|
|
High-throughput analysis of uridine insertion and deletion RNA editing in \kur{Perkinsela}
DAVID, Vojtěch
This thesis is a follow-up of my Bachelor thesis about the mitochondrial genome of kinetoplastid protist Perkinsela sp. This work introduces a novel approach in high-throughput analysis method of uridine insertion and deletion RNA editing, describes its background and proposes its further development. Its effect on the interpretation of U-indel editing, both in Perkinsela and in general, is demonstrated via attached manuscript which also introduces other biologically relevant aspects of Perkinsela mitochondrion.
|
|
|
Assessment of vulnerability of water reservoirs to sediment loads and eutrophication caused by soil erosion
Krása, J. ; Rosendorf, P. ; Hejzlar, Josef ; Borovec, Jakub ; Dostál, T. ; David, V. ; Ansorge, L. ; Duras, J. ; Janotová, B. ; Bauer, M. ; Devátý, J. ; Strouhal, L. ; Vrána, K. ; Fiala, D.
This methodology has the following aims: Allow any investigator to evaluate the erosion and transport of sediment phosphorus in large river basins. Allow investigators to estimate the importance of erosion for the eutrophication of the target reservoir. Allow investigators to estimate the importance of other sources of phosphorus in the watershed. Allow investigators to estimate the behavior of the other tanks in the current state of phosphorus loads from the watershed. The methodology is focused on solutions in large river basins.
|
|
|
Assembly and annotation of a mitochondrial genome of kinetoplastid protist \kur{Perkinsela}.
DAVID, Vojtěch
This thesis is based on a collaborative project between Laboratory of Molecular Biology of Protists led by Prof. Julius Lukeš and the laboratory of John Archibald (Department of Biochemistry & Molecular Biology, Dalhousie University, Canada). My contribution to the project, as the name of the thesis suggests is to process DNA and RNA sequencing data from Neoparamoeba pemaquidensis isolate that correspond to the mitochondrion of Perkinsela, also called Ichthyobodo-related organism (IRO). The main aim is to characterize mitochondrial gene content and to attempt to understand the mechanism of U-insertion/deletion RNA editing in Perkinsela and its evolution.
|
|
|
Vodohospodářská revitalizace a ochrana před povodněmi
Ekologické služby, s.r.o., Hořovice ; Vrána, Karel ; Uhlířová, Kateřina ; Nováková, Hana ; Matoušek, Václav ; Koudelka, Petr ; Dostál, Tomáš ; David, Václav ; Hošek, Jan
Projekt řeší problematiku provádění protipovodňové ochrany prostřednictvím komplexní vodohospodářské revitalizace území. V roce 2005 se řešitelský kolektiv soustředil na řešení následujících hlavních problémových okruhů: výběr experimentálních povodí, podrobný průzkum vybraných experimentálních povodí, výběr vhodného matematického nástroje pro hodnocení srážko-odtokových vztahů v povodí, výběr vhodného matematického nástroje pro popis proudění v toku a nivě, příprava GIS nástrojů pro vybrané matematické modely, posouzení vlivu revitalizace na průtokové poměry v toku a údolní nivě, sestavení katalogu retenčních prvků v povodí, poznatky ze zahraniční exkurze na realizované revitalizační stavby, dokončení publikace Vodohospodářské revitalizace a předání do tisku a zpracování scénáře pro instruktážní film.
|
|
|
Vodohospodářská revitalizace a ochrana před povodněmi
Ekologické služby, s.r.o., Hořovice ; Bernášková, Milada ; Just, Tomáš ; Dostál, Tomáš ; Krása, Josef ; Vrána, Karel ; David, Václav ; Matoušek, Václav ; Filippi, Renata ; Hošek, Jan
Projekt řeší problematiku provádění protipovodňové ochrany prostřednictvím komplexní vodohospodářské revitalizace území. Vodohospodářskými revitalizacemi se rozumějí opatření ve vodních tocích a jejich nivách, plně nebo z části odstraňující nepříznivé změny způsobené dřívějšími technicky pojatými vodohospodářskými úpravami. Projekt je řešen za pomoci literární rešerše, dálkového průzkumu země, geografických informačních systémů, srážkoodtokových modelů a katalogu retenčních prvků v krajině.
|
guest ::
RSS feed.