|
|
Vliv TGFβ na produkci proteinů extracelulární matrix mezenchymálními buňkami mikroprostředí glioblastomu
Vepřková, Jana ; Bušek, Petr (vedoucí práce) ; Přechová, Magdalena (oponent)
Glioblastom (GBM) je nejagresivnější a nejčastější maligní primární mozkový nádor, který se vyznačuje změnami extracelulární matrix (ECM). K těmto změnám může přispívat transformující růstový faktor beta (TGFβ), který je v GBM zvýšeně exprimován. TGFβ indukuje expresi fibroblastového aktivačního proteinu (FAP), který se v GBM nachází na mezenchymálních buňkách obklopujících cévy, kde se také typicky vyskytují proteiny ECM kolagen typu I a fibronektin. Cílem práce bylo určit vliv TGFβ na expresi kolagenu typu I a fibronektinu FAP+ mezenchymálními buňkami v GBM a zjistit vliv ECM produkované těmito buňkami na migraci gliomových buněk. Bioinformatické a tkáňové analýzy prokazují korelaci mezi expresí TGFβ, FAP, kolagenu typu I a fibronektinu v GBM. Pomocí imunohistochemie byla detekována exprese TGFβ difúzně v GBM včetně oblastí stromatu, které obsahovaly FAP+ mezenchymální buňky a kolagen typu I. V in vitro experimentech byla po stimulaci TGFβ u FAP+ mezenchymálních buněk prokázána zvýšená produkce kolagenu typu I a fibronektinu, zatímco u gliomových buněk byla produkce těchto proteinů i po stimulaci TGFβ velmi nízká. ECM produkovaná FAP+ mezenchymálními buňkami významně zvyšovala migraci gliomové linie U251, avšak ECM FAP+ mezenchymálních buněk po stimulaci TGFβ migraci této gliomové linie již více...
|
|
|
Role fibroblastového aktivačního proteinu v růstu a invazivitě gliomových buněk
Fejfarová, Edita ; Bušek, Petr (vedoucí práce) ; Szabo, Pavol (oponent)
Astrocytární tumory vysokého stupně malignity jsou velice progresivní mozkové nádory. Glioblastoma multiforme je nejčastější a nejmalignější typ s infiltrativním fenotypem nádorových buněk. Fibroblastový aktivační protein (FAP) je prolyl peptidáza převážně vázaná na membránu a vykazující exo- a endopeptidázovou hydrolytickou aktivitu. Je známo, že se FAP podílí na hojení ran, buněčné migraci a invazi a jeho xprese je spojována s patogenezí řady malignit. Exprese FAP mRNA je podle microarray dat z The Cancer Genome Atlas zvýšena ve 48% glioblastomů. Vliv FAP na patogenezi astrocytárních nádorů není objasněn. Cíly této práce je analyzovat expresi FAP v primárních gliomových kulturách odvozených od gliomů vysokého stupně malignity a analýza vlivu FAP na růst, migraci a invazi gliomových buněk. Naše výsledky z ELISA a wester blotu ukázaly heterogenní expresi napříč studovanými gliomovými primárními buněčnými kulturami a permanentími liniemi. Obě enzymové aktivity charakteristické pro FAP byly detekovány v primární gliomové kultuře P11 s vysokou expresí FAP. Pomocí imunofluorescenčního značení se ukázalo, že v těchto buňkách se FAP nacházel nejen na plasmatické membráně, kde je typicky lokalizován, ale také v cytoplazmě. Buňky z kultury P11 byly tumorigenní v immunodeficientních myších a udržely si...
|
|
|
Význam dipeptidylpeptidázy-IV a homologních proteáz v procesech migrace a invaze.
Fejfarová, Edita ; Bušek, Petr (vedoucí práce) ; Rösel, Daniel (oponent)
Migrace a invaze jsou děje probíhající přirozeně v organismu během embryogeneze, při imunitních reakcích či hojení ran. Velice důležitým faktorem jsou také u řady závažných onemocnění jako např. revmatická artritida a maligní nádory. Význam proteolytických enzymů v těchto procesech je nesporný - podílejí se na degradaci extracelulární matrix a tím usnadňují pohyb buňky. Dipeptidylpeptidáza-IV (DPPIV) odštěpuje pouhé dvě aminokyseliny od N-konce a na degradaci ECM se nepodílí. Rozpoznává a štěpí krátké peptidy mající jako předposlední AA prolin, který svému držiteli obvykle zajišťuje rezistenci vůči běžným typům proteáz. Mezi substráty DPPIV a homologních proteáz patří chemokiny uplatňující se v signalizaci migrace, jako jsou SDF-1 a RANTES či neuropeptid Y. Jejich štěpením a tím inaktivací se molekuly s DPPIV-podobnou aktivitou projevují jako modulátory migračního signálu na buňkách choriokacinomu, neuroblastomu, buňkách Sézaryho syndromu či epiteliálních buňkách migrujících v reakci na poranění. Dalším mechanismem proteáz s DPPIV-podobnou aktivitou je vazba na proteiny extracelulární matrix, čímž se spolupodílejí na adhezi buněk a tím ovlivňují jejich migrační schopnost. Vliv na migraci a invazi mohou mít i intracelulární enzymové homology DDP8 a DPP9, u kterých je mechanismus účinku již z...
|
|
|
Development of nanochemical tools targeting receptors in the tumor microenvironment
Blažková, Kristýna ; Konvalinka, Jan (vedoucí práce) ; Abramson, Jakub (oponent) ; Bušek, Petr (oponent)
Vývoj nanochemických nástrojů cílících receptory nádorového mikroprostředí Cílení receptorů nádorového mikroprostředí je zásadním krokem ve vývoji cílených terapií, personalizované medicíny a imunoterapií rakoviny. Dostupné možnosti jsou ale omezené malou dostupností cílících ligandů. Vývoj nových terapií v uplynulých letech do velké míry spoléhal na protilátky či dokonce genetické modifikace imunitních buněk. Dostupnost malých molekul cílících receptory v nádorovém mikroprostředí by umožnila rozvoj alternativních strategií léčby a diagnostiky a prohloubila by naše poznání mechanismů a zákonitostí vývoje a léčby rakovinných onemocnění. Jako vhodné cíle byly vybrány membránový antigen specifický pro prostatu (PSMA) a heterodimery CD3εγ a CD3εδ spolupracující s T-buněčným receptorem. Metodou zvolenou pro hledání nových ligandů byl inovativní fágový displej využívající chemicky modifikovaných bicyklických peptidů. Fágový displej knihovny A proti PSMA odhalil reproducibilní selekci konkrétní aminokyselinové sekvence. Fágový klon kódující tuto sekvenci specificky vázal PSMA, avšak nasyntetizovaný peptid neměl dostatečnou selektivitu ani afinitu k PSMA. Kombinací tohoto peptidového ligandu s polymerním nosičem zvaným iBody bylo ovšem možné dosáhnout zlepšení afinity vazby PSMA o tři řády, a tím i zlepšení...
|
|
|
Implementace logistických modulů informačního systému ve firmě Niedax s.r.o.
BUŠEK, Petr
Tématem této diplomové práce je implementace logistických modulů podnikového informačního systému ve společnosti Niedax. Teoretická část poskytuje informace z oblasti informačních systémů doplněné informacemi o ERP (Enterprise Resource Planning), výdajích IS / IT a metodách návrhu a implementace informačních systémů. Praktická část stručně popisuje vybraný informační systém, společnost ve které byl informační systém implementován, implementačního partnera a informační systém BMD. Dále je provedena analýza současného stavu a je popsán průběh celého implementačního projektu, po kterém následuje praktická ukázka systému BMD. Nakonec je provedeno vyhodnocení projektu. Hodnocení je založeno na srovnání hodnot TCO (Total Cost of Ownership) stanovených v praktické části práce a vyhodnocení dotazníkového šetření.
|
|
|
The Role of the Tumour Microenvironment on Melanoma Cell Invasiveness
Jobe, Njainday ; Rösel, Daniel (vedoucí práce) ; Kořínek, Vladimír (oponent) ; Bušek, Petr (oponent)
Invazivita a metastázování patří mezi určující vlastnosti buněk zhoubných nádorů. Je nyní již zjevné, že v invazivitě a metastázování nádorových buněk má důležitou roli nádorové mikroprostředí. Nádorové buňky mohou invadovat buď individuálně, s využitím améboidního nebo mezenchymálního způsobu invazivity, nebo kolektivně. Prvním cílem této disertační práce bylo analyzovat roli NG2 v améboidně- mezenchymálním přechodu (AMT) a signalizaci přes dráhu Rho/ROCK. Zjistili jsme, že NG2 podporuje améboidní morfologii nádorových buněk a zvyšuje invazivitu prostřednictvím Rho/ROCK dráhy. V druhé části disertační práce jsme analyzovali úlohu jedné z hlavních složek nádorového mikroprostředí - s nádory asociovaných fibroblastů (CAFs) na invazivitu melanomových buněk. Zjistili jsme, že interakce CAFs a melanomovými buňkami vede ke zvýšení hladin interleukinů IL-6 a IL-8 a následně ke zvýšené invazivitě melanomových buněk. Současné blokování signalizace přes IL-6 a IL-8 s pomocí specifických neutralizačních protilátek inhibuje zvýšení invazivity melanomových buněk indukované pomocí CAFs. Následná analýza další důležité složky nádorového mikroprostředí u melanomů - keratinocytů - ukázala důležitost nádorového niche pro invazivitu. Naše výsledky ukazují, že nádorové buňky jsou vysoce plastické a nádorové...
|
|
|
Role fibroblastového aktivačního proteinu v růstu a invazivitě gliomových buněk
Fejfarová, Edita ; Bušek, Petr (vedoucí práce) ; Szabo, Pavol (oponent)
Astrocytární tumory vysokého stupně malignity jsou velice progresivní mozkové nádory. Glioblastoma multiforme je nejčastější a nejmalignější typ s infiltrativním fenotypem nádorových buněk. Fibroblastový aktivační protein (FAP) je prolyl peptidáza převážně vázaná na membránu a vykazující exo- a endopeptidázovou hydrolytickou aktivitu. Je známo, že se FAP podílí na hojení ran, buněčné migraci a invazi a jeho xprese je spojována s patogenezí řady malignit. Exprese FAP mRNA je podle microarray dat z The Cancer Genome Atlas zvýšena ve 48% glioblastomů. Vliv FAP na patogenezi astrocytárních nádorů není objasněn. Cíly této práce je analyzovat expresi FAP v primárních gliomových kulturách odvozených od gliomů vysokého stupně malignity a analýza vlivu FAP na růst, migraci a invazi gliomových buněk. Naše výsledky z ELISA a wester blotu ukázaly heterogenní expresi napříč studovanými gliomovými primárními buněčnými kulturami a permanentími liniemi. Obě enzymové aktivity charakteristické pro FAP byly detekovány v primární gliomové kultuře P11 s vysokou expresí FAP. Pomocí imunofluorescenčního značení se ukázalo, že v těchto buňkách se FAP nacházel nejen na plasmatické membráně, kde je typicky lokalizován, ale také v cytoplazmě. Buňky z kultury P11 byly tumorigenní v immunodeficientních myších a udržely si...
|
|
|
Význam dipeptidylpeptidázy-IV a homologních proteáz v procesech migrace a invaze.
Fejfarová, Edita ; Rösel, Daniel (oponent) ; Bušek, Petr (vedoucí práce)
Migrace a invaze jsou děje probíhající přirozeně v organismu během embryogeneze, při imunitních reakcích či hojení ran. Velice důležitým faktorem jsou také u řady závažných onemocnění jako např. revmatická artritida a maligní nádory. Význam proteolytických enzymů v těchto procesech je nesporný - podílejí se na degradaci extracelulární matrix a tím usnadňují pohyb buňky. Dipeptidylpeptidáza-IV (DPPIV) odštěpuje pouhé dvě aminokyseliny od N-konce a na degradaci ECM se nepodílí. Rozpoznává a štěpí krátké peptidy mající jako předposlední AA prolin, který svému držiteli obvykle zajišťuje rezistenci vůči běžným typům proteáz. Mezi substráty DPPIV a homologních proteáz patří chemokiny uplatňující se v signalizaci migrace, jako jsou SDF-1 a RANTES či neuropeptid Y. Jejich štěpením a tím inaktivací se molekuly s DPPIV-podobnou aktivitou projevují jako modulátory migračního signálu na buňkách choriokacinomu, neuroblastomu, buňkách Sézaryho syndromu či epiteliálních buňkách migrujících v reakci na poranění. Dalším mechanismem proteáz s DPPIV-podobnou aktivitou je vazba na proteiny extracelulární matrix, čímž se spolupodílejí na adhezi buněk a tím ovlivňují jejich migrační schopnost. Vliv na migraci a invazi mohou mít i intracelulární enzymové homology DDP8 a DPP9, u kterých je mechanismus účinku již z...
|
|
|
The Role of Dipeptidyl Peptidase-IV in Glioma Cell Growth
Bušek, Petr ; Šedo, Aleksi (vedoucí práce) ; Trka, Jan (oponent) ; Konvalinka, Jan (oponent)
Dipeptidylpeptidaza-IV (DPP-IV, CD26, EC 3.4.14.5) je serinova proteáza, která se podílí prostřednictvím limitované proteolýzy na regulaci aktivity mnoha biologicky aktivních peptidů, mimo jiné i mitogenních peptidů účastnících se patogeneze nádorových onemocněni. Změny enzymové aktivity či exprese DPP-IV popsané v řadě tumorů by mohly vest ke změnám signálního potenciálu a biologické funkce jejich substrátů. Změny exprese DPP-IV byly pozorovány i u gliomových buněk v souvislosti s jejich diferenciaci, nedávno byly popsány též u maligních gliomů in vivo. Rovněž bylo prokázáno, že DPP-IV substráty substance P (SP) a chemokin "stromal cell derived factor- 1" (SDF- 1) aktivuji v gliomových buňkach prorůstové signální dráhy a významně se tak podíleji na vzniku a progresi gliomů. (...) S využitím transfekovaných lidských gliomových buněk s inducibilní DPP-IV expresi jsme prokázali, že DPP-IV snižuje růst gliomových linii in vitro a je schopna ovlivnit signální kaskády spouštěné SP. Štěpeni SP však zřejmě není rozhodující pro protirůstový efekt DPP-IV v gliomových buňkách. Výsledky našich experimentů s inhibitorem enzymové aktivity DPP-IV Diprotinem A naznačuji, že DPP-IV by mohla na gliomové buňky působit i prostřednictvím neproteolytických mechanizmů.
|
|
|
Implementace podnikového informačního systému ve vybrané firmě
BUŠEK, Petr
Tato bakalářská práce se zabývá problematikou implementace podnikového informačního systému ve vybrané firmě. V teoretické části jsou uvedeny informace o informačním systému, které jsou doplněny o analýzy vnitřního a vnějšího prostředí, silných a slabých stránek, způsob výběru informačního systému. V praktické části je stručně popsán vybraný informační systém a firma, ve které probíhala implementace. Dále je stávající informační systém zhodnocen analýzou HOS 8, ze které jsou stanoveny cíle implementace nového informačního systému. V závěru praktické části je srovnání informačního systému před implementací a po implementaci metodou HOS 8, což je hlavním cílem této práce.
|
host ::
RSS.