|
|
Applications of Machine Learning for Detecting and Counting Objects in Cell Biology
Brázdilová, Květa ; Stopka, Pavel (vedoucí práce) ; Hoksza, David (oponent)
Současný biologický výzkum vytváří velké množství dat, která vyžadují automatizaci pro efektivní analýzu. V poslední době vznikají pro mnohé z těchto problémů řešení využívající strojové učení. Tato práce se zaměřuje na aplikace strojového učení pro analýzu obrazu, například detekci buněk v mikroskopickém snímku a jejich klasifikaci dle fenotypu. Po krátkém úvodu do strojového učení obecně bude představeno osm publikovaných metod využívajících strojové učení pro detekci nebo klasifikaci objektů v biologických snímcích. Dále bude uvedeno pět open-sourcových softwarových nástrojů pro obrazovou analýzu v biologii, které využívají některé z metod zmíněných výš. Dále je popsán nový project, jehož cílem je vytvořit konvoluční neuronovou síť na počítání bakteriálních kolonií na agarových plotnách. Na závěr jsou diskutovány výsledky tohoto projektu. Klíčová slova: strojové učení, neuronová síť, rozpoznávání objektů, buněčná biologie, segmentace
|
host ::
RSS.