|
|
Biogeneze a funkce peroxisomů u parazitických prvoků
Nguyen, Thu Duong ; Tachezy, Jan (vedoucí práce) ; Verner, Zdeněk (oponent)
Peroxisomy se nachází u velké většiny eukaryot a zřejmě pochází od společného předka všech eukaryot, neboť proteiny spojené s biogenezí peroxisomů jsou evolučně vysoce konzervované. Na rozdíl od jejich biogeneze je enzymatický obsah peroxisomů velmi rozmanitý a metabolická aktivita peroxisomů se tak může lišit i na základě buněčného typu stejného organismu. Peroxisomy jsou funkčně spjaté s mitochondriemi a tyto dvě organely se navzájem ovlivňují. Peroxisomy u jednobuněčných eukaryot jsou velmi různorodé. Například u kinetoplastidů (skupina Discoba) je charakteristická kompartmentalizace enzymů glykolýzy do peroxisomů, zvané glykosomy. U alveolátů dochází u určitých zástupců ke ztrátám peroxisomů a u anaerobních prvoků skupiny Metamonada nejsou peroxisomy přítomné. Tzv. anaerobní peroxisomy, které byly nalezeny u skupiny Archamoeba, jsou metabolicky zcela odlišné od aerobních peroxisomů. Je zřejmé, že vlastnosti těchto peroxisomů souvisí s životním stylem těchto prvoků. V této práci jsou stručně shrnuty informace ohledně biogeneze peroxisomů a jejich funkcích, dále je popsána jejich funkční souvislost s mitochondrií, a nakonec jsou shrnuty poznatky o peroxisomech u parazitických prvoků.
|
|
|
Double expression systems with respect to parasitic protozoa
Gromyko, Anastasiia ; Verner, Zdeněk (vedoucí práce) ; Kraeva, Natalia (oponent)
Infekce parazitickými prvoky nadále představují významní zdravotní riziko v rozvojových zemích a vedou ke stovkám tisíc úmrtí každý rok. Tito parazité vykazují složitý vícehostitelský životní cyklus a mají jedinečné buněčné struktury. Mnohé z jejich biologických procesů však zůstávají nedostatečně prozkoumány. Multigenová exprese je slibným přístupem k řešení této mezery ve znalostech, protože umožňuje expresi funkčních proteinových komplexů in vivo, přidání fluorescenčních proteinových značek pro vizualizaci lokalizace proteinu v buňce a studiu interakcí protein-protein. Tato bakalářská práce shrnuje současné poznatky o dostupných systémech a přístupech ke studiu klíčových modelových parazitických druhů prvoků. Klíčová slova: expresní systémy, Trypanosoma brucei, Leishmania tarentolae, Entamoeba histolytica, Giardia intestinalis, Trichomonas vaginalis, Toxoplasma gondii, Plasmodium falciparum, pET-Duet, CRISPR-Cas9
|
|
|
Pentózy jako zdroje energie Mastigamoeba balamuthi
Novotná, Monika ; Verner, Zdeněk (vedoucí práce) ; Čepička, Ivan (oponent)
Mastigamoeba balamuthi je volně žijící améba, sesterská skupina jednoho z nejrozšířenějších původců parazitárních onemocnění Entamoeba histolytica. Během svého života může M. balamuthi využívat k produkci ATP nejméně čtyři různé zdroje energie. Kromě glukózy, standardního kultivačního zdroje energie, může améba využívat pentózy xylózu a arabinózu a také aminokyselinu L-arginin. Tato práce posuzuje preferovaný zdroj energie améby na základě morfologických a fyziologických vlastností, jako je růst a velikost buněk, pohyblivost, počet jader a koncové metabolické produkty. Po vyhodnocení statisticky významných rozdílů se došlo k závěru, že glukóza se zdá být méně preferovaným zdrojem energie než pentózy. Proto bylo navrženo nahradit v kultivačním médiu M. balamuthi všeobecně používanou hexózu preferovanou xylózou.
|
|
|
Sanační způsoby řešení insolvence dlužníka
Verner, Zdeněk ; Pohl, Tomáš (vedoucí práce) ; Macková, Alena (oponent)
Sanační způsoby řešení insolvence dlužníka Před 5 lety nabyl účinnosti český insolvenční zákon. Je to proto vhodná příležitost, aby bylo provedeno zhodnocení výhod a záporů současné úpravy v této právní oblasti. Insolvenční zákon zavedl dva způsoby řešení dlužníkova úpadku, které jspu v českém právním řádu nové: reorganizace a oddlužení. Pro oba dva instituty je typický tzv. "sanační" princip, který dlužníkovi umožňuje pokračovat v aktivitě poté, co budou provedena určitá opatření Diplomová práce obsahuje 5 hlavních částí. První část poskytuje základní výklady ohledně pojmu insolvence a uvádí důvody pro zvláštní právní úpravu pro řešení úpadku dlužníků, kteří mají více věřitelů. Vyskytuje se zde též stručný popis insolvenčního řízení. Druhá část se zabývá reorganizací, což je způsob řešení úpadku, který je určen především pro velké společnosti (podnikatelé). Třetí část se zaměřuje na oddlužení, které je určeno pro ty, kteří nejsou podnikateli (nepodnikatelé) a které jim umožňuje zbavit se závazků. Oddlužení může být provedeno dvěma způsoby: buď zpeněžením majetkové podstaty, nebo plněním splátkového kalendáře. Další části se zabývají zkušenostmi se zavedením reorganizace a oddlužení a obsahují návrhy, jak by se mohla právní úprava v této oblasti vylepšit. Účelem práce bylo provést zhodnocení způsobů řešení...
|
|
|
Role mitochondrie v patogenezi.
Marková, Lenka ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Verner, Zdeněk (oponent)
Tato práce je zaměřena na dosavadní poznatky týkající se postavení mitochondrie v patogenezi vybraných onemocnění. Představuje proteiny související s mitochondriemi, jejich funkce a metabolismus, především patogenetické děje probíhající při narušení jejich integrity. Dále shrnuje možná mitochondriální poškození, jejich průběh a následky, které mohou onemocnění vyvolat nebo zhoršit jejich průběh. Práce se také věnuje závažnému nádorovému bujení, významným neurodegenerativním poruchám při Alzheimerově či Parkinsonově chorobě, syndromu Charcot-Marie-Tooth, amyotrofické laterální skleróze nebo autosomálně dominantní optické atrofii. Popisuje roli narušené mitochondriální dynamiky při diabetes mellitus 2. typu. Na závěr uvádí roli mitochondrií a jejich poškození ve vztahu k nákaze parazity Toxoplasma gondii a Trypanosoma cruzi.
|
|
|
Functional study of the SUF pathway in the cell of Monocercomonoides exilis and Paratrimastix pyriformis
Zelená, Marie ; Hampl, Vladimír (vedoucí práce) ; Verner, Zdeněk (oponent)
Syntéza železo-sirných center je nepostradatelný buněčný proces, který je závislý na složitých biosyntetických drahách. U modelových eukaryot jsou těmito drahami ISC v mitochondrii a CIA v cytosolu. Nedávná analýza genomu a transkriptomu amitochondriálního prvoka Monocercomonoides exilis prokázala, že tento organismus postrádá ISC dráhu, která byla nahrazena bakteriální SUF dráhou. Blízký volně žijící příbuzný M. exilis, Paratrimastix pyriformis, obsahuje organely příbuzné mitochondrii, přesto zde byla ISC dráha také nahrazena dráhou SUF. Získání SUF dráhy je považováno za podmínku pro následnou ztrátu mitochondrie u M. exilis, který je prvním zdokumentovaným eukaryotickým organismem zcela bez této organely. SUF dráha byla doposud předmětem mnoha studií u bakterií, avšak její role hlavního poskytovatele železo-sirných center pro eukaryotické buňky byla popsána pouze u několika případů, a to především na základě genomických dat. Tato práce se zabývá domnělou ATPázou SufC a domnělým proteinovým lešením SufB. Oba proteiny byly úspěšně izolovány v rekombinantní formě. U SufC byla naměřena ATPázová aktivita, která by zvýšená za přítomnosti SufB. Podmínky pro ATPázovou aktivity SufC byly standardizovány. Rekombinantní forma SufC byla použita k přípravě protilátky, která byla použita k lokalizaci SUF...
|
|
|
Dynamika encystace střevního prvoka Giardia intestinalis.
Vinopalová, Martina ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Verner, Zdeněk (oponent)
Giardia intestinalis je anaerobní prvok, který parazituje v tenkém střevě lidí a dalších obratlovčích hostitelů. Tento kosmopolitní parazit, který způsobuje průjmová onemocnění, se přenáší kontaminovanou vodou či potravinami ve stádiu rezistentní cysty. Proces encystace zahrnuje řadu dějů, které vedou ke kompletní přestavbě buňky do podoby infekčního stádia. Cílem této práce bylo vizualizovat dané přestavby in vivo pomocí metody enzymatického značení proteinů. Pro účely této práce byly vybrány enzymatické tagy Y-FAST a HaloTag, které umožňují sledování živých buněk za anaerobních podmínek. Byly vytvořeny konstrukty chimerických proteinů pro sledování dynamiky encystačních váčků, struktur endoplasmatického retikula, adhezivního disku a mitózy. Pomocí vytvořených konstruktů se nám úspěšně podařilo sledovat dynamiku encystačních váčků a adhezivního disku in vivo. Zároveň tato práce poskytla zcela nové molekulární nástroje pro vytvoření uceleného obrázku dynamiky buněčné přestavby parazita během encystace.
|
|
| |
|
|
Role mitochondrie v patogenezi.
Marková, Lenka ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Verner, Zdeněk (oponent)
Tato práce je zaměřena na dosavadní poznatky týkající se postavení mitochondrie v patogenezi vybraných onemocnění. Představuje proteiny související s mitochondriemi, jejich funkce a metabolismus, především patogenetické děje probíhající při narušení jejich integrity. Dále shrnuje možná mitochondriální poškození, jejich průběh a následky, které mohou onemocnění vyvolat nebo zhoršit jejich průběh. Práce se také věnuje závažnému nádorovému bujení, významným neurodegenerativním poruchám při Alzheimerově či Parkinsonově chorobě, syndromu Charcot-Marie-Tooth, amyotrofické laterální skleróze nebo autosomálně dominantní optické atrofii. Popisuje roli narušené mitochondriální dynamiky při diabetes mellitus 2. typu. Na závěr uvádí roli mitochondrií a jejich poškození ve vztahu k nákaze parazity Toxoplasma gondii a Trypanosoma cruzi.
|
|
|
Sanační způsoby řešení insolvence dlužníka
Verner, Zdeněk ; Pohl, Tomáš (vedoucí práce) ; Macková, Alena (oponent)
Sanační způsoby řešení insolvence dlužníka Před 5 lety nabyl účinnosti český insolvenční zákon. Je to proto vhodná příležitost, aby bylo provedeno zhodnocení výhod a záporů současné úpravy v této právní oblasti. Insolvenční zákon zavedl dva způsoby řešení dlužníkova úpadku, které jspu v českém právním řádu nové: reorganizace a oddlužení. Pro oba dva instituty je typický tzv. "sanační" princip, který dlužníkovi umožňuje pokračovat v aktivitě poté, co budou provedena určitá opatření Diplomová práce obsahuje 5 hlavních částí. První část poskytuje základní výklady ohledně pojmu insolvence a uvádí důvody pro zvláštní právní úpravu pro řešení úpadku dlužníků, kteří mají více věřitelů. Vyskytuje se zde též stručný popis insolvenčního řízení. Druhá část se zabývá reorganizací, což je způsob řešení úpadku, který je určen především pro velké společnosti (podnikatelé). Třetí část se zaměřuje na oddlužení, které je určeno pro ty, kteří nejsou podnikateli (nepodnikatelé) a které jim umožňuje zbavit se závazků. Oddlužení může být provedeno dvěma způsoby: buď zpeněžením majetkové podstaty, nebo plněním splátkového kalendáře. Další části se zabývají zkušenostmi se zavedením reorganizace a oddlužení a obsahují návrhy, jak by se mohla právní úprava v této oblasti vylepšit. Účelem práce bylo provést zhodnocení způsobů řešení...
|
host ::
RSS.