Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 12 záznamů.  1 - 10další  přejít na záznam: Hledání trvalo 0.01 vteřin. 
Sensitive Layers for Optical Biosensors and Protein Chips
Rodriguez Emmenegger, César ; Brynda, Eduard (vedoucí práce) ; Lynn, Nicholas Scott (oponent) ; Shukurov, Andrey (oponent)
Citlivé vrstvy pro optické biosenzory a proteinové čipy Cílem této disertační práce byl vývoj citlivých povrchů pro optické afinitní biosenzory vhodné k detekci analytů v komplexních biologických médiích. Praktické aplikaci těchto technik brání tvorba nespecifických proteinových depozitů na površích senzorů (fouling), zvláště při styku s krevní plazmou, kde se vyskytuje velká většina relevantních analytů. Práce byla zaměřena na tři hlavní oblasti:  vývoj a příprava povrchů, které významně snižují nebo zamezují vzniku depozitů (antifouling, resp. non-fouling povrchy);  hodnocení a konceptualizace odolnosti povrchů proti vzniku depozitů z krevní plazmy a séra a dalších biologických tekutin;  příprava citlivých vrstev pro detekci v komplexních biologických médiích. K přípravě povrchů odolných proti vzniku proteinových depozitů byly použity tři přístupy: i) samoorganizované (self-assembled) monovrstvy s koncovou funkční skupinou, ii) na konci ukotvené polymerní řetězce (end-tethered polymers) a iii) polymerní kartáče připravené povrchově iniciovanou kontrolovanou radikálovou polymerací. Zkoumání proteinů v depozitech krevní plazmy vznikajících na površích na bázi PEG ukázalo, že vzniku depozitů na tomto typu povrchů nelze zcela zabránit. Byl připraven nový typ non-fouling polymerních kartáčů na bázi...
Multifunctional biomolecular assemblies for parallelized analysis of biomolecular interactions
Bocková, Markéta ; Homola, Jiří (vedoucí práce) ; Brynda, Eduard (oponent) ; Procházka, Marek (oponent)
Název práce: Multifunkční biomolekulární soubory pro paralelizovanou analýzu biomolekulárních interakcí Autor: Markéta Bocková Katedra: Fyzikální Ústav MFF UK Vedoucí disertační práce: Prof. Ing. Jiří Homola, CSc., DSc., Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i. Abstrakt: Biosenzory s povrchovými plazmony (SPR biosenzory) představují jednu z nejrozvinutějších optických metod pro pozorování interakcí biomolekul v reálném čase a bez použití značek. Tato disertační práce shrnuje pokroky ve vývoji SPR biosenzorů a jejich využití pro studium biomolekulárních interakcí. Práce představuje pokroky především ve dvou hlavních oblastech výzkumu SPR biosenzorů: metodách imobilizace biomolekul a metodikách pro detekci biomolekul a studium biomolekulárních interakcí. V rámci této disertační práce jsou zkoumány metody pro imobilizaci široké škály biomolekul a jejich prostorově-kontrolované ukotvení na povrch SPR biosenzoru. Dále jsou popsány nové přístupy k SPR metodě, které umožňují potlačit nežádoucí vliv nespecifické adsorpce a omezeného transportu molekul, a tím zvýšit přesnost a spolehlivost SPR biosenzorů. Pokroky ve vývoji SPR biosenzorů jsou rovněž využity pro studium biomolekulárních interakcí se vztahem k relevantním problémům molekulární biologie. Klíčová slova: rezonance povrchových plazmonů, optické...
Adhesion and growth of adipose tissue-derived stem cells on fibrin assemblies with attached growth factors for tissue engineering of heart valves
Filová, Elena ; Trávníčková, Martina ; Knitlová, Jarmila ; Matějka, Roman ; Kučerová, Johanka ; Riedelová, Zuzana ; Brynda, Eduard ; Bačáková, Lucie
Currently used xenogeneic biological heart valve prostheses are decellularized and crosslinked with glutaraldehyde. These grafts usually undergo degeneration and calcification. Pericardium-based heart valve prostheses, re-seeded with autologous cells, i.e. Adipose tissue-derived cells (ASCs) and endothelial cells, could have longer durability and biocompatibility. In order to improve the adhesion of cells and their ingrowth into decellularized pericardium, various fibrin (Fb) layers were developed, i.e. Fb, Fb with covalently bound heparin (H), Fb with either vascular endothelial growth factor (VEGF) or fibroblast growth factor 2 (FGF) in various concentrations (1 ng/ml, 10 ng/ml, 100 ng/ml) or with both VEGF and FGF (100 ng/ml). Growth factors were attached onto Fb via heparin or were adsorbed. ASCs were seeded on theses layers in a DMEM medium supplemented with 2 % of fetal bovine serum, TGFβ1 and BMP-4 (both 2.5 ng/ml), and with ascorbic acid. Cell adhesion and growth/viability was assessed by counted cell number/MTS evaluation. ASCs were stained for differentiation markers of smooth muscle cells, such as alpha-actin, calponin, and myosin heavy chain. On day 7, ASCs on Fb-H-VEGF layers produced both calponin and alpha-actin. An increased FGF concentration caused reduced calponin staining of ASCs. Lack of heparin in fibrin assemblies with growth factors inhibited the production of both alpha-actin and calponin in ASCs. The highest ASCs density/viability was found on Fb-H-VEGF-FGF layer. The proper formulation of fibrin coatings could be favorable for ASCs growth and differentiation and could subsequently support endothelialization of cardiovascular prostheses with endothelial cells.
Bioactive interfaces between synthetic surfaces and biological fluids
de los Santos Pereira, Andrés ; Brynda, Eduard (vedoucí práce) ; Shukurov, Andrey (oponent) ; Šubr, Vladimír (oponent)
Název práce: Bioaktivní rozhraní mezi umělými povrchy a biologickými tekutinami Autor: Andrés de los Santos Pereira Katedra/Ústav: Ústav makromolekulární chemie, AV ČR v.v.i. Školitel: RNDr. Eduard Brynda, CSc., Ústav makromolekulární chemie, AV ČR v.v.i. Abstrakt: Použití bez značkových afinitních biosensorů, pokročilých implantátů a zařízení přicházejících do kontaktu s krví vyžaduje, aby jejich povrch odolával nespecifické adsorpci proteinů (fouling) a souvisejícím komplikacím a přitom aby měl na svém povrchu navázány bioreceptory poskytující specifickou funkci. Cílem této práce bylo prozkoumat strategie pro přípravu těchto bioaktivních povrchů potlačujících nespecifické interakce. Byly připraveny různé typy polymerních kartáčů, u kterých byla vyhodnocena jejich schopnost potlačovat nespecifické interakce po kontaktu s krevní plasmou (získanou od různých dárců a komerčních zdrojů) a vznik trombu po kontaktu s plnou krví. Pomocí silové spektroskopie byla dále stanovena energie a síla adheze bakterií, která byla u polymerních kartáčů významně snížena ve srovnání s různými referenčními substráty. Imobilizace bioreceptorů byla řešena strategií hierarchické funkcionalizace. Polymerní kartáče se skládaly z inertního spodního bloku a reaktivního horního bloku laditelné tloušťky. To přispělo k zachování...
In situ study of nuclear acids interactions key for gene expression and therapy based on its silencing
Špringer, Tomáš ; Štěpánek, Josef (vedoucí práce) ; Brynda, Eduard (oponent) ; Vorlíčková, Michaela (oponent)
V dizertační práci studujeme nová analoga odvozená od R06 aptameru cílící na TAR vlásenku HIV viru s použitím citlivého biosensoru s povrchovými plasmony, který umožňuje sledování molekulárních interakcí v reálném čase. Vyšetřujeme sedm různých modifikací, které jsou umístěné na devíti pozicích R06 aptameru, a odhalujeme jejich použitelnost při tvorbě účinných a stálých anti-TAR oligonukleotidů. Dále zjišťujeme, které pozice jsou vhodné pro nahrazení modifikací, a zároveň interpretujeme výsledky v kontextu lokální nukleotidové geometrie a interakcí v TAR/anti-TAR komplexu. V dizertační práci dále vyvíjíme nový fluidický systém, který eliminuje disperzi vzorku a míšení vzorků, a tak umožňuje přesné sledování molekulárních interakcí na povrchu SPR čipu. Pro charakterizaci podmínek měření na povrchu oligonukleotidového čipu studujeme stínící efekt jednomocných a dvoumocných kationtů, které jsou klíčové pro interakci záporně nabitých oligonukleotidů.
Surface plasmons in optical microstructures and their sensor applications
Adam, Pavel ; Homola, Jiří (vedoucí práce) ; Brynda, Eduard (oponent) ; Richter, Ivan (oponent)
Název práce: Povrchové plasmony v optických mikrostrukturách a jejich senzorové aplikace Autor: Pavel Adam Ústav: Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v.v.i., Oddělení optických senzorů Vedoucí doktorské práce: doc. Ing. Jiří Homola, CSc., DSc. Abstrakt: Práce se zabývá studiem senzorů s povrchovými plazmony (SPR senzory), které umožňují využít techniku multiplexování v oboru vlnových délek (WDM), tj. současně excitovat několik různých povrchových plasmonů (SP). Tyto senzory používají mřížkový vazební člen, který excituje buď běžné nebo Braggovsky rozštěpené SP. Problematika SP na difrakčních mřížkách je studována analyticky a srovnána s numerickými metodami (diferenciální a integrální). Poté je studována metoda WDM dvou a tří SP. WDM senzory se dvěma SP jsou analyzovány s ohledem na rozlišení, šum a přeslechy odezev senzoru. Výsledky analýz slouží k optimalizaci senzorů se dvěma SP s ohledem na schopnost separace odezvy senzoru na povrchovou a objemovou změnu indexu lomu. V rámci dizertační práce byly připraveny difrakční mřížky (metodou interferenční holografie) a jejich repliky (metodou měkké litografie), které byly následně charakterizovány a využity pro konstrukci nových typů SPR senzorů. Schopnosti WDM SPR senzorů byly demonstrovány v modelovém experimentu, v kterém byl sledován růst vrstev proteinů. V...
Sensitive Layers for Optical Biosensors and Protein Chips
Rodriguez Emmenegger, César ; Brynda, Eduard (vedoucí práce) ; Lynn, Nicholas Scott (oponent) ; Shukurov, Andrey (oponent)
Citlivé vrstvy pro optické biosenzory a proteinové čipy Cílem této disertační práce byl vývoj citlivých povrchů pro optické afinitní biosenzory vhodné k detekci analytů v komplexních biologických médiích. Praktické aplikaci těchto technik brání tvorba nespecifických proteinových depozitů na površích senzorů (fouling), zvláště při styku s krevní plazmou, kde se vyskytuje velká většina relevantních analytů. Práce byla zaměřena na tři hlavní oblasti:  vývoj a příprava povrchů, které významně snižují nebo zamezují vzniku depozitů (antifouling, resp. non-fouling povrchy);  hodnocení a konceptualizace odolnosti povrchů proti vzniku depozitů z krevní plazmy a séra a dalších biologických tekutin;  příprava citlivých vrstev pro detekci v komplexních biologických médiích. K přípravě povrchů odolných proti vzniku proteinových depozitů byly použity tři přístupy: i) samoorganizované (self-assembled) monovrstvy s koncovou funkční skupinou, ii) na konci ukotvené polymerní řetězce (end-tethered polymers) a iii) polymerní kartáče připravené povrchově iniciovanou kontrolovanou radikálovou polymerací. Zkoumání proteinů v depozitech krevní plazmy vznikajících na površích na bázi PEG ukázalo, že vzniku depozitů na tomto typu povrchů nelze zcela zabránit. Byl připraven nový typ non-fouling polymerních kartáčů na bázi...
Book of Abstracts and Programme. Functional Polymers at Bio-Material Interfaces - 79th Prague Meeting on Macromolecules
Rypáček, František ; Brynda, Eduard
The Book of abstracts and programme contains the summaries of all the contributions to the international conference " Functional Polymers at Bio-Material Interfaces" was organized simultaneously as the 79th Prague Meeting on Macromolecules (PMM). The participants presented 32 lectures and 31 posters.

Národní úložiště šedé literatury : Nalezeno 12 záznamů.   1 - 10další  přejít na záznam:
Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.