|
|
Perfuzní modelování v optické koherentní tomografii
Štohanzlová, Petra ; Penhaker,, Marek (oponent) ; Kudrna,, Petr (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá zejména perfuzním modelováním v optické koherentní tomografii (OCT). Úvodní část se věnuje základní teorii OCT včetně popisu jejích základních aplikací. Součástí práce bylo testování vybraných kontrastních látek vhodných pro OCT a dále pak návrh a implementace fantomů, které byly následně použity v hlavní části práce. V praktické části práce je pozornost věnována perfuzní analýze v OCT, nejprve aplikaci diluční teorie v OCT pro odhad průtoku, následně pak studii testující základní teorii perfuze na OCT pomocí tkáňového fantomu. Další část práce pak je věnována metodě analýzy rozptylu koherenční zrnitosti pro vizualizaci průtoku.
|
|
|
Multimodální registrace obrazů sítnice
Štohanzlová, Petra ; CSc, Tomáš Suk, (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá možnostmi registrace retinálních snímků z různých modalit, konkrétně optické koherentní tomografie (OCT), skenovací laserové oftalmoskopie (SLO) a fundus kamery. V první fázi práce je zájem soustředěn na registraci obrazu SLO na fundus snímek, což slouží k vymezení oblasti zájmu pro následnou registraci dat z OCT. Závěrečná fáze slouží k nalezení správné pozice B-skenů ve fundus snímku. Na základě prostudování různých registračních metod byl pro registraci v obou případech použit postup využívající výpočet korelačního koeficientu. Pro nalezení optimálních parametrů registrace je použito prohledávání celého prostoru parametrů. V dílčích částech práce pak je vytvořen algoritmus pro vyrovnání OCT B-skenů s následnou detekcí cév a také jednoduchý algoritmus pro detekci cév z fundus snímku. Pro zpřehlednění registrace bylo vytvořeno grafické uživatelské rozhraní, které umožňuje načtení vstupních obrazů a přehledné zobrazení výsledku v několika možných formách.
|
|
|
Program pro spirometrická měření
Rovná, Tereza ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce je zaměřena na metody funkčního vyšetření plic. První část se zabývá základními respiračními údaji, ventilačními poruchami a parametry pro jejich hodnocení. V části druhé podrobněji popisuje jednotlivé diagnostické metody využívané k získávání plicních funkčních parametrů s podrobnějším rozpracováním spirometrických metod. Třetí část je věnována NI DAQ, spirometrické sondě, Spirometru SPIROBANK DT a hlavně programu pro spirometrická měření v prostředí LabVIEW 2013. Čtvrtá část se zaobírá srovnáním naměřených výsledků pomocí vytvořeného programu, zařízení SDAQ a spirometrické sondy a SPIROBANKU DT.
|
|
|
Analýza speklí pro segmentaci obrazů z optické koherentní tomografie
Gallo, Vladimír ; Kolář, Radim (oponent) ; Štohanzlová, Petra (vedoucí práce)
tejto práci sa nachádza základný popis princípu optickej koherentnej tomografie, prehľad jej aplikácií a základné rozdelenie týchto systémov. Ďalej sa práca zaoberá charakterom obrazov optickej koherentnej tomografie, pre ktoré je typický šum zvaný spekle. V práci je uvedený princíp vzniku tohto šumu a využitie jeho závislosti na mikroštruktúre zobrazovaných tkanív pomocou textúrnej analýzy pre účely klasifikácie. Praktická časť tejto diplomovej práce pozostáva z prípravy fantómov, namerania testovacej sady dát na systéme OCT, implementovania metódy analýzy speklov v MATLABe a otestovania funkčnosti implementovaných algoritmov na štandardnom texturálnom datasete a tiež na nameraných fantómových obrazových dátach. Metódy analýzy sú použité pre segmentáciu fantómových obrazových dát.
|
|
|
Segmentace cév sítnice ve 3D obrazech z optické koherentní tomografie
Žáková, Eliška ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Štohanzlová, Petra (vedoucí práce)
Práce je věnována teoretickému seznámení se s optickou koherentní tomografií, strukturou oka a sítnice a možnostmi segmentace cév sítnice ve snímcích z OCT. Dále práce se zabývá segmentací vrstev sítnice pomocí programu OCTSEG, které jsou důležité pro segmentování cév. Následně jsou pomocí čtyř různých algoritmů využívajících průměr, medián, minima a maxima, vytvořeny 2D projekce cév v zájmové vrstvě sítnice. Jako zájmová vrstva jsou zvoleny vrstvy sítnice, ve kterých jsou nejpatrnější stíny cév. Tato oblast byla segmentována programem OCTSEG. V projekcích jsou následně segmentovány cévy a výsledky jsou porovnány. Nejpřesnější detekce se dosáhlo z projekcí vytvořených metodou maxim. Ve druhém případě byla úspěšnější detekce uvažující složku pozadí.
|
|
|
Speckle noise reduction in images from optical coherence tomography
Sokol, Kamil ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
The thesis deals with speckle suppression in images acquired by optical coherence tomograph. It is divided into four parts. The first part describes basic information about the medical imaging method. It also deals with principle of measurement. The second section discusses the formation of image speckle and selected methods to reduce them. Next part is practical and consists of data acquisition, determination of the evaluation methodology and the implementation of speckle reduction methods. The last part is focused on testing and reviews of algorithms and discussion about their results.
|
|
|
Detekce toku s využitím optické koherentní tomografie
Pšurný, Michal ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá detekcí toku založené na analýze textury šedotónových snímků z Optické koherentní tomografie (OCT). Přesněji se zabývá metodou založenou na detekci změn ve rozložení speklí (Specle variance, SV). Byla nasnímána data na dynamickém fantomu na která se aplikovala právě tato metoda. Poté se vyhodnocoval vliv parametrů na kvalitu této metody.
|
|
|
Phantom for measurement of flow rate using dilution methods
Botlová, Simona ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
This bachelor thesis focuses on flow measurement by dilution method. To this end was constructed the product to measure a dilution curve. Part of the work is program developed in LabVIEW interface, which is able to capture data with Vernier pH probe connected via LabPro. Program is able to approximate the measured data and provides information about the area of interest. The paper also describes the dilution method, measurement of pH and model requirements. Based on the obtained results there was constructed laboratory task.
|
|
|
Generátor EKG signálu
Štohanzlová, Petra ; Sekora, Jiří (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá vznikem EKG signálu a možnostmi, jak jej generovat pomocí prostředí programu LabVIEW. Na základě prostudovaných metod popisu signálu byla vybrána metoda využívající podobnosti jednotlivých úseků EKG křivky se sinusovým resp. trojúhelníkovým vzorem. Tato metoda byla následně implementována do prostředí LabVIEW. Vytvořený virtuální přístroj generuje EKG signál se zadanou tepovou frekvencí a nastavitelnou výchylkou jednotlivých vln a kmitů. Také je možné zvolit jeden z 12-ti standardních svodů, realizovat několik druhů poruch srdeční činnosti a k signálu mohou být přidána různá rušení. Generovaný signál lze v reálném čase vysílat na výstup měřicí karty nebo ukládat do textového souboru v zadaném formátu.
|
|
| |
host ::
RSS.