|
|
Vztah proteinu SIVA a signálních drah Hedgehog/GLI a mTOR ke vzniku a progresi nemalobuněčného karcinomu plic.
Vachtenheim, Jiří ; Lischke, Robert (vedoucí práce) ; Zemanová, Milada (oponent) ; Vodička, Josef (oponent)
Nemalobuněčný karcinom plic patří v celosvětovém měřítku mezi nejčetnější zhoubná onemocnění vůbec. I přes veškerý pokrok v poznání o jeho etiopatogenezi či vývoji cílené protinádorové terapie, základní výzkum v oblasti tohoto onemocnění a jeho efektivnější léčba představuje nadále výzvu. Signální dráha Hedgehog se v případě své nepřiměřené aktivace podílí onkogenním vlivem na rozvoji nemalobuněčného karcinomu plic. P53 je známý tumor supresorový gen fungující jako bariéra proti vzniku nádorů. Tento jeho účinek je dán především transkripční aktivací různých proapoptotických genů, z nichž jeden je gen kódující protein SIVA-1. Nedávno však bylo překvapivě zjištěno, že SIVA-1 má u nemalobuněčného karcinomu plic na myším modelu nádoru naopak proonkogenní funkci. Cílem této práce bylo více objasnit význam signální dráhy Hedghog a proteinu SIVA-1 u lidského nemalobuněčného karcinomu plic a případně objasnit jejich možný vzájemný vztah při vzniku a progresi nemalobuněčného karcinomu plic u člověka. Na vybraných nádorových buněčných liniích lidského nemalobuněčného karcinomu plic byla ověřena exprese jednotlivých komponent signální dráhy Hedgehog. Ve vzorcích získaných od 39 pacientů operovaných pro nemalobuněčný karcinom plic a ve vybraných buněčných liniích tohoto nádoru byla potvrzena exprese proteinu...
|
|
|
Function of SWI/SNF chromatin-remodeling complex in tumor initiation and progression of melanoma cells
Ondrušová, Ľubica ; Vachtenheim, Jiří (vedoucí práce) ; Goetz, Petr (oponent) ; Hejnar, Jiří (oponent)
Čoraz častejšie je vznik nádorových ochorení spájaný so zmenami chromatínovej remodelácie. SWI/SNF chromatín-remodelujúce komplexy sa podieľajú na regulácii génovej expresie zmenou chromatínovej štruktúry a v závislosti na kontexte, môžu vystupovať ako transkripčné aktivátory alebo represory. Energiu pre remodeláciu poskytuje ATPázová podjednotka, ktorou môže byť buď proteín Brm (Brahma) alebo Brg1 (Brahma related-gene 1). Malígny melanóm je agresívny druh rakoviny, ktorý sa vyznačuje vysokou rezistenciou k súčasnej terapii. Kľúčové postavenie v biológii melanómu má transkripčný faktor MITF (microphthalmia-associated transcription factor), ktorý stojí v centre transkripčnej regulácie od embryonálneho vývoja normálnych melanocytov, ich diferenciácie, udržania identity a prežívania nielen normálnych, ale aj nádorových melanocytov. V našej práci sme zistili, že aktívny SWI/SNF komplex je nevyhnutný pre expresiu MITF. Tento komplex je taktiež dôležitý pre expresiu niektorých cieľových génov MITF. Prežívanie melanómových buniek je absolútne závislé na funkčnom komplexe SWI/SNF a bunky si zachovávajú vysokú expresiu jednotlivých zložiek. Primárne sa v regulácii MITF uplatňujú Brg1-obsahujúce subkomplexy, ktoré môžu byť po strate expresie Brg1 funkčne kompenzované subkomplexami s Brm. V každom prípade pre...
|
|
|
Regulace genové exprese v nádorové tkáni
Kulda, Vlastimil ; Černý, Radim (vedoucí práce) ; Vachtenheim, Jiří (oponent) ; Kleibl, Zdeněk (oponent)
Deregulace genové exprese způsobená genetickými a epigenetickými změnami hraje důležitou roli v patogenezi nádorových onemocnění. Tato disertační práce je komentovaným souborem deseti publikovaných prací zabývajících se problematikou molekulární biologie nádorů, na jejichž vzniku se autor významným způsobem podílel. Všechny práce obsažené v souboru spojuje téma stanovení molekul, které se podílejí na regulaci genové exprese (mikroRNA) nebo změn na úrovni DNA, které ovlivňují expresi genů (methylace promotoru, přítomnost fúzního genu). MikroRNA jsou krátké jednovláknové RNA molekuly, které regulují genovou expresi na posttranskripční úrovni urychlením degradace mRNA nebo inhibicí translace. Jedná se o základní mechanismus s vlivem na všechny buněčné procesy včetně patogeneze různých nemocí. MikroRNA mohou působit jako onkogeny snižováním exprese tumor supresorových genů nebo naopak jako tumor supresory snižováním exprese onkogenů, ale dnes už víme, že síť mikroRNA - RNA interakcí je mnohem komplexnější. Námi publikované výsledky, které jsou součástí této práce, se týkají kolorektálního karcinomu (CRC), karcinomu prostaty, dlaždicobuněčných karcinomů hlavy a krku (HNSCC), karcinomu žaludku a nemalobuněčného karcinomu plic (NSCLC). U pacientů s CRC jsme prokázali prognostický význam miR-21. Ve tkáni...
|
|
|
Molecular mechanisms of tumor pathogenesis of Hedgehog signaling pathway in selected tumor types
Kreisingerová, Kateřina ; Vachtenheim, Jiří (vedoucí práce) ; Macůrek, Libor (oponent) ; Uldrijan, Stjepan (oponent)
Předkládaná dizertační práce se zaměřuje na roli signální cesty Hedgehog (HH) v nádorové patogenezi. Signální dráha HH je evolučně velmi konzervovaná signální dráha, která hraje zásadní roli v embryonálním vývoji. V dospělosti je její aktivita silně omezená, aktivovaná je především v kmenových a progenitorových buňkách například mozku, plic, kůže nebo prostaty. Důležitou roli hraje v udržování homeostázy tkání a v jejich regeneraci. Aberantně aktivovaná dráha HH je klíčová v progresi nádorů. Cílem předkládané práce bylo objasnit nové detaily týkající se signalizace HH dráhy. Podařilo se nám identifikovat nový cílový gen HH dráhy - anti-apoptotický protein survivin, jehož exprese je považována za významný nádorový marker spojovaný se špatnou prognózou pacientů. Prokázali jsme, že inhibitor GANT61, který blokuje koncové proteiny HH dráhy GLI1 a GLI2, snižuje hladinu survivinu v nádorových buňkách. Následně jsme GANT61 spolu s inhibitorem BCL2 proteinové rodiny obatoclaxem použili k inhibici růstu melanomových buněk. Tato kombinace se ukázala velmi efektivní v eradikaci melanomových buněk. Prokázali jsme také, že GANT61 spouští v melanomových buňkách proces apoptózy. Zjistili jsme také, že signální dráha Hedgehog je aktivovaná u velkého množství buněčných kultur odvozených od různých typů nádorů. Dále...
|
|
|
Regulace genové exprese v nádorové tkáni
Kulda, Vlastimil ; Černý, Radim (vedoucí práce) ; Vachtenheim, Jiří (oponent) ; Kleibl, Zdeněk (oponent)
Deregulace genové exprese způsobená genetickými a epigenetickými změnami hraje důležitou roli v patogenezi nádorových onemocnění. Tato disertační práce je komentovaným souborem deseti publikovaných prací zabývajících se problematikou molekulární biologie nádorů, na jejichž vzniku se autor významným způsobem podílel. Všechny práce obsažené v souboru spojuje téma stanovení molekul, které se podílejí na regulaci genové exprese (mikroRNA) nebo změn na úrovni DNA, které ovlivňují expresi genů (methylace promotoru, přítomnost fúzního genu). MikroRNA jsou krátké jednovláknové RNA molekuly, které regulují genovou expresi na posttranskripční úrovni urychlením degradace mRNA nebo inhibicí translace. Jedná se o základní mechanismus s vlivem na všechny buněčné procesy včetně patogeneze různých nemocí. MikroRNA mohou působit jako onkogeny snižováním exprese tumor supresorových genů nebo naopak jako tumor supresory snižováním exprese onkogenů, ale dnes už víme, že síť mikroRNA - RNA interakcí je mnohem komplexnější. Námi publikované výsledky, které jsou součástí této práce, se týkají kolorektálního karcinomu (CRC), karcinomu prostaty, dlaždicobuněčných karcinomů hlavy a krku (HNSCC), karcinomu žaludku a nemalobuněčného karcinomu plic (NSCLC). U pacientů s CRC jsme prokázali prognostický význam miR-21. Ve tkáni...
|
|
| |
|
|
Function of SWI/SNF chromatin-remodeling complex in tumor initiation and progression of melanoma cells
Ondrušová, Ľubica ; Vachtenheim, Jiří (vedoucí práce) ; Goetz, Petr (oponent) ; Hejnar, Jiří (oponent)
Čoraz častejšie je vznik nádorových ochorení spájaný so zmenami chromatínovej remodelácie. SWI/SNF chromatín-remodelujúce komplexy sa podieľajú na regulácii génovej expresie zmenou chromatínovej štruktúry a v závislosti na kontexte, môžu vystupovať ako transkripčné aktivátory alebo represory. Energiu pre remodeláciu poskytuje ATPázová podjednotka, ktorou môže byť buď proteín Brm (Brahma) alebo Brg1 (Brahma related-gene 1). Malígny melanóm je agresívny druh rakoviny, ktorý sa vyznačuje vysokou rezistenciou k súčasnej terapii. Kľúčové postavenie v biológii melanómu má transkripčný faktor MITF (microphthalmia-associated transcription factor), ktorý stojí v centre transkripčnej regulácie od embryonálneho vývoja normálnych melanocytov, ich diferenciácie, udržania identity a prežívania nielen normálnych, ale aj nádorových melanocytov. V našej práci sme zistili, že aktívny SWI/SNF komplex je nevyhnutný pre expresiu MITF. Tento komplex je taktiež dôležitý pre expresiu niektorých cieľových génov MITF. Prežívanie melanómových buniek je absolútne závislé na funkčnom komplexe SWI/SNF a bunky si zachovávajú vysokú expresiu jednotlivých zložiek. Primárne sa v regulácii MITF uplatňujú Brg1-obsahujúce subkomplexy, ktoré môžu byť po strate expresie Brg1 funkčne kompenzované subkomplexami s Brm. V každom prípade pre...
|
|
|
Transkripční regulace diferenciace buněk embryonálního karcinomu a maligního melanomu: Úloha proteinů p21(WAF1) a MITF
Šestáková, Blanka ; Vachtenheim, Jiří (vedoucí práce) ; Černý, Radim (oponent) ; Pavel, Stan (oponent)
V buňkách F9 (embryonální karcinom) lze indukovat pomocí kyseliny retinové a dbcAMP diferenciaci na buňky podobné parietálnímu endodermu (PE). V naší práci jsme ukázali, že hladina inhibitoru cyklin-dependentních kinas, p21 proteinu, prudce stoupá na konci této diferenciace. Klony F9 buněk stabilně exprimující exogenní p21 měly při diferenciaci zvýšenou hladinu trombomodulinu, specifického markeru PE diferenciace. Transfektovaný p21 aktivoval trombomodulinový promoter-reportér a vazebné místo pro cyklin E v molekule p21 bylo postradatelné pro tuto aktivitu. Promoterová aktivita byla inhibována kotransfekcí antisense p21 cDNA nebo p21-specifickými siRNA komplexy. p21 protein tedy positivně reguluje transkripci trombomudulinu, a to mechanismem dereprese represorové domény transkripčního koaktivátoru p300. V části buněčné populace se p21 protein během diferenciace akumuloval kromě jádra i v cytoplasmě. Tato lokalizace p21 je asociována s jeho antiapoptotickou funkcí. Souhrnně jsme tedy zjistili, že p21 protein má kromě účinků na regulaci buněčného cyklu i transkripčně aktivační a pravděpodobně antiapoptotickou úlohu při diferenciaci F9 buněk na PE. Dále jsme studovali expresi a transkripční úlohu p21 proteinu v melanomových buňkách. p21 protein byl exprimován ve většině buněčných linií v relativně vysoké...
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.