|
|
Návrh Real-Time PCR testu pro detekci Aphibiocystidium ranae jako modelového druhu pro studium rhinosporidiózy
Přistoupilová, Anna ; Pačes, Jan (vedoucí práce) ; Vopálenský, Pavel (oponent)
Cílem této diplomové práce je návrh testu na druhově specifické Real-Time PCR pro detekci parazita Ampbibiocystidium ranae u žab, který slouží jako modelový druh pro studium rhinosporidiozy u člověka, způsobené Rhinosporidiem seeberi. Společné vlastnosti těchto parazitů umožňuji zkoumat rhinosporidiozu pomocí vzajemné analogie. Sekvence genu pro 18S rRNA Amphibiocystidium ranae byly porovnány se sekvencemi nejbližších příbuzných organismů nalezených v GenBank databázi nukleotidových sekvenci pomoci mnohočetného přiřazeni. Byly vyhledány úseky specifické pro Amphibiocystidium ranae a v těchto úsecích byly navrženy tři sady příměrů, z toho dvě spolu se sondou pro zvýšení specificity. Navržena assay byla ověřena oproti GenBank databázi nukleotidových sekvenci a oproti databázi SILVA, která obsahuje sekvence kódující rRNA. Primery byly otestovány na vzorcích odebraných z žab. Výsledné produkty byly ověřeny analýzou křivky tání. Výsledkem je Real-Time PCR assay, kterou lze použit ke specifické detekci přítomnosti Amphibiocystidium ranae.
|
|
|
Evolution of photoreceptors: insights from amphioxus
Vopálenský, Pavel ; Kozmik, Zbyněk (vedoucí práce) ; Černý, Robert (oponent) ; Markoš, Anton (oponent)
Souhrn Problematikaevoluceokaprov6zievoludnibiologii od samdhopod6tku.JiZve sv6 klrrize,,o pfivodu druhfi" se charles Darwin zmiiuje o oku jako o orginu ,,exfidmnl dokonalosti"a vyjadiuje obavy, zda je mofu6 vysv6tlit vznik takto dokonaldhoorg6nu ptirodnimv;fbErem.I nejjednodu55i,,proto-oko"sloZen6pouzez jedn(:pigmentovdbunkya jedn6 bunky sv6tlodivn6potiebuje pro svou funkci nesdetrf podet gent k6dujicich komponentyfototansdukdnikaskidy,pienosusignriluapigmentace. SvEtlodivndbunkylze na zildadEmorfologierozddlitdo dvou zakladnichtypt na bunkyciliirni arhabdomerick6.Rhabdomerick6svdtlodivndbuf,kytvoii nejdastEjisitnici oka bezobratllfch,zatimcocilirirni typ bundkwoff sitnici obratlovctia Zahavcri.DtleZitou rilohu v pochopenievolucesvEtlodirmfchbundkhraji opsinovdgenya Gc podjednotky,kterdjsou zodpovEdn6za absorpcifotonua prvni lrok fototransdukdnikask6dy.Pro regulaciexprese tdchto struktumichkomponentridasfiricichse biochemiclcjchprocest a pro f6dny vyvoj celdhoodniho orgrinuje zapotiebitdsn6spolupricemnohareguladnichgenri.V pnibdhu poslednichlet bylo zji5tEno,Zeurdit6tanskripdnifaktoryhrajici zisadniflohu vevfvoji oka a svEtlodivnlichbundkjsou totoZndi u evoluCndvelmi vzditenlch organismt.Jednimz nich je ranskripdnifaktorPax6,ktetyje v tomtoohledunejldpeprostudovanf,av5akukazujese, LePax6nenijedinf...
|
host ::
RSS.