|
|
Vývoj nové metody analýzy nukleotidového fondu v bakteriálních buňkách
Zborníková, Eva ; Rejman, Dominik (vedoucí práce) ; Pacáková, Věra (oponent) ; Kozlík, Petr (oponent)
(CZ) Předkládaná dizertační práce se zabývá stanovením nukleotidů v bakteriálních buňkách. Nukleotidy hrají klíčovou úlohu ve většině metabolických dějů, a proto informace o jejich zastoupení je důležitým vodítkem o vlivu interních i externích podmínek na látkovou přeměnu bakterií. Dosud publikované práce zabývající se analýzou nukleotidů a jiných intracelulárních metabolitů lze rozdělit na dvě skupiny podle používané techniky: a) práce s metabolomickým přístupem a b) práce s úzkou skupinou cílových analytů pro rutinní analýzu. V případě a) většinou autoři využívají nejmodernější techniky LC-MS/MS, v případě b) robustní UV detekci nejčastěji ve spojení s IP-LC. Cílem této práce bylo spojit oba přístupy a získat metodu pro rutinní analýzu, která by ale využívala benefitů hmotnostní detekce, jako je citlivost a selektivita, a zároveň by nevyžadovala náročné optimalizování MS/MS přechodů a odbornou obsluhu. Hlavní záměr nové HILIC-MS metody je její univerzální aplikovatelnost ve většině biologických a biochemických laboratoří.
|
|
|
Vývoj nové metody analýzy nukleotidového fondu v bakteriálních buňkách
Zborníková, Eva ; Rejman, Dominik (vedoucí práce) ; Pacáková, Věra (oponent) ; Kozlík, Petr (oponent)
(CZ) Předkládaná dizertační práce se zabývá stanovením nukleotidů v bakteriálních buňkách. Nukleotidy hrají klíčovou úlohu ve většině metabolických dějů, a proto informace o jejich zastoupení je důležitým vodítkem o vlivu interních i externích podmínek na látkovou přeměnu bakterií. Dosud publikované práce zabývající se analýzou nukleotidů a jiných intracelulárních metabolitů lze rozdělit na dvě skupiny podle používané techniky: a) práce s metabolomickým přístupem a b) práce s úzkou skupinou cílových analytů pro rutinní analýzu. V případě a) většinou autoři využívají nejmodernější techniky LC-MS/MS, v případě b) robustní UV detekci nejčastěji ve spojení s IP-LC. Cílem této práce bylo spojit oba přístupy a získat metodu pro rutinní analýzu, která by ale využívala benefitů hmotnostní detekce, jako je citlivost a selektivita, a zároveň by nevyžadovala náročné optimalizování MS/MS přechodů a odbornou obsluhu. Hlavní záměr nové HILIC-MS metody je její univerzální aplikovatelnost ve většině biologických a biochemických laboratoří.
|
|
| |
|
|
Pyrrolidine nucleotides conformationally constrained via hydrogen bonding
Pohl, Radek ; Poštová Slavětínská, Lenka ; Rejman, Dominik
Conformation of pyrroPME nucleotide analogues was studied by means of NMR at different pD values in D2O solutions. Surprisingly, two stable conformers were found at pD > 9 for both cis and trans configurations and their ratio depended on the acid-base properties of nucleobase attached to pyrrolidine ring. The results of conformational analysis suggest that the conformation of the pyrrolidine ring is locked via intramolecular hydrogen bond between negatively charged phosphonate oxygen atom and protonized pyrrolidine nitrogen.
|
|
|
Insights into the mechanism of action of bactericidal lipophosphonoxins
Panova, Natalya ; Zborníková, Eva ; Šimák, Ondřej ; Krásný, Libor ; Kolář, M. ; Látal, T. ; Seydlová, G. ; Rejman, Dominik
The advantages offered by antibiotics in the treatment of infectious diseases are endangered due to the increase in the number of antibiotic-resistant bacterial strains. This reduces the efficiency of antibiotic treatments and poses a serious health and economical problem. Currently, the need for novel antibiotics is becoming increasingly apparent. Recently, we discovered a series of compounds termed lipophosphonoxins exhibiting selective cytotoxicity towards gram-positive bacterial cells. The attempt to elucidate the mode of action of lipophosphonoxins is presented here.
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
RSS.