|
|
Využití kapilární elektroforézy s UV fotometrickou a hmotnostně spektrometrickou detekcí s ionizací elektrosprejem ke studiu interakcí látek
Konášová, Renáta ; Jaklová Dytrtová, Jana (vedoucí práce) ; Mikšík, Ivan (oponent) ; Tůma, Petr (oponent)
Kapilární elektroforéza (CE) je vysoce účinná separační metoda založená na rozdílné rychlosti pohybu iontů v kapalném prostředí v elektrickém poli. Běžně se používá v analytických laboratořích a díky odlišnému principu separace slouží jako komplementární metoda k chromatografickým metodám (zejména HPLC a UHPLC). Vedle využití CE pro kvantitativní/kvalitativní analýzu lze tuto metodu také použít pro studium fyzikálně-chemických vlastností látek, např. pro stanovení aciditních konstant slabých elektrolytů či konstant stability komplexů. Tato práce se zabývá využitím CE metod s UV fotometrickou detekcí (CE-UV) pro stanovení fyzikálně chemických charakteristik látek (aciditní konstanty fungicidů a konstanty stability komplexů dibenzo-18-crown-6, benzo-18-crown-6 a 18-crown-6 etherů s ionty kovů v hydro- organických směsných rozpouštědlech) a možnostmi využití afinitní CE s hmotnostně spektrometrickou detekcí s ionizací elektrosprejem (ACE-ESI/MS) pro studium nekovalentních interakcí látek. Pro spojení ACE-ESI/MS byla testována dvě rozhraní: i) rozhraní s porézní špičkou a ii) rozhraní s nano-tokem pomocné kapaliny. Byla studována schopnost připravených CE-MS rozhraní efektivně oddělit sprejovací napětí od napětí separačního a citlivost těchto rozhraní pro studované analyty. Konstanty stability...
|
|
|
Využití vysokoúčinných separačních metod pro analýzy biologicky aktivních látek
Adamusová, Hana ; Bosáková, Zuzana (vedoucí práce) ; Jelínek, Ivan (oponent) ; Tůma, Petr (oponent)
V rámci první části disertační práce byla vypracována nová analytická metoda HPLC-MS/MS pro sledování koncentračních změn 17β-estradiolu (βE2) během kapacitace myších spermií in vitro. Kapacitace byla prováděna se třemi počátečními koncentracemi βE2 (200, 20 a 2 μg/L). Pro všechny koncentrace byl pozorován obdobný trend závislosti koncentrace nevázaného βE2 na čase kapacitace. Koncentrace βE2 se snižovala, aby dosáhla svého minima a poté se opět zvyšovala. Pozice minima se lišila pro jednotlivé testované koncentrace βE2. Experimentálně získané výsledky byly podrobeny kinetické analýze. Křivky proložené experimentálně získanými body vykazovaly autokatalytický charakter. Pro shodu mezi křivkami, získanými proložením experimentálními body, a teoreticky vypočítanými křivkami je nutné předpokládat, že prvním krokem je adsorpce βE2 na povrch spermií řízená Langmuirovou izotermou. Kinetická studie byla použita i pro studium působení fluoridů a fluorohlinitých komplexů na kapacitaci myších spermií. Bylo zjištěno, že teoreticky získané křivky vykazují velmi dobrou shodu s experimentálně získanými body, tento fakt potvrzuje mechanismus kinetiky kapacitace myších spermií. Ve druhé části této disertační práce byly vyvinuty dvě analytické metody pro chirální separaci aclidinium bromidu (AB) a tapentadolu...
|
|
|
Cloud database for soil information
Andreeva, Olga ; Nečaský, Martin (vedoucí práce) ; Tůma, Petr (oponent)
Title: Cloud database for soil information Author: Olga Andreeva Department: Department of Software Engineering Supervisor: doc. Mgr. Martin Nečaský, Ph.D., Department of Software Engi- neering Abstract: The mere presence of scientific data is not enough. Reliable storage and ease of publication critically contribute to the data's usefulness. The Africa Soil Information Service's mission is to describe and understand Africa's soil and landscape resources. To ensure its accomplishment the introduc- tion of modern information technologies is essential - they provide the necessary means to safely store, easily share and analyse the information collected from soil samples and drone imagery. In the presented work we develop a system that will tackle one part of the problem - how to store the information extracted from soil samples. The current method that is employed by scientists consists of making a record on paper by hand in one of the books in the laboratory's storage room. Such system, of course, does not allow to easily share the data, it is prone to damages (e.g. in case of _re) and leaves little room for analysis (especially using methods from machine learning, which require a large set of digital data). By contrast our system, developed in the form of a web application, stores soil information in the...
|
|
|
Využití hmotnostní spektrometrie pro analýzu biologicky aktivních a klinicky významných látek.
Štícha, Martin ; Jelínek, Ivan (vedoucí práce) ; Smrček, Stanislav (oponent) ; Tůma, Petr (oponent)
- 7 - ABSTRAKT (CZ) Předložená práce je komentovaným souborem devíti publikací dokumentujících možnosti využití hmotnostní spektrometrie v oblasti strukturní charakterizace vybraných organometalických komplexů, analýz léčiv a jejich metabolitů a monitorování významných biomarkerů metabolických poruch a onemocnění V průběhu práce na tématice disertační práce byly úspěšně realizovány následné dílčí projekty: Návrh a realizace postupu mikropreparace vybraných rheniových komplexů s aromatickými ligandy za použití tetrabutylammonium tetrachlorooxorhenátu jako výchozí látky; příprava oxorhenium(V) komplexů s 1,2-dihydroxybenzenem, 1,2,3- trihydroxybenzenem a 2,3-dihydroxynaftalenem jako ligandy a jejich strukturní charakterizace s pomocí ESI/MS, APPI-MS a LDI-MS; ESI/MS a UV/Vis studie kinetického chování komplexů vznikajících při reakci tetrabutylamonium tetrachlorooxorhenátu s pyrogallolem a katecholem jako ligandy. Zvláštní pozornost byla věnována studiu následných chemických transformací primárně vzniklých Re(V) komplexů; strukturní charakterizace vybraných komplexů ferrocenu s mědí zlatem a stříbrem technikami ESI/MS. V rámci spolupráce na grantovém projektu zaměřeném na metabolismus cholesterolu byla navržena metodologie strukturní charakterizace rozkladných produktů katalytického rozkladu hemu a...
|
|
|
Analýza lipidů novorozeneckého mázku chromatografickými metodami a hmotnostní spektrometrií
Míková, Radka ; Cvačka, Josef (vedoucí práce) ; Jelínek, Ivan (oponent) ; Tůma, Petr (oponent)
(CZ) Mázek (vernix caseosa) je bílý sýrovitý krém na povrchu těla novorozence, který je produkován kůží plodu v posledním trimestru těhotenství a chrání jej před vnějšími vlivy v době před porodem a novorozence v prvních sedmi až čtrnácti dnech života. Vernix caseosa má impregnační a termoregulační vlastnosti, poskytuje ochranu proti infekcím a pomáhá dokončit vývoj kůže a gastrointestinálního traktu. Předčasně narození jedinci mají mázku jen velmi málo nebo jim úplně chybí a jsou tak špatně chráněni proti vnějším vlivům. Proto je důležité důkladně poznat složení mázku a nalézt jeho vhodnou náhradu pro předčasně narozené novorozence. Mázek obsahuje lipidy, proteiny a 80 % vody. Tato práce je zaměřena na lipidy, které tvoří přibližně 10 % vernixu. Byly zavedeny metody základního zpracování vernixu. Byla zoptimalizována izolace, separace a transesterifikace lipidů. Pro separaci byla zvolena tenkovrstvá chromatografie. Lipidy byly detekovány pomocí MALDI-TOF MS a výsledky ověřeny pomocí fragmentačních spekter a transesterifikace. Esterifikované lipidy byly měřeny pomocí plynové chromatografie s hmotnostní detekcí. Pro velké množství lipidů byla jako nejvhodnější zvolena extrakce podle Folche. Lipidový extrakt byl separován pomocí kolonové chromatografie. Optimalizované metody byly aplikovány na sérii...
|
|
|
Využití kapalinové chromatografie ve farmaceutické analýze a příprava monolitických stacionárních fází pro tenkovrstvou chromatografii
Vojta, Jiří ; Coufal, Pavel (vedoucí práce) ; Tůma, Petr (oponent) ; Jelínek, Ivan (oponent)
(CZ) V rámci první části této práce byly vyvinuty analytické metody pro stanovení nečistot účinných látek v kombinovaných léčivých přípravcích. Vývoj metod zahrnoval optimalizaci přípravy vzorků i jejich chromatografického stanovení. Metody byly zvalidovány dle platné mezinárodní směrnice International Conference on Harmonization (ICH) a byla potvrzena jejich aplikovatelnost pro stanovení nečistot ve stabilitních vzorcích léčivých přípravků. Nečistoty paracetamolu, kodein fosfát hemihydrátu a pitofenon hydrochloridu v přítomnosti čtvrté účinné látky fenpiverin bromidu byly separovány iontově párovou reverzní chromatografií s gradientovou elucí. Byla použita kolona Symmetry C18, 250 x 4,6 mm, 5 µm vyhřátá na teplotu 35 řC. Detekční metoda byla zvolena spektrofotometrická s vlnovými délkami 220 nm pro nečistotu K paracetamolu, 245 nm pro paracetamol a jeho ostatní nečistoty a 285 nm pro kodein, pitofenon a jejich nečistoty. Pro separaci a stanovení nečistot valsartanu, amlodipin besilátu a hydrochlorothiazidu byla vyvinuta UHPLC metoda v reverzním chromatografickém módu s gradientovou elucí. Byla použita kolona Zorbax Eclipse C8 RRHD, 100 x 3,0 mm, 1,8 µm vyhřátá na teplotu 30 řC. Detekční metoda byla zvolena spektrofotometrická s vlnovými délkami 225 nm pro valsartan, jeho nečistoty a nečistotu D...
|
|
|
Application of Software Components in Operating System Design
Děcký, Martin ; Tůma, Petr (vedoucí práce) ; Döbel, Björn (oponent) ; Sojka, Michal (oponent)
Tato doktorská práce popisuje primární cíl mikrojádrového multiserverového operačního systému HelenOS. Primárním cílem projektu HelenOS je vytvoření komplexní výzkumné a vývojové platformy pro doménu obecných operačních systémů, která by podporovala nejmodernější přístupy a metody (například verifikaci správnosti) a současně kladla důraz na praktickou relevanci. Text práce popisuje jaké konkrétní prostředky návrhu (založené na softwarových komponentách), implementace, vývojového procesu a verifikace, které jsou použity pro dosažení primárního cíle. Text práce dále hodnotí současný stav projektu HelenOS. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Run-time performance testing in Java
Kotrč, Jaroslav ; Horký, Vojtěch (vedoucí práce) ; Tůma, Petr (oponent)
Práce je zaměřena na relativní porovnávání výkonu jednotlivých metod. Základem je Stochastic Performance Logic, která například umožňuje vyjádřit, že běh jedné metody trvá nejvýše dvakrát déle než běh jiné metody. Tyto výsledky jsou přenositelnější než absolutní hodnoty. Standardní testy jednotek (metod) jsou rozšířeny o výkonnostní předpoklady a vyhodnoceny za skutečného běhu reálné aplikace. Produkční kód je automaticky upravován pomocí dynamicky přidávné a odebírané instrumentace. Pro instrumentaci je použit nástroj DiSL, což umožňuje hladce měřit i systémové třídy Javy. Metody jsou měřeny postupně, počet souběžně měřených metod se dynamicky mění a měřící kód je odstraněn, jakmile jsou získána potřebná data. Výsledky ukazují, že tímto způsobem lze snížit maximální okamžitý vliv měření na aplikaci oproti měření všech metod najednou. Srovnáním s nástrojem JMH se ukázalo, že vytvořený prototyp je schopen přesného měření metod běžících déle než 1 ms. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Garbage Collection in Software Performance Engineering
Libič, Peter ; Tůma, Petr (vedoucí práce) ; Murphy, John (oponent) ; Noorshams, Qais (oponent)
Název Garbage Collection in Software Performance Engineering Autor Peter Libič peter.libic@d3s.mff.cuni.cz Školitel doc. Ing. Petr Tůma, Dr. petr.tuma@d3s.mff.cuni.cz Katedra Katedra distribuovaných a spolehlivých systémů Matematicko-fyzikální fakulta Univerzita Karlova v Praze Malostranské nám. 25, 118 00 Praha 1, ČR Abstrakt Zvyšující se popularita jazyků s automatickou správou paměti dělá z vý- konnosti garbage collectorů (GC) klíčový prvek efektivního běhu aplikací. Bohužel, pro aplikační vývojáře není lehké porozumět chování GC z hlediska výkonnosti a návrháři výkonnostních modelů chování GC často ignorují. V této práci (1) vyhodnotíme podstatu režie GC s ohledem na její vliv na přesnost modelů výkonnosti. Zhodnotíme možnost modelovat GC jako black- box model a zjistíme charakteristiky programů, které ovlivňují výkon GC. Poté (2) navrhneme analytický model jednogeneračního kolektoru a sim- ulační modely jednogeneračního a dvougeneračního kolektoru. Tyto modely závisí na vlastnostech aplikací. Zhodnotíme přesnost těchto modelů a an- alyzujeme jejich citlivost na přesnost vstupů. Pomocí modelu ukážeme na rozdíly v chápání režie GC, pokud je založeno na znalosti algoritmu nebo skutečné implementaci...
|
|
|
HelenOS VFS-FUSE connector
Bouška, Zdeněk ; Děcký, Martin (vedoucí práce) ; Tůma, Petr (oponent)
Tato magisterská práce se zabývá implementací konektoru mezi FUSE ovladači souborových systémů a nativním VFS rozhraním v HelenOS. Práce nejprve popisuje možné způsoby řešení a možnosti, které přicházely v úvahu. Zvoleno bylo napojení na nízkoúrovňové vrstvě, které se prokázalo jako nejlepší. Práce dále popisuje skutečnou implementaci tohoto konektoru. Implementace byla úspěšná, a proto se práce detailně zaměřuje na toto plně funkční řešení na HelenOS operačním systému. Dané řešení mimo jiné umožňuje to, že téměř nejsou potřebné změny na obou spojovaných platformách - FUSE i Helenos VFS. Implementace konektoru ukazuje dva reálně používané FUSE souborové systémy exFAT a NTFS na operačním systému HelenOS. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
host ::
RSS.