Original title: Rychlá metodika pro rozlišení česneku (Allium sativum L.), typu český paličák, pomocí mikrosatelitních markerů: metodika pro praxi
Translated title: A simple method for detection of Czech bolting garlics (Allium sativum L.) using microsatellite analysis: methodology for practice
Authors: Ovesná, Jaroslava ; Mitrová, Katarína ; Kučera, Ladislav
Document type: Methods
ISBN: 978-80-7427-237-0
Year: 2017
Language: cze
Publisher: Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
Abstract: [cze] [eng]
Cílem této metodiky bylo ověřit a sestavit soubor mikrosatelitních markerů pro účely ověření, které je třeba použít pro nespornou identifikaci vybraných druhů česneku typu český paličák. Předmětem metodiky je jednoduchý postup pro určení česneků typu český paličák pomocí analýzy mikrosatelitů (SSR- Single Sequence Repeats), který je využitelný zkušebními laboratořemi v praxi. Popsaná metoda umožňuje identifikovat odrůdy a novošlechtění českého česneku typu paličáku pomocí DNA markerů (alel mikrosatelitů), které jsou přítomny pouze u této skupiny odrůd a novošlechtění česneku. Podstatou je amplifikace úseků genomu obsahující daný mikrosatelitní lokus pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) při použití specifických, flourescenčně značených primerů a následná analýza délky produktů PCR. Metodika nově přináší unikátní soubor diagnostických SSR markerů, postup hodnocení a interpretace výsledků. The aim of the methodology was to verify and compile a set of microsatellite markers for the purpose of verification to be used for the undisputed identification of selected types of Czech bolting garlics. The object of submitted methodology is to simplify procedure that allow to determine Czech bolting garlic using microsatellite analysis (SSR- Single Sequence Repeats), which is applicable in testing laboratories. The described method allows to identify the variety and breeding material of bolting garlic of Czech origin using DNA markers (microsatellite alleles) that are present only for this group of varieties and breeding lines. By the amplification of the genome containing the microsatellite locus by polymerase chain reaction (PCR) using specific, fluorescently labeled primers, and subsequent analysis of the lengths of PCR products. Methodology newly brings a unique set of diagnostic SSR markers, describe the evaluation and interpretation of the results.
Keywords: Allium sativum; bulbous vegetables; DNA; markers; microsatellites; Allium sativum; cibulová zelenina; DNA; markery; mikrosatelity
Project no.: QJ1210158 (CEP)
Funding provider: Ministerstvo zemědělství
Rights: This work is protected under the Copyright Act No. 121/2000 Coll.

Institution: Crop Research Institute (web)

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-384994


The record appears in these collections:
Research > Scientific research institutions > Crop Research Institute
Analytical and methodological materials > Methods