprasatech jsme testovali hojení čerstvé rány ošetřené pomocí různých nanovlákenných materiálu a porovnávali se standardním ošetřením. Z předem definovaných ran se v pravidelných intervalech odebírali vzorky na histologickou analýzu, mikrobiologii, provádělo se měření ran a fotodokumentace. Z miniprasat se taky odebírala krev pro stanovení prozánětlivých cytokinů.

Detailed record
2018-04-06
16:29
Výsledky in vivo testů nanomateriálů na minipraseti
Juhás, Štefan ; Juhásová, Jana
Pomocí in vivo experimentů jsme testovali hojení čerstvé rány ošetřené pomocí nanovlákenného krytu. Z předem definovaných ran se v pravidelných intervalech odebírali vzorky na histologickou analýzu, provádělo se měření ran a fotodokumentace.

Detailed record
2018-04-06
16:29
Výzkum v oboru oftalmologie, implantologie a buněčné biologie
Ardan, Taras
Výzkum v oblasti reakce organismu a specifických buněk oka na inovativní implantát vyvinutý objednatelem.

Detailed record
2018-04-06
16:29
Realizace pokusů na laboratorních zvířatech
Juhás, Štefan ; Juhásová, Jana
Návrh způsobu ověření funkčnosti inovativních náhrad, řešení tohoto návrhu včetně implantací a souvisejících aktivit.

Detailed record
2018-04-06
16:29
Protokol o vedení implantací včetně výsledků
Juhás, Štefan ; Juhásová, Jana
Ověření a analýza funkčnosti implantačního materiálu a designu v reálném prostředí.

Detailed record
2018-04-06
16:29
Výsledky kurzu in vivo IBD na minipraseti
Juhás, Štefan ; Juhásová, Jana
Testování inovativních postupů léčby IBD na miniaturních prasatech.

Detailed record