|
|
MikroRNA v patogenezi AML
Koutová, Linda ; Korabečná, Marie (vedoucí práce) ; Zemanová, Zuzana (oponent) ; Kotyza, Jaromír (oponent)
Akutní myeloidní leukemie (AML) je značně heterogenní onemocnění, za jehož vznikem leží cytogenetické či molekulárně genetické aberace. Množství těchto změn bylo již odhaleno a jejich detekce je běžnou součástí diagnostického procesu. Mezi méně známé a pro diagnostiku zatím nepoužívané abnormality patří změny expresního profilu malých, nekódujících RNA, tzv. mikroRNA (miRNA). Tyto RNA 19-24 nukleotidů dlouhé se podílejí na regulaci exprese různých genů prostřednictvím komplementární vazby k 3'netranslatovanému konci (3'UTR) cílové messenger RNA (mRNA). Dokážou ovlivňovat klíčové procesy buňky, jako jsou diferenciace, proliferace, apoptóza. Změny v expresi různých miRNA jsou popsány u odlišných typů nádorových onemocnění. U solidních nádorů jsou obvykle detekovány z bioptických vzorků, v současnosti se věnuje velká pozornost vyšetření plazmy jako tzv. tekuté biopsie schopné podat informace o molekulárně genetických dějích v organismu. Nemalé množství studií odhalilo deregulované miRNA v kostní dřeni, plné krvi či izolovaných progenitorových buňkách (CD34+ buňky) pacientů s AML, pouze čtyři studie byly zaměřeny na analýzu plazmy. Zaměřili jsme se na vyšetření plazmy s cílem najít miRNA, jejichž hladiny se výrazně liší při záchytu AML a po prodělané chemoterapii. Z více než 750 testovaných miRNA jsme...
|
|
|
Expression and function of serpin B9 in lung carcer cells
Roušalová, Ilona ; Křepela, Evžen (vedoucí práce) ; Šedo, Aleksi (oponent) ; Kotyza, Jaromír (oponent)
SOUHRN Úvod: Granzyme B (GrB) je klíčová sekreční proapoptotická proteaza cytotoxických lymfocytů a NK buněk. Specifický proapoptotický efekt GrB v nádorových buňkách může být neutralizován zvýšenou expresí serpinuB9. Gen serpinuB9 může být transkripčně pozitivně ovlivňován účinkem některých cytokinů a estrogenem aktivovaných estrogenových receptorů- α (ERα). Cílem této práce bylo zhodnotit expresi SB9 a vyšetřit jeho aktivitu proti exogennímu aktivnímu GrB v buněčných liniích a tkáních nemalobuněčného karcinomu plic (NSCLC), dále analyzovat expresi GrB mRNA v buněčných liniích a tkáních NSCLC a objasnit roli estradiolu-17β (E2), některých interleukinů a DNA metylace v regulaci exprese SB9 v NSCLC buňkách. Apoptosom je proapoptotická signalizační platforma, která aktivuje iniciátorovou prokaspásu-9. Aktivace apoptosomu je často porušená v různých typech nádorů, avšak molekulární podstata jeho inhibice je neznámá. APIP and UACA/nucling patří mezi endogenní regulátory apoptosomového aparátu. Cílem této práce bylo zjistit, zda DNA metylace může ovlivňovat transkripční regulaci exprese genů těchto dvou proteinů v buněčných liniích a tkáních NSCLC. Metody: Následující metody byly použity v této práci: izolace a kvantifikace celkové RNA, real- time RT-PCR, Western blot analýza, enzymové analýzy, techniky...
|
|
|
Expression of apoptosome pathway regulators and activation of apoptosome apparatus in non-small cell lung carcinoma
Moravčíková, Erika ; Křepela, Evžen (vedoucí práce) ; Kovář, Jan (oponent) ; Kotyza, Jaromír (oponent)
SOUHRN Úvod: Apoptosomový aparát má zásadní význam pro generování a amplifikaci apoptotických signálů a tím pro navození apoptosy v nádorových buňkách, přičemž účinnost protinádorové chemoterapie a radioterapie do značné míry závisí na spuštění apoptosy závislé na apoptosomu. Aktivace nebo funkce apoptosomového aparátu však často selhává. Příčinou mohou být změny v expresi a/nebo získané mutace a/nebo posttranslační úpravy komponentů apoptosomu či jeho regulátorů, které hrají významnou roli v proliferaci nádorových buněk a léčebné resistenci. Proto byla tato práce zaměřena zejména na analýzu exprese faktorů, které mohou regulovat spuštění a průběh apoptosomové kaspasové kaskády a na připravenost aktivace apoptosomového aparátu v buněčných liniích a tkáních nemalobuněčného karcinomu plic. Metody: V této práci byly použity následující metody: izolace a kvantifikace celkové RNA, real-time RT-PCR, izolace bezbuněčného cytosolu a extraktů z buněk a tkání, gelová filtrace, Western blot analýza, enzymové analýzy a techniky kultivace buněčných linií. Výsledky a závěry: Vyšší predispozice nemalobuněčného karcinomu plic k apoptosomem zprostředkované apoptose, v porovnání s normální plicní tkání, je způsobena několika faktory. Za prvé, zvýšenou expresí aktivovatelných apoptosomových komponentů v nádorů, včetně Apaf-1...
|
|
|
Proteolytické enzymy vegetativních forem a spor bakterie Paenibacillus larvae
Hrabák, Jaroslav ; Martínek, Karel (vedoucí práce) ; Kotyza, Jaromír (oponent) ; Titěra, Dalibor (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Lékařská fakulta v Plzni Ústav mikrobiologie Proteolytické enzymy vegetativních forem a spor bakterie Paenibacillus larvae (Dizertační práce) Jaroslav Hrabák Plzeň, 2007 Jaroslav Hrabák Dizertační práce 1 Název: Proteolytické enzymy vegetativních forem a spor bakterie Paenibacillus larvae (Proteolytic Enzymes of Vegetative Forms and Spores of the Bacterium Paenibacillus larvae) Autor: Ing. Jaroslav Hrabák Pracoviště: Ústav mikrobiologie Lékařská fakulta v Plzni Univerzita Karlova v Praze Adresa fakulty: Husova 3, 305 06 Plzeň Adresa pracoviště: Dr. E. Beneše 13, 305 99 Plzeň Školitel: RNDr. Karel Martínek, Ph.D. Studijní program: Všeobecné lékařství Obor: Lékařská mikrobiologie Rok vydání: 2007 Místo vydání: Plzeň Počet číslovaných stran: 94 Počet obrázků: 33 Počet tabulek: 5 Počet příloh: 0 Počet citovaných pramenů: 75 Jaroslav Hrabák Dizertační práce 2 Obsah Obsah…………………………………………………………………………………….. 2 Prohlášení………………………………………………………………………………… 6 Předmluva………………………………………………………………………………... 7 Souhrn……………………………………………………………………………………. 8 Summary…………………………………………………………………………………..10 1. Úvod…………………………………………………………………………………… 12 1.1. Taxonomické zařazení bakterie Paenibacillus larvae………………………..12 1.2. Patogeneze moru včelího plodu……………………………………………....14 1.3. Fyziologie bakterie P. larvae s...
|
|
|
MikroRNA v patogenezi AML
Koutová, Linda ; Korabečná, Marie (vedoucí práce) ; Zemanová, Zuzana (oponent) ; Kotyza, Jaromír (oponent)
Akutní myeloidní leukemie (AML) je značně heterogenní onemocnění, za jehož vznikem leží cytogenetické či molekulárně genetické aberace. Množství těchto změn bylo již odhaleno a jejich detekce je běžnou součástí diagnostického procesu. Mezi méně známé a pro diagnostiku zatím nepoužívané abnormality patří změny expresního profilu malých, nekódujících RNA, tzv. mikroRNA (miRNA). Tyto RNA 19-24 nukleotidů dlouhé se podílejí na regulaci exprese různých genů prostřednictvím komplementární vazby k 3'netranslatovanému konci (3'UTR) cílové messenger RNA (mRNA). Dokážou ovlivňovat klíčové procesy buňky, jako jsou diferenciace, proliferace, apoptóza. Změny v expresi různých miRNA jsou popsány u odlišných typů nádorových onemocnění. U solidních nádorů jsou obvykle detekovány z bioptických vzorků, v současnosti se věnuje velká pozornost vyšetření plazmy jako tzv. tekuté biopsie schopné podat informace o molekulárně genetických dějích v organismu. Nemalé množství studií odhalilo deregulované miRNA v kostní dřeni, plné krvi či izolovaných progenitorových buňkách (CD34+ buňky) pacientů s AML, pouze čtyři studie byly zaměřeny na analýzu plazmy. Zaměřili jsme se na vyšetření plazmy s cílem najít miRNA, jejichž hladiny se výrazně liší při záchytu AML a po prodělané chemoterapii. Z více než 750 testovaných miRNA jsme...
|
|
|
Expression of apoptosome pathway regulators and activation of apoptosome apparatus in non-small cell lung carcinoma
Moravčíková, Erika ; Křepela, Evžen (vedoucí práce) ; Kovář, Jan (oponent) ; Kotyza, Jaromír (oponent)
SOUHRN Úvod: Apoptosomový aparát má zásadní význam pro generování a amplifikaci apoptotických signálů a tím pro navození apoptosy v nádorových buňkách, přičemž účinnost protinádorové chemoterapie a radioterapie do značné míry závisí na spuštění apoptosy závislé na apoptosomu. Aktivace nebo funkce apoptosomového aparátu však často selhává. Příčinou mohou být změny v expresi a/nebo získané mutace a/nebo posttranslační úpravy komponentů apoptosomu či jeho regulátorů, které hrají významnou roli v proliferaci nádorových buněk a léčebné resistenci. Proto byla tato práce zaměřena zejména na analýzu exprese faktorů, které mohou regulovat spuštění a průběh apoptosomové kaspasové kaskády a na připravenost aktivace apoptosomového aparátu v buněčných liniích a tkáních nemalobuněčného karcinomu plic. Metody: V této práci byly použity následující metody: izolace a kvantifikace celkové RNA, real-time RT-PCR, izolace bezbuněčného cytosolu a extraktů z buněk a tkání, gelová filtrace, Western blot analýza, enzymové analýzy a techniky kultivace buněčných linií. Výsledky a závěry: Vyšší predispozice nemalobuněčného karcinomu plic k apoptosomem zprostředkované apoptose, v porovnání s normální plicní tkání, je způsobena několika faktory. Za prvé, zvýšenou expresí aktivovatelných apoptosomových komponentů v nádorů, včetně Apaf-1...
|
|
|
Expression and function of serpin B9 in lung carcer cells
Roušalová, Ilona ; Křepela, Evžen (vedoucí práce) ; Šedo, Aleksi (oponent) ; Kotyza, Jaromír (oponent)
SOUHRN Úvod: Granzyme B (GrB) je klíčová sekreční proapoptotická proteaza cytotoxických lymfocytů a NK buněk. Specifický proapoptotický efekt GrB v nádorových buňkách může být neutralizován zvýšenou expresí serpinuB9. Gen serpinuB9 může být transkripčně pozitivně ovlivňován účinkem některých cytokinů a estrogenem aktivovaných estrogenových receptorů- α (ERα). Cílem této práce bylo zhodnotit expresi SB9 a vyšetřit jeho aktivitu proti exogennímu aktivnímu GrB v buněčných liniích a tkáních nemalobuněčného karcinomu plic (NSCLC), dále analyzovat expresi GrB mRNA v buněčných liniích a tkáních NSCLC a objasnit roli estradiolu-17β (E2), některých interleukinů a DNA metylace v regulaci exprese SB9 v NSCLC buňkách. Apoptosom je proapoptotická signalizační platforma, která aktivuje iniciátorovou prokaspásu-9. Aktivace apoptosomu je často porušená v různých typech nádorů, avšak molekulární podstata jeho inhibice je neznámá. APIP and UACA/nucling patří mezi endogenní regulátory apoptosomového aparátu. Cílem této práce bylo zjistit, zda DNA metylace může ovlivňovat transkripční regulaci exprese genů těchto dvou proteinů v buněčných liniích a tkáních NSCLC. Metody: Následující metody byly použity v této práci: izolace a kvantifikace celkové RNA, real- time RT-PCR, Western blot analýza, enzymové analýzy, techniky...
|
|
|
Proteolytické enzymy vegetativních forem a spor bakterie Paenibacillus larvae
Hrabák, Jaroslav ; Martínek, Karel (vedoucí práce) ; Kotyza, Jaromír (oponent) ; Titěra, Dalibor (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Lékařská fakulta v Plzni Ústav mikrobiologie Proteolytické enzymy vegetativních forem a spor bakterie Paenibacillus larvae (Dizertační práce) Jaroslav Hrabák Plzeň, 2007 Jaroslav Hrabák Dizertační práce 1 Název: Proteolytické enzymy vegetativních forem a spor bakterie Paenibacillus larvae (Proteolytic Enzymes of Vegetative Forms and Spores of the Bacterium Paenibacillus larvae) Autor: Ing. Jaroslav Hrabák Pracoviště: Ústav mikrobiologie Lékařská fakulta v Plzni Univerzita Karlova v Praze Adresa fakulty: Husova 3, 305 06 Plzeň Adresa pracoviště: Dr. E. Beneše 13, 305 99 Plzeň Školitel: RNDr. Karel Martínek, Ph.D. Studijní program: Všeobecné lékařství Obor: Lékařská mikrobiologie Rok vydání: 2007 Místo vydání: Plzeň Počet číslovaných stran: 94 Počet obrázků: 33 Počet tabulek: 5 Počet příloh: 0 Počet citovaných pramenů: 75 Jaroslav Hrabák Dizertační práce 2 Obsah Obsah…………………………………………………………………………………….. 2 Prohlášení………………………………………………………………………………… 6 Předmluva………………………………………………………………………………... 7 Souhrn……………………………………………………………………………………. 8 Summary…………………………………………………………………………………..10 1. Úvod…………………………………………………………………………………… 12 1.1. Taxonomické zařazení bakterie Paenibacillus larvae………………………..12 1.2. Patogeneze moru včelího plodu……………………………………………....14 1.3. Fyziologie bakterie P. larvae s...
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.