|
|
Dynamical Behaviour of Matrix Proteins from Mason-Pfizer Monkey Virus
Srb, Pavel ; Lang, Jan (vedoucí práce) ; Žídek, Lukáš (oponent) ; Brus, Jiří (oponent)
Název práce: Dynamické chování matrixových proteinů Mason-Pfizerova opičího viru Autor: Pavel Srb Katedra: Katedra fyziky nízkých teplot Vedoucí disertační práce: doc. RNDr. Jan Lang, Ph.D Abstrakt: Studovali jsme oligomerizační vlastnosti betaretrovirového non- myristoylovaného matrixového proteinu a jeho mutantu R55F z Mason- Pfizerova opičího viru metodami NMR spektroskopie v kapalné fázi. Bylo prokázáno, že divoký typ (WT) v roztoku oligomerizuje. Detailní model oligomerizace byl získán pomocí společné analýzy koncentračně závislých chemických posunů a translačních difúzních koeficientů. Bylo zjišťeno, že WT se v roztoku nachází v rovnováze mezi monomerem, dimerem a trimerem. Dále bylo využito kombinace NMR relaxačních měření a molekulové dynamiky k detailnímu studiu lokálních pohybů v proteinu. Výsledky ukazují, že oligomerizace je úzce svázána se zvýšenou pohyblivostí molekuly WT v oblasti smyčky mezi helixy α2 and α3 a v C-terminální části helixu α3. Tyto části molekuly zároveň tvoří oligomerizační rozhraní. Mutantní pro- tein R55F, který nevykazuje specifickou oligomerizaci byl shledán podstatně rigidnějším. Z analýzy vyplývá, že mechanismy konformační selekce, in- dukovaného fitu a strukturní...
|
|
| |
|
|
Solid-state NMR study of structure and segmental dynamics of pharmaceutical materials based on the solid dispersions of drugs in polymer matrices.
Policianová, Olívia ; Brus, Jiří (vedoucí práce) ; Smrček, Stanislav (oponent) ; Dračínský, Martin (oponent)
Klíčovým krokem ve vývoji a produkci farmaceutických materiálů je vysoce precisní strukturní charakterizace. Strukturní složení farmaceutických substancí je nicméně velmi často složité a těžko identifikovatelné. Jako vhodný způsob k získání jednoznačné strukturní interpretace těchto systémů se jeví nukleární magnetická resonance v pevné fázi s vysokým rozlišením (ssNMR). Z tohoto důvodu je zde popsán spolehlivý nástroj - soubor ssNMR experimentů pro úplnou charakterizaci rozličných pevnolátkových farmaceutik. Důsledná optimalizace ssNMR technik je uskutečněna na velkém množství měřených vzorků obsahujících aktivní farmaceutické ingredience (APIs - active pharmaceutical ingredients) se systémy zahrnujícími APIs formulované v pevných disperzích až po čisté formy vykazující vysokou molekulární neuspořádanost. V této práci je též diskutován vliv polymerní matrice na tvorbu typů pevných disperzí umožňujících i jemné vyladění kontrolovaného uvolňování léčiva. Rozlišení mezi různými strukturními uspořádáními molekul APIs v trojrozměrné dimenzi složitých pevnolátkových farmaceutických systémů je umožněno díky jednoduché strategii - faktorové analýze (FA) aplikované na obtížně popsatelná ssNMR spektra (13 C CP/MAS NMR a 19 F MAS NMR). Výsledky těchto ssNMR zkoumání přispívají k lepšímu pochopení tuhých...
|
|
|
Dynamical Behaviour of Matrix Proteins from Mason-Pfizer Monkey Virus
Srb, Pavel ; Lang, Jan (vedoucí práce) ; Žídek, Lukáš (oponent) ; Brus, Jiří (oponent)
Název práce: Dynamické chování matrixových proteinů Mason-Pfizerova opičího viru Autor: Pavel Srb Katedra: Katedra fyziky nízkých teplot Vedoucí disertační práce: doc. RNDr. Jan Lang, Ph.D Abstrakt: Studovali jsme oligomerizační vlastnosti betaretrovirového non- myristoylovaného matrixového proteinu a jeho mutantu R55F z Mason- Pfizerova opičího viru metodami NMR spektroskopie v kapalné fázi. Bylo prokázáno, že divoký typ (WT) v roztoku oligomerizuje. Detailní model oligomerizace byl získán pomocí společné analýzy koncentračně závislých chemických posunů a translačních difúzních koeficientů. Bylo zjišťeno, že WT se v roztoku nachází v rovnováze mezi monomerem, dimerem a trimerem. Dále bylo využito kombinace NMR relaxačních měření a molekulové dynamiky k detailnímu studiu lokálních pohybů v proteinu. Výsledky ukazují, že oligomerizace je úzce svázána se zvýšenou pohyblivostí molekuly WT v oblasti smyčky mezi helixy α2 and α3 a v C-terminální části helixu α3. Tyto části molekuly zároveň tvoří oligomerizační rozhraní. Mutantní pro- tein R55F, který nevykazuje specifickou oligomerizaci byl shledán podstatně rigidnějším. Z analýzy vyplývá, že mechanismy konformační selekce, in- dukovaného fitu a strukturní...
|
|
|
Závěrečná zpráva 2015 o výzkumu výsypek v okolí Sokolova na základě dohody mezi ENKI ops a Ústavem půdní biologie BC AV ČR
Frouz, Jan ; Moradi, J. ; Mudrák, Ondřej ; Albrechtová, Jana ; Kučera, J. ; Kukla, J. ; Bednářová, E. ; Vindušková, O. ; Sebag, D. ; Cailleau, G. ; Brus, Jiří
Zpráva přináší souhrn výsledků výzkumu obnovy půd a ekosystémů na území postiženém těžbou nerostů na Sokolovsku na základě dohody mezi ENKI ops a Ústavem půdní biologie BC AV ČR za rok 2015.
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
