|
|
Online systém pro vizuální geo-lokalizaci v přírodním prostředí
Pospíšil, Miroslav ; Čadík, Martin (oponent) ; Brejcha, Jan (vedoucí práce)
Cílem této diplomové práce je vytvořit online systém, který bude fungovat jako demonstrační aplikace pro prezentaci výsledků vizuální geo-lokalizace v přírodním a horském prostředí. Systém nabídne uživateli možnost vybrat si jednu z předdefinovaných fotografií nebo nahrát vlastní fotografii výběrem souboru nebo zadáním URL adresy. Systém bude hledat pozici kamery daného obrázku na základě vizuální geo-lokalizace. Geo-lokalizace využívá horizontu hor jako klíčovou charakteristiku pro vyhledávání podobných horizontů. Křivka horizontu je extrahována z fotografie plně automatickým algoritmem, založeným na strojovém učení s učitelem a dynamickém programování. Vizuální geo-lokalizace probíhá na serveru, který využívá nový inverzní index s cachovací politikou umožňující další škálování systému. Server zpracuje detekovanou křivku horizontu a vrátí nejlepší kandidáty na výsledky, které jsou pak vizualizovány uživateli formou klasické mapy, detailního satelitního pohledu a vykreslení nalezeného panoramatu.
|
|
|
Webová aplikace pro vyhledávání panoramat
Pospíšil, Miroslav ; Čadík, Martin (oponent) ; Brejcha, Jan (vedoucí práce)
Cílem této bakalářské práce je vytvořit webový front-end, který umožňuje lokalizaci místa na fotografii v horách. Fotografie pro lokalizaci mohou být do aplikace nahrány přímo, nebo mohou být použity fotografie z webové služby Flickr. Služba Flickr je integrována v aplikaci pomocí Flickr API. Pro lokalizaci vybrané fotografie je využito horizontu hor. Pro jeho poloautomatickou detekci s asistencí uživatele je implementováno speciální uživatelské rozhraní s využitím segmentačního algoritmu GrabCut. Lokalizaci zajišťuje serverový back-end, se kterým je navrhovaná aplikace integrována. Výsledky lokalizace pro detekovaný horizont jsou webovou aplikací vizualizovány ve formě zarovnaných křivek horizontu s jejich pozicí zobrazenou pomocí Google Maps API. Výsledná, plně funkční aplikace byla testována moderovaným testem s uživateli. V tomto testování si aplikace vedla velmi dobře. I přes nedostatky, které test identifikoval, je aplikace snadno použitelná.
|
|
|
Šumový generátor
Pospíšil, Miroslav ; Kubásek, Radek (oponent) ; Fiala, Pavel (vedoucí práce)
Předmětem této bakalářské práce „Šumový generátor“ je návrh a sestrojení šumového generátoru. První část práce je zaměřena na popis náhodných signálů. V druhé části jsou obvodové realizace šumových generátorů. Ve třetí části je příklad využití šumových generátorů v mikrovlnných senzorech. A ve čtvrté části je navržený šumový generátor a provedená měření.
|
|
|
Model lineárního transpondéru
Pospíšil, Miroslav ; Ondráš, Radek (oponent) ; Baran, Ondřej (vedoucí práce)
Diplomová práce pojednává o problematice družicových transpondérů. V první části práce jsou popsány základy družicové komunikace, definice satelitních služeb, frekvenční pásma a družicové orbity. Náplň druhé části práce tvoří rozbor satelitních transpondérů. Jsou zde popsány transparentní transpondéry a transpondéry s vlastním zpracováním. V poslední části je uveden návrh transpondéru a jeho simulace v komunikačním řetězci.
|
|
|
Počítačové modelování inhibice SARS-CoV-2 proteázy
Hanák, Martin ; Barvík, Ivan (vedoucí práce) ; Pospíšil, Miroslav (oponent)
Práce se zabývá různými metodami výpočtu volné energie pomocí molekulárně-dy- namických simulací za účelem studia inhibice biologických makromolekul a identifikace možných léčiv. Konkrétně byla prozkoumána možnost využití nerovnovážných metod na základě Jarzynského rovnosti a Crooksova fluktuačního teorému. Použité metody byly otestovány na jednoduchých systémech aminokyselin a komplexu éterové koruny s draslí- kem. Následně byly zkoumané metody aplikovány na komplexy adamantánů s cyklodex- triny a především na inhibici hlavní proteázy SARS-CoV-2 Mpro. 1
|
|
|
Computational Modeling of Membrane Proteins
Šimko, Pavol ; Barvík, Ivan (vedoucí práce) ; Pospíšil, Miroslav (oponent)
Předkládaná práce se zabývá aplikací řízených molekulárně dynamických simulací na medicínsky zajímavé biomolekulární systémy. Nejprve byly otestovány metody určení profilu volné energie na modelovém systému (Ala)10. Potom jsme se zaměřili na určení profilu volné energie při vazbě ligandu do vazebného místa adenosinového A2A GPC receptoru. Dále jsme určovali profil volné energie spojený s tranzitem iontů přes modelový systém Gramicidinu A. A nakonec jsme tuto metodiku aplikovali na iontový kanál TRPM2. 1
|
|
|
Geneticky manipulované produkty z krmiv v ledvinách kuřat
POSPÍŠIL, Miroslav
Bakalářská práce podává přehled o zvládnutí detekce genově manipulovaných produktů z krmiv v ledvinách kuřat, jejichž dieta obsahovala krmiva, která prošla genovou modifikací. K tomuto pokusu byly zapotřebí dvě GM rostliny. První byla insekt rezistentní Bt-kukuřice a druhá herbicid tolerantní Roundup Ready sója. Obě rostliny byly použity jako přísada v krmných směsích pro drůbež. Detekce hledaných transgenů byla prováděna pomocí molekulárně genetických metod - PCR a elektroforézy. Na základě výsledků práce budou zhodnocena rizika zjištěná pro konzumenty.
|
|
|
Molecular simulations of organic-inorganic hybrid materials.
Novotný, Radek ; Pospíšil, Miroslav (vedoucí práce) ; Drahokoupil, Jan (oponent)
Podvojné vrstevnaté hydroxidy (LDH) jsou slibným materiálem pro použití jako nosič léčiv díky své schopnosti interkalace různých aniontů a také velmi nízké toxicitě pro lidský organismus. Atorvastatin (ATS) je lék používaný ke snížení hladiny cholesterolu v krvi a prevenci kardiovaskulárních onemocnění. Současné způsoby podávání ATS jsou poměrně málo efektivní, což vede k potřebě předepisování vysokých dávek ATS, a to může pa- cientům způsobit nepohodlí v důsledku nežádoucích vedlejších účinků léku, nejčastěji v podobě nevolnosti, zažívacích potíží nebo bolestí kloubů a svalů. Interkalace ATS do LDH by mohla usnadnit kontrolované, cílené uvolňování léku do těla pacienta, čímž by byl lék účinný i při nižší dávce, a tím by se zmírnily vedlejší účinky ATS. Molekulární simulace využívající silové pole COMPASS byly použity k posouzení tří různých modelů ATS interkalovaných do Mg2Al LDH s koncentracemi ATS 61,99 %, 73,64 % a 70,64 %, což odpovídá mezirovninné vzdálenosti vrstev LDH 3,751 nm, 3,808 nm a 3,823 nm, které byly převzaty z experimentů rentgenové difrakce. Byly zkoumány různé výchozí orien- tace ATS aniontů v mezivrstvách LDH. Nejvyšší koncentrace ATS se jevila jako nejslib- nější a vedla k nejstabilnější struktuře. Optimalizace geometrie a následné molekulárně- dynamické simulace ukázaly, že anionty...
|
|
|
2D structures based on metal phosphonates; relationships between arrangement and properties studied by molecular simulations methods
Škoda, Jakub ; Pospíšil, Miroslav (vedoucí práce) ; Čapková, Pavla (oponent) ; Praus, Petr (oponent)
Tato práce se zabývá strukturní analýzou vrstevnatých sulfofenylfosfonátů zirkonia a jejich interkalátů za pomoci metod klasických molekulárních simulací. V rámci práce byla určena vnitřní struktura plně i částečně sulfonovaných vrstev v souladu s výsledky dostupných experimentálních metod, zejména chemické analýzy, termogravimetrických měření a rentgenové difrakce. Výpočty objasnily pozici molekul vody v rovině sulfo skupin, které výrazně ovlivňují výsledný difrakční záznam. Dále bylo vyřešeno uspořádání vrstev zirkonium sulfofenylfosfonátu interkalovaných opticky aktivními molekulami na bázi dipyridylaminu a kationty sodíku, mědi a železa vzhledem k výsledkům experimentů a hodnotám potenciální energie. V případě modelů dipyridylaminu a jeho derivátů byla výsledkem částečně neuspořádaná struktura interkalovaných organických molekul v mezivrství, jež ovlivňuje celkový dipólový moment interkalátu. Z tohoto hlediska byl vybrán nitro derivát jakožto nejvhodnější materiál pro možné využití v nelineární optice. U modelů interkalovaných kationtů zaujímá sodík původní pozice vody podél rovin sulfo skupin, kdežto kationty mědi a železa jsou distribuovány v řadě uprostřed mezivrství zirkonium sulfofenylfosfonátu.
|
|
| |
host ::
RSS.