Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 36 záznamů.  1 - 10dalšíkonec  přejít na záznam: Hledání trvalo 0.01 vteřin. 
Fluorescence excitation spectra of photosynthetic antennae
Materna, Filip ; Mančal, Tomáš (vedoucí práce) ; Alster, Jan (oponent)
Cílem této práce je poskytnout stručný přehled o přenosu energie probíhajícího ve fotosyntetických anténních systémech na příkladové anténě a pokusit se simulovat její chování. S využitím moderní literatury je popsána struktura fotosyntetických anténních systémů, jejich vlastnosti a metody používané k jejich studiu. Následně je navržen model kinetiky energetických stavů ve studovaném systému. Po teoretické části následuje analýza naměřených absorpčních a fluorescenčních excitačních spekter skutečných chlorofyl + karotenoid dimerů s využitím programu OriginPro2020 a Python3. S těmito poznatky je vytvořena simulace, která má odpovídat naměřeným hodnotám z experimentu. K výpočtu absorpce je využit balíček Quantarhei Python3. Pro FES je spektrum spočítáno řešením systému diferenciálních rovnic vycházejících z kinetického modelu a následovným dosazením naměřených dat. Z těchto spekter je následně získána účinnost přenosu energie v dimeru.
Influence of intra-molecular vibrational modes on excitation energy transfer in molecular aggregates
Herman, Daniel ; Mančal, Tomáš (vedoucí práce) ; Zamastil, Jaroslav (oponent)
Přenos energie v molekulárních agregátech je obecně obtížné popsat jednoduchým, ale účinným způsobem. Často dochází ke kompromisu mezi přesností simulovaných výsledků a úrovní pochopení odpovídajících fyzikálních procesů. Pro pochopení vývoje systému s elektronovými stupni volnosti je také nutné porozumět vlivu systému na vývoj lázně. K získání vhledu do vývoje lázně zavádíme exaktní faktorizaci elementů matice hustoty reprezentující provázaný stav lázně a systému. Této faktorizace využijeme k odvození it- erativních řídících rovnic. Iterativní popis vývoje lázně pak použijeme k odvození korigov- aného paměťového jádra s korelačními funkcemi v lokální bázi s předpokladem lineárních harmonických oscilátorů jako módů lázně. Tento přístup se pokouší vylepšit stávající poruchové řídící rovnice v režimu slabé interakce mezi systémem a lázní. K posouzení dosaženého vylepšení použijeme teorii na systémy s konečnou lázní malé velikosti. 1
Samoregulační mechanismy fotosyntetických systémů
Semerák, Matěj ; Mančal, Tomáš (vedoucí práce) ; Holá, Dana (oponent)
Fotosyntéza, pochod využívající energie dopadajících fotonů k pohonu elektrontransportního řetězce tvořícího membránový gradient pH, je v přírodě rozšířeným způsobem obživy. Intenzita slunečního záření však může překročit míru, již jsou organismy schopny svými aparáty zvládnout. Za této situace přicházejí na řadu nezbytné ochranné mechanismy, bezpečně odvádějící přebytečnou energii. Teorií o podstatě a regulaci těchto funkcí již bylo vypracováno mnoho a nové se stále objevují. Zdá se, že pozornost se soustřeďuje především na anténní komplex LHCII. Lze konstatovat, že ochranu s velkou pravděpodobností zajišťuje více mechanismů, přičemž panuje poměrně ustálený názor, že klíčovou roli v jejich spouštění hraje klesající pH. To je logické, neboť čím více fotonů přichází, tím intenzivněji probíhá transport protonů přes membránu, čili velikost ΔpH odráží rovnováhu mezi mírou spotřeby ATP a osvětlením membránového aparátu. Obecně se fenomén nazývá NPQ (nefotochemické zhášení), protože zeslabuje fluorescenci chlorofylu. Významnou úlohu zastávají patrně karotenoidy, hlavně zeaxantin, vznikající v kyselém prostředí činností violaxantin deepoxidasy; poskytuje chlorofylům energetickou past při excitačních interakcích. Dochází i ke konformačním změnám (zejm. proteinu PsbS), fosforylaci fotosystémů a dalším procesům.
Teorie elektron-fononové interakce v modelovém otevřeném kvantovém systému
Krčmář, Jindřich ; Mančal, Tomáš (vedoucí práce) ; Lipavský, Pavel (oponent)
Cílem této práce je prozkoumat projekční operátorovou metodu odvození po- hybových rovnic pro redukovanou matici hustoty a aplikovat je na modelový otevřený kvantový systém. Postupně přecházíme z kvantově mechanického modelu molekuly s jedním vibračním stupněm volnosti k příkladu otevřeného kvantového systému relevantního k teorie nelineární spektroskopie. V práci prezentujeme výsledky numerických simulací časové evoluce otevřeného kvan- tového systému provedených programem napsaným pro tento účel. Zvláště se zabýváme simulacemi řešení časově-bezkonvoluční zobecněné řídící rovnice do druhého řádu poruchového rozvoje a ukazujeme, že za jistých okolností poskytuje exaktní řešení problému. Text také obsahuje odvození rekurent- ních relací pro Franck-Condonovy faktory pro nejobecnější případ dvou kvan- tových harmonických oscilátorů v jedné prostorové dimenzi, tedy transformační matici mezi dvěma bázemi L2 (R) prostoru určenými řešeními časově nezávislé Schrödingerovy rovnice příslušné těmto oscilátorům. 1
Nelineární optická spektroskopie molekulárních komplexů
Linhart, Jan ; Mančal, Tomáš (vedoucí práce) ; Pšenčík, Jakub (oponent)
Práce se zabývá teorií nelineární spektroskopie a projevy kvantové koherentní dynamiky v nelineární spektroskopii. Poskytuje stručný přehled spektroskopických metod se zaměřením na metodu pump-probe. Dále rozví- jíme teorii nelineární odezvy, přičemž vycházíme z obecného N-wave mixing experimentu, a dospíváme ke tvaru odezvové funkce třetího řádu vyjádřené pomocí Liouvillových drah. Pro vybrané modelové systémy sledujeme koher- entní efekty, které se projevují v 2D a pump-probe spektrech, a provádíme jejich porovnání. D·raz je kladen na objasnění jev· relaxace a excitonové koherence mezi dvěma excitovanými stavy molekulárního dimeru. 1
Srovnání poruchových a neporuchových přístupů k teorii optické spektroskopie
Malý, Pavel ; Mančal, Tomáš (vedoucí práce) ; Pšenčík, Jakub (oponent)
Tato práce je zaměřena na porovnání poruchového a neporuchového výpočtu po- larizace třetího řádu ve dvou dimenzionální (2D) optické spektroskopii. Dvouh- ladinová molekula a vázaný dimer jsou zvoleny jako příklady systémů jejichž 2D spektrum je spočteno s použitím explicitních pohybových rovnic pro reduko- vanou matici hustoty a integrováním odezvových funkcí. S použitím získaných výsledků jsou tyto dva přístupy porovnány kvalitativně a kvantitativně. Hlavní nalezený rozdíl je přítomnost příspěvků vyšších řádů polarizace v neporuchově vypočteném spektru. 1

Národní úložiště šedé literatury : Nalezeno 36 záznamů.   1 - 10dalšíkonec  přejít na záznam:
Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.