Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 8 záznamů.  Hledání trvalo 0.00 vteřin. 
Role of RecQ helicases in maintenance of genomic stability during mitosis
Černoch, Marek ; Janščák, Pavel (vedoucí práce) ; Půta, František (oponent)
Helikázy jsou proteiny schopné rozplétání nukleových kyselin, jejich dysfunkce může být nebezpečná pro genomovou stabilitu buňky. Pět helikáz rodiny RecQ identifikovaných v lidských buňkách se podílí na mnoha buněčných pochodech během celého buněčného cyklu včetně mitózy a jsou proto důležité pro jejich správnou funkci. Mutace v helikázách RecQ může způsobit jejich dysfunkci a vážně narušit různé buněčné procesy, například replikaci DNA, kontrolu poškození DNA nebo rozdělení sesterských chromatid. Mutace mohou také vést k nebezpečným syndromům, jejichž typickým příznakem je zvýšené riziko vzniku rakoviny.
The role of RECQ5 helicase in maintanance of genome stability
Urban, Václav ; Janščák, Pavel (vedoucí práce) ; Krejčí, Lumír (oponent) ; Blažek, Dalibor (oponent)
V průběhu replikace často dochází k zastavení postupu replikačních vidlic v důsledku poškození DNA templátu, přítomnosti transkripčních komplexů nebo tvorby sekundárních struktur DNA. RecQ helikázy patří v buňce k nejdůležitějším faktorům, které zajišťují stabilitu genomu za podmínek replikačního stresu. Přestože jsou transkripce i replikace esenciálními buněčnými mechanismy, jejich vzájemná interference může vést k poškození DNA a následné genomové nestabilitě. RECQ5 helikáza interaguje s RNA polymerázou II během elongační fáze transkripce a zabraňuje vzniku transkripcí indukovaného poškození DNA. V této studii ukazujeme, že RECQ5 interaguje také s RNA polymerázou I a zabraňuje ztrátě či znásobení úseků ribozomální DNA, na kterých dochází k přepisu ribozomální RNA. Prokázali jsme, že během S-fáze buněčného cyklu RECQ5 asociuje s transkripcí v místech právě probíhající replikace. Odstranění RECQ5 pomocí RNA interference vede k zastavení replikačních vidlic v oblastech transkribovaných RNA polymerázou I nebo II, což naznačuje, že RECQ5 udržuje stabilitu genomu v místech kolize mezi replikací a transkripcí. Snížením exprese RECQ5 pomocí RNA interference dochází v jádrech replikujících buněk k akumulaci RAD51 a RAD18 fokusů, které pravděpodobně představují nerozřešené replikační intermediáty, které...
Uncoupling of DNA restriction and DNA translocation functions of the Type I restriction modification enzyme EcoR124I
Šišáková, Eva ; Weiserová, Marie (vedoucí práce) ; Janeček, Jiří (oponent) ; Janščák, Pavel (oponent)
4 Lívery l. Miestne cielenou mutagerÉzousme pripravili kolekciu Ínutantovsjednou substitrlciou konzervovanýchaminokyselinových zvyškov v motívochII a III v N.ÍerminálnejónÉne podjednotkyHsdRenzymuEcoRl24I:Dl5lA, El65A, El65D, EI65IIadK167A. r Pozitívnym a negativnym komplementďným tostonrilr ylvo sme zistili' Že všet$ mutantyprejavili fenoýp ťď. r Test restrikcie DNA ',?vjrro potvrdil výsledky in vivo testov,Že Žiadnyz mutantov nebolschopníštiepiťplazmidovúDNA nalineá'muforrnu. r TestviizbovostiDNA (EMSA) neodhalilžiadnevýznamrÉrozďely medzidivolcým a mutantnýmienzýmamiv schopnostiviazaťDNA. r Metóda na meranieATPázovej aktivity,zaloŽeruínapoužitíproteínuviaŽúcehgfosfáL ukázalu Že substituciev motíveII a Itr u váčšinymutantovspÓsobila virc než2. nrásobnúredukciu hydrolýzy ATP. Mutant Kl67A bol jeďný' ktoý prejavil aktivifu porovnatelhús divolcýmenzýmom. r Translokačnýprocesbol analyzovanýdisociácioutriplexu na stopped.fbw fluorimetri a pornocoumagnetickejpinzeý. obe techniky ukázali zntženétranslokďnérýchloati mutantov,rozdiely medzi mutantamia divohým enzýmom boli ešteýraznejšie pri merani na magrretickej pinzete. Pozorovali sme takztiez zmenerrú procesivih1iniciáciua bimoďílnudistribúciuRl ýchlostí. 2. Aminokyselinovézvyšlry Q a Y v motíveQxxxY podjednotkyHsdR boli substituované...
Uncoupling of DNA restriction and DNA translocation functions of the Type I restriction modification enzyme EcoR124I
Šišáková, Eva ; Weiserová, Marie (vedoucí práce) ; Janeček, Jiří (oponent) ; Janščák, Pavel (oponent)
4 Lívery l. Miestne cielenou mutagerÉzousme pripravili kolekciu Ínutantovsjednou substitrlciou konzervovanýchaminokyselinových zvyškov v motívochII a III v N.ÍerminálnejónÉne podjednotkyHsdRenzymuEcoRl24I:Dl5lA, El65A, El65D, EI65IIadK167A. r Pozitívnym a negativnym komplementďným tostonrilr ylvo sme zistili' Že všet$ mutantyprejavili fenoýp ťď. r Test restrikcie DNA ',?vjrro potvrdil výsledky in vivo testov,Že Žiadnyz mutantov nebolschopníštiepiťplazmidovúDNA nalineá'muforrnu. r TestviizbovostiDNA (EMSA) neodhalilžiadnevýznamrÉrozďely medzidivolcým a mutantnýmienzýmamiv schopnostiviazaťDNA. r Metóda na meranieATPázovej aktivity,zaloŽeruínapoužitíproteínuviaŽúcehgfosfáL ukázalu Že substituciev motíveII a Itr u váčšinymutantovspÓsobila virc než2. nrásobnúredukciu hydrolýzy ATP. Mutant Kl67A bol jeďný' ktoý prejavil aktivifu porovnatelhús divolcýmenzýmom. r Translokačnýprocesbol analyzovanýdisociácioutriplexu na stopped.fbw fluorimetri a pornocoumagnetickejpinzeý. obe techniky ukázali zntženétranslokďnérýchloati mutantov,rozdiely medzi mutantamia divohým enzýmom boli ešteýraznejšie pri merani na magrretickej pinzete. Pozorovali sme takztiez zmenerrú procesivih1iniciáciua bimoďílnudistribúciuRl ýchlostí. 2. Aminokyselinovézvyšlry Q a Y v motíveQxxxY podjednotkyHsdR boli substituované...
The role of RECQ5 helicase in maintanance of genome stability
Urban, Václav ; Janščák, Pavel (vedoucí práce) ; Krejčí, Lumír (oponent) ; Blažek, Dalibor (oponent)
V průběhu replikace často dochází k zastavení postupu replikačních vidlic v důsledku poškození DNA templátu, přítomnosti transkripčních komplexů nebo tvorby sekundárních struktur DNA. RecQ helikázy patří v buňce k nejdůležitějším faktorům, které zajišťují stabilitu genomu za podmínek replikačního stresu. Přestože jsou transkripce i replikace esenciálními buněčnými mechanismy, jejich vzájemná interference může vést k poškození DNA a následné genomové nestabilitě. RECQ5 helikáza interaguje s RNA polymerázou II během elongační fáze transkripce a zabraňuje vzniku transkripcí indukovaného poškození DNA. V této studii ukazujeme, že RECQ5 interaguje také s RNA polymerázou I a zabraňuje ztrátě či znásobení úseků ribozomální DNA, na kterých dochází k přepisu ribozomální RNA. Prokázali jsme, že během S-fáze buněčného cyklu RECQ5 asociuje s transkripcí v místech právě probíhající replikace. Odstranění RECQ5 pomocí RNA interference vede k zastavení replikačních vidlic v oblastech transkribovaných RNA polymerázou I nebo II, což naznačuje, že RECQ5 udržuje stabilitu genomu v místech kolize mezi replikací a transkripcí. Snížením exprese RECQ5 pomocí RNA interference dochází v jádrech replikujících buněk k akumulaci RAD51 a RAD18 fokusů, které pravděpodobně představují nerozřešené replikační intermediáty, které...
Molecular mechanisms underlying maintenance of genome stability
Burdová, Kamila ; Janščák, Pavel (vedoucí práce) ; Cséfalvay, Eva (oponent) ; Krejčí, Lumír (oponent)
Buňky v našem těle jsou každý den vystaveny poškození DNA vlivem endogenních a exogenních faktorů. Schopnost buněk opravit poškozenou DNA je důležitá pro zachování genetické informace. Mezi nejvíce cytotoxické DNA léze patří dvojvláknové zlomy DNA. Oxidační poškození DNA je jednou z nejčastějších lézí. Cílem této práce bylo prohloubit stávající znalosti molekulárních mechanismů opravy dvojvláknových zlomů DNA a oxidačního poškození DNA. Hlavním zdrojem oxidačního poškození buněk jsou reaktivní formy kyslíku, které jsou neustále generovány jako vedlejší produkty buněčného metabolismu. Jednou z nejčastěji vznikajících modifikací DNA je 7,8-dihydro-8-oxo-guanin (8-oxo-G), jež se během replikace chybně páruje s adeninem. Pokud toto poškození není opraveno, dochází k akumulaci bodových mutací. Oxidační poškození DNA je opravováno převážně vystřižením porušené báze, tzv. "base excision repair" (BER). Při odstranění špatně inkorporovaného adeninu oproti 8-oxo-G dochází v prvním kroku k jeho vystřižení MutY DNA glykosylázou (MUTYH). Naše výsledky ukazují, že v následném kroku tohoto procesu opravy DNA WRN helikáza (WRN) fyzicky interaguje s polymerázou λ a stimuluje správné přiřazení cytosinu oproti 8-oxo-G a následnou syntézu DNA vedoucí k opravě poškozené DNA. Oprava dvojvláknových zlomů DNA má dvě...
Role of RecQ helicases in maintenance of genomic stability during mitosis
Černoch, Marek ; Janščák, Pavel (vedoucí práce) ; Půta, František (oponent)
Helikázy jsou proteiny schopné rozplétání nukleových kyselin, jejich dysfunkce může být nebezpečná pro genomovou stabilitu buňky. Pět helikáz rodiny RecQ identifikovaných v lidských buňkách se podílí na mnoha buněčných pochodech během celého buněčného cyklu včetně mitózy a jsou proto důležité pro jejich správnou funkci. Mutace v helikázách RecQ může způsobit jejich dysfunkci a vážně narušit různé buněčné procesy, například replikaci DNA, kontrolu poškození DNA nebo rozdělení sesterských chromatid. Mutace mohou také vést k nebezpečným syndromům, jejichž typickým příznakem je zvýšené riziko vzniku rakoviny.
Characterization of Antirecombinase Activity of Human FBH1 Helicase
Šimandlová, Jitka ; Janščák, Pavel (vedoucí práce) ; Cséfalvay, Eva (oponent)
Homologní rekombinace (HR) je mechanismus nezbytný pro bezchybnou opravu dvouvláknových zlomů v DNA. Tento proces musí být přísně regulován, protože nadměrné množství nežádoucích HR může v buňce vést k nestabilitě genomu, od které je už jen krůček k symptomu předčasnému stárnutí či vývoji zhoubných onkologických onemocnění. Rozhodujícím krokem v procesu HR je tvorba tzv. presynaptického filamentu. Ten vzniká po navázání molekul RAD51 na úsek jednořetězcové DNA, který se vytvoří v okolí dvouvláknových zlomů. Proces HR je kontrolován mj. DNA helikázami. Mezi nimi je i lidská FBH1 (F-box DNA helicase 1) ze SF1 rodiny helikáz. Jedinečným znakem FBH1 helikázy je přítomnost konzervovaného F-box motivu. Díky němu se FBH1 váže v SCF komplexu fungujícího jako E3 ubiquitin ligáza, která určuje proteiny pro degradaci. V procesu HR plní FBH1 úlohu v regulaci stability presynaptického filamentu. Ovšem přesný mechanismus jak FBH1 kontroluje činnost RAD51 ještě nebyl zcela popsán. V této diplomové práci jsme ukázali, že FBH1 helikáza aktivně rozrušuje RAD51 presynaptický filament. Dále jsme in vitro odhalili přímou interakci FBH1 s RAD51 a RPA. Na základě našich výsledků jsme navrhli možný model mechanismu antirekombinázové funkce FBH1 helikázy.

Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.