|
| |
|
|
Characterization of subunit A of the Eukaryotic translation initiation factor 3 in Arabidopsis thaliana
Raabe, Karel ; Michailidis, Christos (vedoucí práce) ; Retzer, Katarzyna (oponent)
U rostlin hraje regulace translace důležitou roli během progamické faze, oplození a vývoje semene. Regulace syntézy proteinů je soustředěna převážně v iniciační fázi translace, kde je největším a nejsložitějším iniciačním faktorem Eukaryotický translační iniciační faktor 3 (eIF3), který se skládá z 12 nestejných podjednotek. Mutace jednotlivých podjednotek v rostlinách způsobily defekty v různých fázích růstu a vývoje rostliny v závislosti na dané mutované podjednotce. Charakterizace některých podjednotek rostlinného eIF3 komplexu však doposud nebyla provedena. Předmětem této práce bude funkční charakterizace podjednotky A převážně v modelové rostlině Arabidopsis thaliana. V této práci jsme popsali vysoce shodnou homologii a doménovou organizaci proteinů podjednotky eIF3A mezi rostlinnými a nerostlinnými druhy eukaryotických organismů, která má však svá rostlinná specifika. Dále jsme popsali, že gen AteIF3A je transkribován v rychle se dělících pletivech, jeho proteinový produkt je lokalizován v cytoplasmě a v okolí jádra vegetativní buňky pylu a pozorovali jsme zvýšenou frekvenci defektu pylových zrn a defektu v utváření semen v rostlinách s T-DNA inzercí v genu AteIF3A. Také jsme vytvořili stabilní transgenní linie rostliny Nicotiana tabacum s heterologní expresí AteIF3A proteinu z Arabidopsis.
|
|
|
Characterization of eukaryotic translation initiation factor 3 subunits (eIF3) in A. thaliana male gametophyte
Linhart, Filip ; Hafidh, Said (vedoucí práce) ; Retzer, Katarzyna (oponent)
Od RNA k proteinu je iniciace translace a proteosyntéza zprostředkovávaná trans-vazebnými faktory, jež rozeznávají charakteristiky mRNA, společná téměř všem eukaryotům. Komplex tvořící eukaryotický translační iniciační faktor 3 (eIF3) je vysoce konzervovaným proteinovým komplexem, který rozpoznává složky 5' čepičky mRNA za cílem iniciace translace. eIF3 se skládá z devíti podjednotek, z nich tři mají dvě izoformy: eIF3A, eIF2B1, eIF3B2, eIF3C1, eIF3C2, eIF3D, eIF3E, eIF3F, eIF3G1, eIF3G2, eIF3H a eIF3K. Tato práce se zabývá funkční charakterizací, expresí a subcelulární lokalizací eIF3B1, eIF3B2 a eIF3E v samčím gametofytu Arabidopsis thaliana a interakcí eIF3E s komplexem Constitutive photomorphogenesis 9 (COP9) ve funkci regulačního komplexu posttranslační kontroly eIF3E. Ukazujeme, že ztráta funkce eif3b1 či eif3b2 se neprojevuje gametofytickou letalitou a že tyto dva proteiny se zřejmě funkčně doplňují, zatímco mutace eif3e má za důsledek letalitu samčího gametofytu. Pouze eif3b1 projevuje defekty následně po oplodnění, během vývoje semene. Studie genové exprese, užívající veřejně dostupná data o expresi a promotorové aktivitě prokazují vysokou úroveň exprese podjednotek eIF3 v zónách s intenzivním buněčným dělením, tedy listového primodia, kořenového meristému a elongační zóny, taktéž jako ve...
|
|
|
Úloha malých nekódujících RNA v regulaci generativního vývoje rostlin
Hromadová, Michaela ; Honys, David (vedoucí práce) ; Rothová, Olga (oponent)
Malé RNA (sRNA) jsou zpravidla definovány jako 21-24 nukleotidů dlouhé molekuly RNA s regulační funkcí, které spadají do kategorie nekódujících RNA. Obvykle vznikají jako odpověď na přítomnost dvouvláknových molekul RNA v buňkách a umožňují umlčování komplementárních sekvencí na transkripční a posttranskripční úrovni. Jejich role spočívá nejen v obraně proti cizorodým nukleovým kyselinám, ale především v regulaci vlastních genů. Typickými cílovými molekulami rostlinných sRNA jsou transponovatelné elementy či transkripční faktory podílející se na řízení přechodů mezi jednotlivými vývojovými fázemi, například na zahájení reprodukčního vývoje. Cílem této práce je shrnutí jednotlivých funkčních rolí malých RNA při regulaci generativní fáze, vzniku samičího a samčího gametofytu a způsobu ochrany před transpozicí v následujících generacích. Endogenní i exogenní sRNA jsou rostlinami hojně využívány, neboť poskytují okamžitou a přímou odpověď organismu na rychle se měnící podmínky prostředí, a nepochybně tak patří mezi klíčové faktory přispívající k jejich fenotypové plasticitě.
|
host ::
RSS.