Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 2 záznamů.  Hledání trvalo 0.01 vteřin. 
3D analýza biologických vzorků pomocí elektronové mikroskopie s fokusovaným iontovým svazkem
Petrovský, Jan ; Sobola, Dinara (oponent) ; Hrubanová,, Kamila (vedoucí práce)
Porozumění trojrozměrné informaci biologických mikroskopických struktur je jednodušší a intuitivnější než setu dvojrozměrných obrázků. Cílem této diplomové práce je vytvoření 3D modelu bakterie Rubrum rhodospirillum, který umožní pozorování strukturálních změn s ohledem na celý experiment. Pro úspěšné zobrazení buněk je nezbytná fixace jejich ultrastruktury. V našem případě je použita chemická fixace s následným kontrastováním těžkými kovy a zalitím do pryskyřice. Konečnému nasnímání kvalitního datasetu pro vytvoření trojrozměrného modelu předchází optimalizace parametrů nasnímání obrazu. Důraz je kladen především na parametry použitého elektronového a iontového svazku. V práci je srovnáno několik různých nastavení mikroskopu a otestován jejich vliv na výsledný obraz. Následně je pomocí softwaru Auto Slice and View 4 nasnímáno několik datasetů a provedena segmentace celých buněk a polymerních granulí z polyhydroxybutyrátu (PHB) nacházejících se uvnitř buněk. Z takto upravených dat, byl pomocí vybraných rekonstrukčních technik vytvořen 3D model bakterií ve sledovaném objemu.
Techniky mapování genomu k referenční sekvenci
Petrovský, Jan ; Sedlář, Karel (oponent) ; Bartoň, Vojtěch (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá nástroji používanými pro mapování genomu k referenční sekvenci. V teoretické části jsou popsány aktuálně využívané sekvenační technologie, ať už první generace nebo nejnovější technologie třetí generace, přehled nástrojů používaných pro sestavování genomu de novo, používané přístupy a nástroje pro mapování k referenci, program ART a s ním související datové formáty. Praktická část sestává z vytvoření testovacího datasetu NGS dat, vytvoření metrik vhodných pro vyhodnocení kvality mapování a jejich následné použití na vybrané mapovací nástroje.

Viz též: podobná jména autorů
1 Petrovský, Jiří
1 Petrovský, Jonáš
Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.