|
|
Circulating tumor cells in personalized cancer therapy
Jakabová, Anna ; Kološtová, Katarína (vedoucí práce) ; Svoboda, Bohuslav (oponent) ; Tencerová, Michaela (oponent)
Souhrn Cirkulující nádorové buňky (CTC) prokázaly velký potenciál stát se prognostickým a prediktivním biomarkerem u různých typů onkologických onemocnění. CTC by mohly pomoci detekovat pacienty s vyšším rizikem kratšího celkového přežití, přežití bez progrese nebo relapsu. Mohou být také užitečné při výběru terapie, protože v současné klinické praxi je léčba volena na základě charakteristik primárního nádoru. Pravidelné sledování počtu a charakteru CTC by mohlo být indikátorem terapeutické odpovědi v reálném čase a bylo by možné jej použít k cílené léčbě. Tyto informace by bylo možné implementovat do personalizované medicíny a každého pacienta s rakovinou léčit na základě individuálního profilu. Ačkoli vzorek pacientů s CTC je snadno dostupný, jejich detekce CTC zůstává výzvou zejména kvůli jejich nízkému počtu v krevním oběhu a jejich heterogenní povaze. CTC mohou cirkulovat v krvi ve formě samostatných buněk nebo ve shlucích, které se obvykle nevyskytují tak často jako jednotlivé CTC, ale jejich metastatický potenciál je významně větší než u samostatných CTC. Kromě počtu CTC, taky molekulární charakter vykazoval dynamický vývoj a heterogenní povahu nejen mezi pacienty, ale také v rámci nádorové tkáně pacienta. Charakter primárního nádoru, CTC a metastáz není vždy konzistentní a během procesu léčby se...
|
|
|
Dlouhodobé sledování hladin ctDNA u pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem pro včasný záchyt progrese či rekurence onemocnění
Kopalová, Dominika ; Benešová, Lucie (vedoucí práce) ; Kološtová, Katarína (oponent)
Cirkulující nádorová DNA (ctDNA) v periferní krvi pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem se jeví jako velmi slibný molekulárně-genetický marker, který poskytuje několik možných využití. Hladiny ctDNA kolísají v závislosti na přítomnosti a objemu nádorové masy (tumor burden) v těle pacienta, čehož se dá využít především pro včasný záchyt možné progrese, či rekurence onemocnění a při zhodnocení radikality operace, a to vše v rámci dlouhodobého sledování pacienta po operaci (tzv. follow-up). Díky minimální invazivitě vyšetření přítomnosti ctDNA z periferní krve (tzv. tekuté biopsie) je umožněno jeho opakované provádění v relativně krátkých časových intervalech. Z důvodu velmi nízkého zastoupení ctDNA v celkové volné DNA (cfDNA) v řádech jednotek až setin procent je stěžejním faktorem optimální metodika od izolace po dostatečně citlivou technologii detekce. V této diplomové práci se zabývám optimalizací izolačního procesu a analýzou ctDNA z nádorové tkáně a plazmy vybraných pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem v souvislosti s radikalitou operace a korelací s klinickým stavem pacienta.
|
|
|
Kvantifikace nukleových kyselin pomocí TaqMan sond - možnosti a limity s ohledem na způsob odběru, stáří a kvalitu vzorku lidských tkání
Herzogová, Eva ; Daňková, Pavlína (vedoucí práce) ; Kološtová, Katarína (oponent)
Metoda real-time PCR je varianta klasické PCR, která umožňuje kontinuálně monitorovat přírůstky DNA během každého cyklu a využívá se především k analýze genové exprese. Na základě předchozích experimentů jsme se rozhodli otestovat účinek antikoagulačních činidel EDTA, heparin, citrát sodný a CPDA na expresi vybraných genů imunologického spektra, a dále doby času od odběru krve do zpracování vzorku na hladiny mRNA vybraných genů, jež jsou dány změnami genové exprese a/nebo degradací mRNA. Pro kvantifikaci mRNA sledovaných genů jsme z leukocytů periferní krve izolovali celkovou RNA a tu přepsali pomocí reverzně transkriptázové PCR do cDNA, jež sloužila jako templát pro real-time PCR. Pro sledování změn exprese způsobených vlivem jednotlivých antikoagulačních činidel byla použita krev od 10 dobrovolníků (každý dárce krve byl odebrán do 3 vakuových zkumavek s antikoagulačním činidlem EDTA, heparinem a citrátem sodným). Deset vzorků buffy coatů jsme získali od dárců krve v transfuzních vacích s antikoagulačním agens CPDA. Buňky krve ovlivněné CPDA vykazovaly statisticky významně nižší hladiny mRNA genů TLR4, MYC a CCL2 ve srovnání s buňkami krve odebrané do jednoho ze 3 typů vakuet, a naopak, hladiny mRNA IL-10 a TNFa byly v buňkách těchto vzorků signifikantně zvýšeny. Antikoagulační agens používaná v...
|
|
|
Immunogenetic studies on autoimmune diabetes mellitus
Kološtová, Katarína ; Černá, Marie (vedoucí práce) ; Mateička, František (oponent) ; Štechová, Kateřina (oponent)
Imunogenetická studie u autoimunitního diabetes mellitus. Cíle: Cílem studie bylo charakterizovat genetické pozadí u pacientů s různými typy diabetes mellitus (T1D u dětí, u dospělých T1D, LADA, T2D, MODY). Asociace diabetes s HLA-DRB1 * 04 a NFKB1 a jejich vliv na průběh onemocnění byl prokázán v dalším funkčním testování exprese mRNA. Pacienti byli rozděleni do podskupin na základě HLA, NFKB1 a NFKBIA genotypů a na základě typu onemocnění (T1DM u dětí, u dospělých T1DM a LADA). Výsledky a závěry: Dle našich zjištění můžeme konstatovat, že průběh cukrovky u T1D dospělých, dětí a T1D LADA je silně ovlivňován různým imunogenetickým pozadím, kterým se mění etiopatogeneze diabetes ve výše popsaných skupinách. Naše výsledky nabízejí nové možnosti pro testování rizika v běžné populaci a mohou být tak v budoucnu použity pro lepší diagnostiku diabetu u dospělých.
|
host ::
RSS.