|
|
Zpřesněné stanovení stability duplexů DNA pomocí UV spektroskopie
Víšová, Ivana ; Štěpánek, Josef (vedoucí práce) ; Kočišová, Eva (oponent)
Tato práce se zabývá určováním termodynamických parametrů teplotně indukovaného rozpadu duplexů DNA. Byla provedená přesná měření UV absorpčních spekter roztoků krátkých řetězců DNA se selfkomplementární sekvencí v závislosti na teplotě a pro několik různých koncentrací. Těžištěm práce jsou návrhy a porovnání různých postupů analýzy dat s cílem nalezení nejlepšího postupu pro určování velikostí změn termodynamických potenciálů. Bylo ukázáno, že kombinace faktorové analýzy a fitu termodynamických vztahů na teplotní závislosti získaných koeficientů dovoluje určit tyto parametry z měření provedeného pouze pro jednu koncentraci vzorku a to s lepší přesností, než dosud doporučovaný postup založený na určování teplot tání pro několik koncentrací.
|
|
|
Charakterizace proteinů dráhy 2'-5' oligoadenylátů pomocí vibrační spektroskopie
Víšová, Ivana ; Kopecký, Vladimír (vedoucí práce) ; Bednárová, Lucie (oponent)
Práce se zabývá strukturní charakterizací dvou významných proteinů dráhy 2'-5' oligoadenylátů, účastnících se imunitní odpovědi organismu na virovou infekci. Studována byla ankyrinová doména myší RNasy L, C-terminální část lidské fosfodiesterázy 12 a následně kompletní lidská fosfodiesteráza 12. Proteiny byly charakterizovány pomocí Ramanovy spektroskopie, infračervené spektroskopie, elektronového cirkulárního dichroismu, dynamického rozptylu světla a jako doplňková měření byla provedena kalorimetrie a gelová elektroforéza. Pro jednotlivé proteiny byla stanovena sekundární struktura, teplotní stabilita, velikost oligomerů a obecně byla provedena jejich základní charakterizace výše zmíněnými metodami.
|
|
|
The study on interactions of functional surfaces with biological systems
Víšová, Ivana ; Lísalová, Hana (vedoucí práce) ; Hof, Martin (oponent) ; Stephanopoulos, Nicholas (oponent)
Název: Studium interakcí funkčních povrchů s biologickými systémy Author: Ivana Víšová Školící pracoviště: Fyzikální ústav AV ČR, v. v. i., Oddělení optických a biofyzikálních systémů Vedoucí práce: RNDr. Hana Vaisocherová-Lísalová, Ph.D., Fyzikální ústav AV ČR, v. v. i., Oddělení optických a biofyzikálních systémů Abstrakt: Tato práce je věnovaná studiu procesů ovlivňujících výkonnost funkčních rezistentních (antifoulingových) povlaků na bázi polymerních kartáčů a jejich interakcí s komplexními biologickými médii. Prezentovaný základní i aplikovaný výzkum se týká i) funkcionalizačních procesů ovlivňujících odolnost povlaků, ii) přizpůsobení fyzikálně- chemických vlastností antifoulingových povlaků, aby se minimalizovaly nespecifické interakce s komplexními biologickými vzorky, a iii) chování, odolnosti a funkčnosti polymerních kartáčů v různých komplexních prostředích. Studovány jsou polymerní kartáče na bázi akrylamidu a methakrylamidu s postranními hydroxylovými, karboxybetainovými a sulfobetainovými skupinami, jejichž optimalizované kopolymerní struktury vykazují velký potenciál jako laditelné antifoulingové funkcionalizovatelné platformy pro buněčný výzkum, nebo aplikace v oblasti biosenzorů. Nově vyvinuté postupy pro obnovení resistence povlaku na bázi poly(karboxybetainů) po aktivaci EDC / NHC a...
|
|
|
Charakterizace proteinů dráhy 2'-5' oligoadenylátů pomocí vibrační spektroskopie
Víšová, Ivana ; Kopecký, Vladimír (vedoucí práce) ; Bednárová, Lucie (oponent)
Práce se zabývá strukturní charakterizací dvou významných proteinů dráhy 2'-5' oligoadenylátů, účastnících se imunitní odpovědi organismu na virovou infekci. Studována byla ankyrinová doména myší RNasy L, C-terminální část lidské fosfodiesterázy 12 a následně kompletní lidská fosfodiesteráza 12. Proteiny byly charakterizovány pomocí Ramanovy spektroskopie, infračervené spektroskopie, elektronového cirkulárního dichroismu, dynamického rozptylu světla a jako doplňková měření byla provedena kalorimetrie a gelová elektroforéza. Pro jednotlivé proteiny byla stanovena sekundární struktura, teplotní stabilita, velikost oligomerů a obecně byla provedena jejich základní charakterizace výše zmíněnými metodami.
|
|
|
Zpřesněné stanovení stability duplexů DNA pomocí UV spektroskopie
Víšová, Ivana ; Štěpánek, Josef (vedoucí práce) ; Kočišová, Eva (oponent)
Tato práce se zabývá určováním termodynamických parametrů teplotně indukovaného rozpadu duplexů DNA. Byla provedená přesná měření UV absorpčních spekter roztoků krátkých řetězců DNA se selfkomplementární sekvencí v závislosti na teplotě a pro několik různých koncentrací. Těžištěm práce jsou návrhy a porovnání různých postupů analýzy dat s cílem nalezení nejlepšího postupu pro určování velikostí změn termodynamických potenciálů. Bylo ukázáno, že kombinace faktorové analýzy a fitu termodynamických vztahů na teplotní závislosti získaných koeficientů dovoluje určit tyto parametry z měření provedeného pouze pro jednu koncentraci vzorku a to s lepší přesností, než dosud doporučovaný postup založený na určování teplot tání pro několik koncentrací.
|
host ::
RSS.