|
|
Molecular mechanisms and functions of 14-3-3 proteins
Šilhán, Jan ; Obšil, Tomáš (advisor) ; Krůšek, Jan (referee) ; Schneider, Bohdan (referee)
Závěr Hlavním cílem této doktorské práce bylo objasnění molekulárních mechanismů funkce 14-3-3 proteinů a vlivu na proteiny FOXO4 a tyrosinhydroxylasu. V první časti této práce (publikace I) byla potvrzena předložená hypotéza polohy Cterminálního konce molekuly 14-3-3. Bylo ukázáno, že v nepřítomnosti ligandu se Cterminální konec nachází ve vazebném místě a brání tak vstupu ligandů. Po vazbě fosforylovaných ligandů, dochází k velmi silné vazbě a vytěsnění C-terminálního konce 14-3- 3 proteinu z vazebného místa. Tyto výsledky jsou v souladu s původními pracemi, které navrhly důležitost tohoto segmentu jako inhibitoru nepatřičných ligandů. Druhá část této doktorské práce poskytuje rozsáhlý popis vlivu 14-3-3 proteinů na transkripční faktory FOXO4. S použitím stacionární a časově-rozlišené fluorescence byla studována interakce 14-3-3 proteinu s fosforylovaným transkripčním faktorem FOXO4. Navázání 14-3-3 proteinu způsobuje rozpad komplexu FOXO4:DNA. Tato část práce charakterizuje interakci 14-3-3 proteinu s DNA-vazebnou doménou FOXO4. Výsledky neprokázaly výrazné konformační změny v rámci DNA-vazebné domény. Spíše dochází ke sterickému bránění vazby DNA (publikace II). Ve třetí části se práce zabývá studiem interakcí 14-3-3 s fosforylovaným ligandem odvozeným od C-konce enzymu serotonin N-acetyltransferasa...
|
|
| |
|
|
Design of docking station for mobile robot
Obšil, Tomáš ; Houfek, Martin (referee) ; Krejsa, Jiří (advisor)
The aim of this diploma thesis is design of docking station for an autonomous mobile robot Breach. The task of docking station is to connect this robotic device to power supply without human intervention in order to charge its batteries. The theoretical part of diploma thesis contains research study about autonomous charging of robots. After that it is assessed suitability of using different types of docking stations and it was chosen optimal solution. The practice part of diploma thesis contains design of docking mechanism, which takes account of inaccurate navigation of robot with deviation of several centimeters. One part of this design deals with connector system, which is dimensioned for long-term transmission of electric current with minimal value of 20 A. At the end of diploma thesis there was created 3D model of the complete docking station including connectors for charging in program called SolidWorks.
|
|
|
The effect of peptides derived from protein transmembrane domains on membranes
Olšinová, Marie ; Cebecauer, Marek (advisor) ; Obšil, Tomáš (referee) ; Vácha, Robert (referee)
Rich structure of cell membranes raises broad number of questions regarding the mechanisms driving and regulating processes taking place on membranes. The thesis presents four articles investigating organization of lipid membranes and peptide-lipid interactions. The experiments were performed on model lipid membranes. These simplified systems that partially mimic cell membranes enable to study protein-lipid interactions at the molecular level and membrane physico-chemical properties in a controlled way. Advanced fluorescence techniques such as FCS, TDFS, FLIM and anisotropy were used for the system characterization. First publication describes newly designed fluorescence dyes based on boron dipyrromethene structure, the so- called molecular rotors, which are reported to be viscosity-sensitive probes. Detailed analysis of fluorescence lifetime of excited state of the molecular rotors inserted into lipid membranes showed diverse incorporation of dyes into membranes and their reorientation in membranes of different rigidity. The second part investigates existence of lipid nanodomains in membranes caused by the presence of a cross-linker. Even though standard fluorescence microscopy techniques do not allow direct visualization of the nanodomains, we were able to detect these structures by employment of...
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
guest ::
