|
|
Přechodové jevy v aerodynamice vozidel
Kroupa, Michal ; Vančura, Jan (oponent) ; Čavoj, Ondřej (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá přechodovými jevy v aerodynamice vozidel a cílem je vysvětlení a návrh mechanismů těchto jevů. První část zkoumá přechodové jevy během poryvů bočního větru. Druhá část zkoumá nestacionární rozložení povrchového tlaku kolem vozidla během míjení a předjíždění. Závěrečná část se zabývá přechodovými jevy při klopení karoserie.
|
|
|
CFD simulace poryvu bočního větru
Kroupa, Michal ; Vančura, Jan (oponent) ; Čavoj, Ondřej (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá zkoumáním nestacionárních aerodynamických jevů při průjezdu vozidla poryvem bočního větru. V první části byla pro CFD simulace vytvořena funkce popisující průběh boční složky rychlosti v čase a prostoru. V další části byl srovnán kontinuální poryv s trapézovým poryvem. Srovnání nestacionárních a kvazi-stacionárních průběhů aerodynamických silových účinků pomocí anulovaných sil, povrchového tlaku vozidla a proudového pole kolem vozidla bylo úkolem další části. V předposlední části bylo zkoumáno nestacionární chování odporové síly a na závěr byl zkoumán vliv zadní části geometrie na nestacionární jevy.
|
|
|
Posttranslační modifikace proteinů účastnících se odpovědi na poškození DNA
Kroupa, Michal ; Hodný, Zdeněk (vedoucí práce) ; Novotný, Marian (oponent)
- 4 - Abstrakt V každé buňce vznikají denně tisíce poškození DNA, z nichž nejtoxičtější jsou dvouvláknové zlomy (double-strand breaks, DSBs). Signalizace jejich výskytu a následná oprava takto narušeného chromatinu je zprostředkována mechanismem odpovědi na poškození DNA (DNA damage response, DDR), který zahrnuje akumulaci mnoha efektorových proteinů do oblasti DSBs. Akumulace těchto molekul jsou označovány jako ložiska indukovaná poškozením DNA. DSBs jsou v závislosti na přítomnosti sesterské chromatidy opravovány dvěma hlavními mechanismy: homologní a nehomologní rekombinací. Obě tyto dráhy vedou k aktivaci Checkpoint kináz (Chk1 nebo Chk2), které zahajují přestávky v buněčném cyklu a umožňují tak opravu poškozené DNA. Signalizace poškození DNA a aktivace těchto drah jsou regulovány posttranslačními modifikacemi proteinů, což jsou enzymatické reakce zahrnující především fosforylaci, ubiquitinaci a nově objevenou sumoylaci. Nedávno bylo prokázáno, že ubiquitinace poškozeného chromatinu je nutnou podmínkou pro sumoylaci nádorových supresorů 53BP1 a BRCA1. Poruchy těchto modifikací nebo mutace genů pro 53BP1 a BRCA1 vedou k toleranci poškození DNA a následnému narušení genomové integrity, s čímž souvisí vysoké riziko pro selekci buněčných klonů s nádorovým potenciálem. Současné výzkumy se zaměřují na...
|
|
|
Chromozomální poškození a kapacita opravy DNA v periferních lymfocytech jako ukazatelé karcinogeneze.
Kroupa, Michal ; Vodička, Pavel (vedoucí práce) ; Štětina, Rudolf (oponent)
V současné době je známo, že působení faktorů vnějšího i vnitřního prostředí buňky společně s genovými variantami modulují riziko rozvoje sporadických forem nádorů. Strukturní chromozomální aberace v periferních lymfocytech představují biomarker působení genotoxických karcinogenů a jsou považovány za indikátor zvýšeného rizika rozvoje nádorového bujení. Hlavní příčinou vzniku chromozomálních aberací jsou neopravené či chybně opravené dvouvláknové zlomy v molekule DNA; cytogenetickým měřením těchto alterací lze získat představu o tzv. "interindividuální variabilitě" v odpovědi na mutagen. Předpokládané deficience v kapacitě opravy DNA byly v této práci zkoumány u incidentních onkologických pacientů s nádory prsu, tlustého střeva a konečníku a u pacientů s nádory urogenitálního systému. Stanovení chromozomálního poškození bylo doplněno o analýzu vybraných genových variant genů účastnících se opravy poškozené DNA (XRCC3, rs861539; RAD54L, rs1048771). V této studii byla využita konvenční cytogenetická analýza a cytogenetická analýza založená na indukci chromozomálních aberací bleomycinem (tzv. "Challenge assay"), diskriminační analýza TaqMan pro stanovení alelických variant a statistická analýza. Výše uvedenými metodami nebyl prokázán statisticky významný rozdíl v průměrné hladině chromatidových zlomů...
|
|
|
Reform of the IMF Real empowerment of developing countries or just a gesture?
Kroupa, Michal ; Plechanovová, Běla (vedoucí práce) ; Parízek, Michal (oponent)
Mezinárodní měnový fond se v roce 2010 dočkal dlouho očekáváné reformy, která měla za cíl posílit vliv rozvojových států a rozvíjejících se ekonomik. Má práce se zaměřuje na posouzení, do jaké míry byla tato ambice reformy naplněna a zda může existovat i efektivnější cesta k posílení vlivu rozvojových a rozvíjejících se států. V první části se zaměřuji na posouzení změny vlivu států pomocí dlouhodobě velmi dobře etablované metodologie indexů politické moci s použitím Banzhafova indexu. Index však nepoužívám pouze izolovaně, ale v kontextu dalších indikátorů jako je ekonomická síla státu. Současně doplňuji analýzu dopadů reformy o dlouhodobější pohled, který zahrnuje období 20 let. Práci zakončuji alternativním návrhem reformy, který vychází z organizační struktury Mezinárodního měnového formu. Členské státy jsou reprezentované ve Sboru guvernérů a ve Výkonném sboru, který je i hlavním výkonným orgánem. Ve Výkonném výboru jsou státy zastoupeny nepřímo výkonnými řediteli. Část států své výkonné ředitele dosazuje a část je volí ve skupinách. Formování těchto skupin je nepravidelné a často odráží mocenské ambice větších států. Můj návrh je postaven na přeskupení těchto skupin, aby odrážely již existující regionální integrační bloky. Státy tak mohou využít institucionální kapacitu těchto bloků k lepšímu...
|
|
|
Chromosomal damage and shortening of telomeres in cancer patients and healthy subjects
Kroupa, Michal ; Vodička, Pavel (vedoucí práce) ; Kmoníčková, Eva (oponent) ; Rössner, Pavel (oponent)
Mezi základní procesy, které mohou ovlivnit míru chromozomálních aberací (CAs) v lymfocytech periferní krve (PBL), patří chybná segregace chromozomů v průběhu mitózy, nepřesná odpověď na poškození DNA a nadměrné zkracování délky telomer. Akumulaci CAs v PBL lze považovat za ukazatel zvýšeného rizika rozvoje maligního onemocnění. Tato disertační práce je zaměřena na studium vlivu jednonukleotidových polymorfismů v genech účastnících se mitotického checkpointu a odpovědi na poškození DNA na inter-individuální rozdíly ve výskytu CAs v PBL. Dále byl zjišťován možný vliv klinicko-patologických a molekulárních charakteristik pacientů s karcinomem tlustého střeva a konečníku (CRC) na délku telomer v nádorové tkáni, jelikož narušená funkce těchto protektivních struktur chromozomů hraje klíčovou úlohu v procesu maligní transformace. Bylo také studováno, zda lze délku telomer a frekvenci CAs považovat za ukazatel celkového přežití pacientů s nádorovým onemocněním. Hlavní poznatky této práce, založené na sedmi přiložených rukopisech, jsou: I) Zvýšený výskyt strukturních CAs a/nebo narušená regulace délky telomer v PBL mohou být považovány za rizikový faktor rozvoje nádorového onemocnění; II) Kratší délka telomer v PBL zdravých osob zvyšuje výskyt strukturních CAs; III) Binární interakce genových variant...
|
|
|
Chromosomal damage and shortening of telomeres in cancer patients and healthy subjects
Kroupa, Michal ; Vodička, Pavel (vedoucí práce) ; Kmoníčková, Eva (oponent) ; Rössner, Pavel (oponent)
Mezi základní procesy, které mohou ovlivnit míru chromozomálních aberací (CAs) v lymfocytech periferní krve (PBL), patří chybná segregace chromozomů v průběhu mitózy, nepřesná odpověď na poškození DNA a nadměrné zkracování délky telomer. Akumulaci CAs v PBL lze považovat za ukazatel zvýšeného rizika rozvoje maligního onemocnění. Tato disertační práce je zaměřena na studium vlivu jednonukleotidových polymorfismů v genech účastnících se mitotického checkpointu a odpovědi na poškození DNA na inter-individuální rozdíly ve výskytu CAs v PBL. Dále byl zjišťován možný vliv klinicko-patologických a molekulárních charakteristik pacientů s karcinomem tlustého střeva a konečníku (CRC) na délku telomer v nádorové tkáni, jelikož narušená funkce těchto protektivních struktur chromozomů hraje klíčovou úlohu v procesu maligní transformace. Bylo také studováno, zda lze délku telomer a frekvenci CAs považovat za ukazatel celkového přežití pacientů s nádorovým onemocněním. Hlavní poznatky této práce, založené na sedmi přiložených rukopisech, jsou: I) Zvýšený výskyt strukturních CAs a/nebo narušená regulace délky telomer v PBL mohou být považovány za rizikový faktor rozvoje nádorového onemocnění; II) Kratší délka telomer v PBL zdravých osob zvyšuje výskyt strukturních CAs; III) Binární interakce genových variant...
|
|
| |
|
|
Reform of the IMF Real empowerment of developing countries or just a gesture?
Kroupa, Michal ; Plechanovová, Běla (vedoucí práce) ; Parízek, Michal (oponent)
Mezinárodní měnový fond se v roce 2010 dočkal dlouho očekáváné reformy, která měla za cíl posílit vliv rozvojových států a rozvíjejících se ekonomik. Má práce se zaměřuje na posouzení, do jaké míry byla tato ambice reformy naplněna a zda může existovat i efektivnější cesta k posílení vlivu rozvojových a rozvíjejících se států. V první části se zaměřuji na posouzení změny vlivu států pomocí dlouhodobě velmi dobře etablované metodologie indexů politické moci s použitím Banzhafova indexu. Index však nepoužívám pouze izolovaně, ale v kontextu dalších indikátorů jako je ekonomická síla státu. Současně doplňuji analýzu dopadů reformy o dlouhodobější pohled, který zahrnuje období 20 let. Práci zakončuji alternativním návrhem reformy, který vychází z organizační struktury Mezinárodního měnového formu. Členské státy jsou reprezentované ve Sboru guvernérů a ve Výkonném sboru, který je i hlavním výkonným orgánem. Ve Výkonném výboru jsou státy zastoupeny nepřímo výkonnými řediteli. Část států své výkonné ředitele dosazuje a část je volí ve skupinách. Formování těchto skupin je nepravidelné a často odráží mocenské ambice větších států. Můj návrh je postaven na přeskupení těchto skupin, aby odrážely již existující regionální integrační bloky. Státy tak mohou využít institucionální kapacitu těchto bloků k lepšímu...
|
|
|
Chromozomální poškození a kapacita opravy DNA v periferních lymfocytech jako ukazatelé karcinogeneze.
Kroupa, Michal ; Vodička, Pavel (vedoucí práce) ; Štětina, Rudolf (oponent)
V současné době je známo, že působení faktorů vnějšího i vnitřního prostředí buňky společně s genovými variantami modulují riziko rozvoje sporadických forem nádorů. Strukturní chromozomální aberace v periferních lymfocytech představují biomarker působení genotoxických karcinogenů a jsou považovány za indikátor zvýšeného rizika rozvoje nádorového bujení. Hlavní příčinou vzniku chromozomálních aberací jsou neopravené či chybně opravené dvouvláknové zlomy v molekule DNA; cytogenetickým měřením těchto alterací lze získat představu o tzv. "interindividuální variabilitě" v odpovědi na mutagen. Předpokládané deficience v kapacitě opravy DNA byly v této práci zkoumány u incidentních onkologických pacientů s nádory prsu, tlustého střeva a konečníku a u pacientů s nádory urogenitálního systému. Stanovení chromozomálního poškození bylo doplněno o analýzu vybraných genových variant genů účastnících se opravy poškozené DNA (XRCC3, rs861539; RAD54L, rs1048771). V této studii byla využita konvenční cytogenetická analýza a cytogenetická analýza založená na indukci chromozomálních aberací bleomycinem (tzv. "Challenge assay"), diskriminační analýza TaqMan pro stanovení alelických variant a statistická analýza. Výše uvedenými metodami nebyl prokázán statisticky významný rozdíl v průměrné hladině chromatidových zlomů...
|
host ::
RSS.