Název: Molecular characterisation of stolbur phytoplasma infecting red clover in the Czech Republic
Překlad názvu: Molecular characterisation of stolbur phytoplasma infecting red clover in the Czech Republic
Autoři: KOLOUŠKOVÁ, Pavla
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2008
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Testované vzorky jetele lučního (Trifolium pratense) se symptomy zakrslosti byly získány v průběhu podzimu 2004 ze šlechtitelské stanice v Hladkých Životicích. Po izolaci a amplifikaci 16S rDNA a následném restrikčním štěpení byla identifikována fytoplazma skupiny stolburu (16S rDNA XII-A). Pro bližší fylogenetické zařazení byly amplifikovány další dva geny. Analýza Tuf genu potvrdila předchozí závěr a pomocí štěpení enzymem HpaII byl idetifikován Tuf type II. Následná analýza genu pro DNA helikázu byla orientační (restrikční profily doposud nebyly publikovány). Srovnání sekvencí genu 16S rDNA, Tuf genu a genu pro DNA helikázu s daty v GenBank potvrdilo zařazení diagnostikované fytoplazmy do skupiny stolburu resp. do taxonu Candidatus Phytoplasma solani, což potvrdilo předešlou PCR/RFLP analýzu. The tested samples of red clover (Trifolium pratense) with symptoms of stunting were acquired during November, 2004 from a breeding station in Hladké Životice. After the isolation and amplification of 16S rDNA and consequential restrictive digestion a stolbur group phytoplasma (16S rDNA XII-A) was identified. For a more specific phylogenetic classification another two genes were amplified. The Tuf gene analysis reinforced results of previous results and by the use of digestion with HpaII enzyme Tuf type II was identified. The follow-up analysis of DNA helicase gene was an orientational one (restriction profiles have not been published so far). The comparison of 16S rDNA gene sequences, Tuf gene and DNA helicase gene with the data in GenBank proved the classification of diagnosed phytoplasma within the stolbur group, or more precisely the Candidatus Phytoplasma solani species, which proved the previous PCR/RFLP analysis right.
Klíčová slova: 16S rDNA; DNA helikáza; Fytoplazma stolburu; Tuf gen; 16S rDNA; DNA helicase; stolbur phytoplasma; Tuf gene
Citace: KOLOUŠKOVÁ, Pavla. Molecular characterisation of stolbur phytoplasma infecting red clover in the Czech Republic. České Budějovice, 2008. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Fakulta zemědělská a technologická

Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/9671

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-49391


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce