|
| |
|
|
Návrh ekologického vytápění rodinného domu
Kořínek, Vladimír ; Máca, Josef (oponent) ; Jandová, Kristýna (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá návrhem ekologického vytápění pro rodinný dům. Hlavním cílem je nalézt nejvýhodnější variantu systému vytápění a ohřevu teplé vody za pomocí tepelného čerpadla v kooperaci s alternativním systémem ohřevu. Pro vybraný objekt jsou vypočteny tepelné ztráty a na základě toho je zhotoveno několik návrhů vytápění. Následně je vypočtena ekonomická návratnost zhotovených návrhů.
|
|
|
Morfologická a genetická variabilita druhu Chydorus sphaericus (Crustacea, Cladocera) v závislosti na prostředí
Matušková, Ludmila ; Sacherová, Veronika (vedoucí práce) ; Kořínek, Vladimír (oponent)
Úvod 5 ABSTRACT Genus Chydorus or more specifically the species of Chydorus sphaericus represents an extremely tolerant freshwater organism, which occurs in littoral zone of almost all kinds of aquatic habitats all over the world. It is usually associated with submerged macrophytes or substrate and also plays a key role in food webs of both vertebrate (fish) and invertebrate predators. Not only is this species in most localities the most common chydorid, but it is quite often the most common filtering cladoceran. Moreover, due to its little morphological variation most small globular representatives of the genus Chydorus were in the past all incorrectly ascribed to Chydorus sphaericus. However, thanks to more detailed studies it was suggested that so called species Chydorus sphaericus was not in fact a single taxonomic entity, but a group of several closely related species. It is clear today that for correct taxonomic desision it is necessary to combine all ecological, morphological, and genetic methods. The aim of this study was to explore genetical and morphological variation in populations of Chyrodis sphaericus from localities representing different sets of environmental factors. Four model localities were chosen: eutrophic ponds, temporary pools, mountain lakes and waterbodies affected by mining...
|
|
| |
|
| |
|
|
Role of Smarca5 (Snf2h) chromation remodeling ATPase in hematopoitic development and erythropoiesis
Kokavec, Juraj ; Stopka, Tomáš (vedoucí práce) ; Divoký, Vladimír (oponent) ; Kořínek, Vladimír (oponent)
Jaderný protein Smarca5 (Snf2h) je jeden z nejvíce konzervovaných chromatin remodelačních faktorů a molekulárních motorů u savců. ATPáza Smarca5 (a ostatní příbuzní zástupci proteinové nadrodiny SWI/SNF2) společně se svými vazebnými partnery vytváří několika podjednotkové remodelační komplexy, jež posouvají, odstraňují nebo přináší histonové oktamery na DNA za účelem regulace trankripce, replikace, oprav poškození DNA a jiných nepostradatelných buněčných funkcí. Ve své disertační práci se zabývám studiem myšího modelu delece genu Smarca5 na počátku definitivní krvetvorby. Jedinci s delecí genu Smarca5 v hematopoetické kmenové buňce (aktivní promotor Vav1) umírají během pozdního vývoje in utero v důsledku závažné anémie. Ve fetálních játrech těchto experimentálních zvířat jsme pozorovali akumulaci krvetvorných kmenových a progenitorových buněk (HSPCs) a inhibici jejich dozrávání do erythroidní a myeloidní buněčné řady. Popsané poruchy vývoje byly doprovázeny dysplastickými změnami na úrovni proerytroblastů a poruchami buněčného cyklu na přechodu z G2 do M fáze u bazofilních erytroblastů. Dále jsme pozorovali, že nedostatečná funkce Smarca5 zvyšuje hladinu tumor supresorového proteinu p53 v erythroidních progenitorech, aktivaci jeho transkripčních cílů a k postranslačním modifikacím, jež jsou...
|
|
|
Regulatory mechanisms of WNT signalling
Pospíchalová, Vendula ; Kořínek, Vladimír (vedoucí práce) ; Trka, Jan (oponent) ; Bryja, Josef (oponent)
AB S úspěšno v této si rakovin β signaliz na velm transkrip komplex vstupuje dráhu sp úrovníc P nepublik publikac o poziti studie c buňkách dvou m Hic1 in HIC1, o transkrip střevním zvýšeno V řídící vý BSTRAKT Signální drá ou embryog ignální dráz ny. β-katenin je zace Wnt/β- mi nízké ú pce cílovýc x je degrad e do jádra, pecifickými h regulován Podkladem kovaná dat ce se zaměř ivním vlivu charakterizu h střevního myších kmen vivo. Závěr o interakci p pčního repr m epitelu, c ou citlivost k Věřím, že n ývoj živočic T áha Wnt je genezi, regen ze tudíž ved e hlavním v -katenin). V úrovni neu ch genů pro dační kompl kde vytvář i, a spouští t na celkově a pro předk ta, jež maj řuje na pořa u jaderné b uje protein epitelu exp nů s cílenou rečná kapit polypeptidu resoru HIC1 což má za n k rakovinné naše výsled chů. jednou z h neraci tkání dou ke vznik vnitrobuněč V nestimulov stálou degr oto neprobí lex inaktivo í komplexy tak expresi až stovkou r kládanou di í za cíl lé adí posttrans bílkoviny D TROY jak primujicích u změnou v ola obsahuj u HIC1 se č 1 a v neposl následek ne ému bujení. dky přispěly hlavních ce í a homeost ku vrozený čným prostř vaných buňk radací za íhá. Naopak ován a hladi y s transkrip cílových ge různých fak isertační pr épe porozum slačních úp Dazap2 na h ko nový inh LGR5. Pos v genu Hic1 je...
|
|
|
Tumour Suppressor HIC1 - a novel inhibitor of Wnt Signalling
Pospíchalová, Vendula ; Kořínek, Vladimír (vedoucí práce) ; Filipp, Dominik (oponent)
1. ABSTRACT In all metazoan organisms Wnt ligands regulate various developmental and physiological processes during embryogenesis and also in adult tissues. Moreover, deregulation in Wnt-related signalling is associated with several human disorders including cancer. In the so-called canonical pathway, activation of the Wnt receptor complex Frizzled/LRP triggers a complex network of molecular events that ultimately lead to the stabilization of β-catenin and formation of TCF/β- catenin heterodimers in the nucleus. These protein complexes drive expression of a specific set of genes that control the cell fate decision. The Wnt pathway is tightly regulated by several mostly negative feedback loops involving scores of extracellular, cytoplasmic or nuclear proteins. Recently, we have identified tumour suppressor Hypermethylated in cancer 1 (HIC1) as a negative modulator of canonical Wnt signalling. The HIC1 gene encodes a BTB/POZ-zinc finger transcriptional repressor. Interestingly, the HIC1-dependent repression of the TCF/β-catenin- dependent genes is not mediated by direct association of HIC1 with the regulatory regions of the Wnt-responsive genes but rather by a sequestration of TCF/β-catenin complexes to the nuclear speckle-like structures - the HIC bodies. These data indicate quite a pleiotropic role of HIC1...
|
|
|
Molecular mechanisms and components controlling the Wnt signaling pathway output
Krausová, Michaela ; Kořínek, Vladimír (vedoucí práce) ; Drbal, Karel (oponent) ; Bryja, Vítězslav (oponent)
Souhrn Signální dráha spouštěná proteiny Wnt se významně podílí na kontrole procesů zárodečného vývoje. V dospělém organismu pak tato kaskáda řídí zejména homeostázu tkání. Ve výstelce trávicího traktu udržují fyziologickou hladinu signalizace Wnt různé regulační děje, které zároveň vyvažují protichůdné procesy proliferace, sebeobnovy kmenových buněk či jejich diferenciace do jednotlivých buněčných střevních linií. Bylo jednoznačně prokázáno, že nekontrolovaná aktivace kaskády Wnt vede k vývinu rakoviny trávicího traktu. Předkládaná práce se zaměřuje na popis nových způsobů regulace dráhy Wnt, týkajících se nejen všeobecně platných aspektů přenosu signálu Wnt, ale i kontextově specifických mechanismů. Výsledky jsou předloženy ve třech výzkumných publikacích a dále v jednom přehledovém článku. První článek se věnuje účasti posttranslačních modifikací proteinů Wnt na jejich správném průchodu buněčnou sekreční drahou a také jejich vlivu na následnou signální aktivitu ligandů Wnt. Nejprve byla podrobně studována časová posloupnost a vzájemná provázanost procesů, které jsou spojeny s přídavkem mastných kyselin na postranní řetězce cysteinových a serinových zbytků v myších proteinech Wnt1 a Wnt3a. Tento výzkum se také současně zabýval vazbou cukerných komplexů, které jsou kovalentně připojovány k molekulám...
|
|
|
The role of transcription factors PU.1 a GATA-1 during leukemia differentiation.
Burda, Pavel ; Stopka, Tomáš (vedoucí práce) ; Kořínek, Vladimír (oponent) ; Machová Poláková, Kateřina (oponent)
Hematopoéza neboli krvetvorba je proces regulovaný transkripčními faktory, mezi nimiž hrají klíčovou roli molekuly PU.1 (Spi1, Sfpi1) a GATA-1. GATA-1 a PU.1 se mohou na DNA vzájemně vázat a blokovat tím své transkripční programy. Myší erytroleukemické buňky (MEL) jsou transformované erythroidní prekurzory zablokované v pokročilejším stádiu erythroidní diferenciace, současně exprimují PU.1 i GATA-1 a lze u nich navodit erytroidní diferenciaci snížením hladiny PU.1 či zvýšení hladiny GATA-1 v jádře. Ve své práci ukazuji, že v MEL buňkách je PU.1 dependentní transkriptom negativně regulovaný pomocí GATA-1. Tuto represi a následně možnou derepresi podrobněji popisuji na genech Cebpa a Cbfb, které kódují další důležité hematopoetické transkripční faktory. Pomocí chromatinové imunoprecipitace a reportérových esejí jsme identifikovali vazebné sekvence DNA pro vazbu PU.1 na genech Cebpa a Cbfb, na nichž jsme v leukemických blastech detekovali současně faktory PU.1 i GATA-1. Regulace transkripce těchto genů manipulací hladiny PU.1 a GATA-1 zahrnuje kvantitativní změny úrovně acetylace H3K9, známky transkripčně aktivního chromatinu. Data jsou podpořena experimenty ukazujícími, že signifikantní derepresi genů Cebpa a Cbfb lze v MEL buňkách dosáhnout jak aktivací PU.1, tak i inaktivací GATA-1. Má disertační práci...
|
host ::
RSS.