|
|
Interakce malých molekul s proteiny in silico
Kučera, Tomáš ; Korábečný, Jan (vedoucí práce) ; Jampílek, Josef (oponent) ; Holas, Ondřej (oponent)
Výpočetní metody nacházejí stále širší uplatnění v biomedicínském výzkumu včetně výzkumu toxikologického. Využívají se zejména k hledání nových molekul pro kon- krétní farmakologický cíl nebo k optimalizaci vlastností známých biologicky ak- tivních molekul. Hlavními uplatňovanými metodami jsou v těchto oblastech mo- lekulární dokování a molekulární dynamika. Metodami virtuálního screeningu byly hledány nové reaktivátory butyrylcho- linesterasy inhibované nervově paralytickými látkami, které by byly aplikovatelné v profylaxi i terapii otrav. Kombinací technik semiflexibilního a flexibilního dokování byly navrženy dvě nové látky, které by měly specificky reaktivovat inibovanou bu- tyrylcholinesterasu. Dále byl proveden virtuální screening inhibitorů cyclophilinu D, které by měly soužit jako léčiva Alzheimerovy nemoci. Na základě dostupnosti velkého množství krystalografických dat bylo rozhodnuto o využití farmokoforu pro primární screening rozsáhlé databáze malých látek. Molekulové dokování bylo využito až ve druhé fázi hledání. Zároveň byl kladen důraz na fyzikálně chemické vlastnosti molekul. Byly nalezeny čtyři látky, které by měly být inhibitory cyclophilinu D biodostupnými v centrálním...
|
|
|
Syntéza substituovaných arylguanidinů jako potenciálních léčiv VI
Korábečný, Jan ; Palát, Karel (vedoucí práce) ; Macháček, Miloš (oponent)
S Y N T É Z A S U B S T I T U O V A N Ý C H A R Y L G U A N I D I N Ů J A K O P O T E N C I Á L N Í C H L É Č I V V I . Autor: Korábečný Jan Konzultant diplomové práce: PharmDr. Karel Palát, CSc. Katedra anorganické a organické chemie, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Univerzita Karlova v Praze, Česká republika Úvod: Vysoký počet život ohrožujících mykotických infekcí sebou nese zvýšenou potřebu antifungálních léčiv a potřebu nových, širokospektrých látek. Podobně je tomu i v případě užívání antimykobakteriálních látek. Narůstající rezistence patogenních organismů nutí lidskou populaci hledat stále nová, účinná léčiva. Cíl práce: Cílem diplomové práce bylo připravit sérii substituovaných arylguanidinů, konkrétně 1-[3-chlor-4- (alkylsulfanyl)fenyl]guanidinů, které jsou testovány na antifungální a antimykobakteriální aktivitu. Metodika: 2-Chlor-1-(alkylsulfanyl)-4-nitrobenzeny byly připravovány z 3,4-dichlornitrobenzenu obvyklými metodami, buď za použití aktivní mědi22 nebo Pd2(dba)3 a Xantphosu24 jako katalyzátorů. Následná redukce nitroskupiny za vzniku aminů byla prováděna pomocí dihydrátu chloridu cínatého pod dusíkovou atmosférou. Vznik příslušných amóniových solí probíhal téměř kvantitativně reakcí s plynným suchým chlorovodíkem. Reakce vedoucí ke vzniku guanidinů probíhala s přídavkem...
|
|
|
Development of novel cholinesterase modulators
Górecki, Lukáš ; Korábečný, Jan (vedoucí práce) ; Mičuda, Stanislav (oponent) ; Roh, Jaroslav (oponent)
Název: Výzkum nových modulátorů cholinesteras Autor: Mgr. Lukáš Górecki Abstrakt Enzym acetylcholinesterasa (AChE) je klíčovým komponentem cholinergních synapsí a nervosvalových spojích. Její biologická funkce je nezbytná pro všechny zástupce živočišné říše. Z patofyziologického hlediska je zapojena do řady onemocnění jako Alzheimerova choroba (AD, z anglického Alzheimer's disease) nebo Myasthenia gravis. Význam tohoto enzymu může taktéž být prokázán tím, že se AChE stala spolehlivým terčem pro řadu insekticidů. Mimo jiné nejtoxičtější skupina chemických bojových látek (nervově paralytické látky; NPL) rovněž cílí na tento enzym. V této disertační práci jsme se zaměřili na AChE ze tří různých aspektů, jako cíl proti AD, jako insekticidy a jako enzym, který musí být reaktivován po intoxikaci organofosforovými sloučeninami. Už od dob nástupu takrinu jako prvního léčivého přípravku proti AD v roce 1993, AChE inhibitory jsou velkou skupinou látek cílící proti tomuto onemocnění. Některé z nich byly i úspěšně uvedeny do klinické praxe (např. donepezil). V dnešní době však stále neexistuje úspěšná léčba tohoto multifaktoriálního onemocnění. Moderní postupy vývoje léčiv se snaží zaměřit na více cílů najednou přípravou takzvané multi-cílové látky (MTDL, z anglického multi-targeted directed ligand). V této práci je...
|
|
|
Development of novel cholinesterase modulators
Górecki, Lukáš ; Korábečný, Jan (vedoucí práce) ; Mičuda, Stanislav (oponent) ; Roh, Jaroslav (oponent)
Název: Výzkum nových modulátorů cholinesteras Autor: Mgr. Lukáš Górecki Abstrakt Enzym acetylcholinesterasa (AChE) je klíčovým komponentem cholinergních synapsí a nervosvalových spojích. Její biologická funkce je nezbytná pro všechny zástupce živočišné říše. Z patofyziologického hlediska je zapojena do řady onemocnění jako Alzheimerova choroba (AD, z anglického Alzheimer's disease) nebo Myasthenia gravis. Význam tohoto enzymu může taktéž být prokázán tím, že se AChE stala spolehlivým terčem pro řadu insekticidů. Mimo jiné nejtoxičtější skupina chemických bojových látek (nervově paralytické látky; NPL) rovněž cílí na tento enzym. V této disertační práci jsme se zaměřili na AChE ze tří různých aspektů, jako cíl proti AD, jako insekticidy a jako enzym, který musí být reaktivován po intoxikaci organofosforovými sloučeninami. Už od dob nástupu takrinu jako prvního léčivého přípravku proti AD v roce 1993, AChE inhibitory jsou velkou skupinou látek cílící proti tomuto onemocnění. Některé z nich byly i úspěšně uvedeny do klinické praxe (např. donepezil). V dnešní době však stále neexistuje úspěšná léčba tohoto multifaktoriálního onemocnění. Moderní postupy vývoje léčiv se snaží zaměřit na více cílů najednou přípravou takzvané multi-cílové látky (MTDL, z anglického multi-targeted directed ligand). V této práci je...
|
|
|
Syntéza tetrahydroakridinových inhibitorů acetylcholinesterasy
Korábečný, Jan ; Opletalová, Veronika (vedoucí práce) ; Vinšová, Jarmila (oponent) ; Mičuda, Stanislav (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Kandidát Mgr. Jan Korábečný Školitel doc. RNDr. Veronika Opletalová, Ph-D. Název disertační práce Syntéza tetrahydroakridinových inhibitorů acetylcholinesterasy Inhibitory cholinesteras mají příznivý vliv na kognitivní, funkční i behaviorální projevy Alzheimerovy choroby (AD) a v současné době představují téměř výhradně jedinou linii léčiv používaných pro terapii tohoto onemocnění. Tři z nich jsou schváleny k užívání americkou agenturou Food and Drug Administration - donepezil, rivastigmin a galantamin. Kromě inhibitorů cholinesteras se dále používá memantin, který je představitelem N-methyl-D-aspartátových (NMDA) antagonistů. Takrin (9-amino-1,2,3,4-tetrahydroakridin) se stal prvním schváleným inhibitorem cholinesteras pro léčbu AD. Jeho nežádoucí účinky, zejména hepatotoxicita a gastrointestinální potíže, však limitují jeho širší využití. Nové deriváty takrinu jsou intenzivně zkoumány ve snaze najít látky s nižší toxicitou a postihující více patologických mechanismů účastnících se AD. V této souvislosti byl připraven v ČR 7-methoxytakrin (7-MEOTA), méně toxický derivát takrinu při zachování jeho farmakologického profilu. V rámci této práce byly syntetizovány nové deriváty takrinu a...
|
|
|
Syntéza substituovaných arylguanidinů jako potenciálních léčiv VI
Korábečný, Jan ; Palát, Karel (vedoucí práce) ; Macháček, Miloš (oponent)
S Y N T É Z A S U B S T I T U O V A N Ý C H A R Y L G U A N I D I N Ů J A K O P O T E N C I Á L N Í C H L É Č I V V I . Autor: Korábečný Jan Konzultant diplomové práce: PharmDr. Karel Palát, CSc. Katedra anorganické a organické chemie, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Univerzita Karlova v Praze, Česká republika Úvod: Vysoký počet život ohrožujících mykotických infekcí sebou nese zvýšenou potřebu antifungálních léčiv a potřebu nových, širokospektrých látek. Podobně je tomu i v případě užívání antimykobakteriálních látek. Narůstající rezistence patogenních organismů nutí lidskou populaci hledat stále nová, účinná léčiva. Cíl práce: Cílem diplomové práce bylo připravit sérii substituovaných arylguanidinů, konkrétně 1-[3-chlor-4- (alkylsulfanyl)fenyl]guanidinů, které jsou testovány na antifungální a antimykobakteriální aktivitu. Metodika: 2-Chlor-1-(alkylsulfanyl)-4-nitrobenzeny byly připravovány z 3,4-dichlornitrobenzenu obvyklými metodami, buď za použití aktivní mědi22 nebo Pd2(dba)3 a Xantphosu24 jako katalyzátorů. Následná redukce nitroskupiny za vzniku aminů byla prováděna pomocí dihydrátu chloridu cínatého pod dusíkovou atmosférou. Vznik příslušných amóniových solí probíhal téměř kvantitativně reakcí s plynným suchým chlorovodíkem. Reakce vedoucí ke vzniku guanidinů probíhala s přídavkem...
|
host ::
RSS.