Original title: Metylace regulačních oblastí HPV 16 u tonsilárních karcinomů s integrovanou a extrachromozomální formou viru
Translated title: Methylation of the regulatory sequences of integrated and extrachromosomal form of HPV 16 in tonsillar tumors
Authors: Pokrývková, Barbora ; Tachezy, Ruth (advisor) ; Hubáček, Petr (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2016
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Lidské papilomaviry jsou spojeny s indukcí karcinomu hrdla děložního a řadou dalších karcinomů v anogenitální oblasti a také s významnou částí nádorů hlavy a krku. Přítomnost virových onkoproteinů E6 a E7 může v buňce navodit trasnformovaný stav, jejich zvýšená hladina je způsobena inaktivací regulačního proteinu E2. Předmětem současného studia jsou mechanismy, kterými je inaktivace E2 způsobena. Jednou z možností je integrace virové DNA do genomu hostitele, ke které dochází v oblasti genu E2. Byly však nalezeny karcinomy, kde se virus nachází v extrachromozomální formě. Ukazuje se, že při vzniku tohoto typu nádorů mohou hrát roli epigenetické změny, zejména DNA metylace, či mutace v regulační oblasti viru. Byla provedena analýza stupně metylace u vzorků tonsilárních karcinomů s extrachromozomální a integrovanou formou viru, dále v obou skupinách porovnána virová nálož a potvrzena exprese E6 a E7 genu. Výsledky metylační analýzy ukazují zvýšenou metylaci viru s integrovanou DNA, avšak pro některé oblasti nejsou signifikantní. Mutace ve vazebných místech E2 proteinu jsme neodhalili. Exprese virových onkogenů byla potvrzena u všech nádorů bez ohledu na formu virového genomu. Mechanismus indukce nádorů, zejména pro virus s extrachromozomální formou viru, zůstává předmětem dalšího výzkumu. Klíčová... Human papillomavirus is connected with induction of cervical carcinoma as well as for some other anogenital carcinomas and subset of carcinomas of head and neck. Presence of viral E6 and E7 oncoproteins may induce cell transformation, higher load of oncoproteins is caused by the regulatory E2 protein inactivation. Aims of recent study are mechanisms of E2 protein inactivation. One option is integration of viral DNA into the host genome, which is located into the E2 gene region. Some carcinomas, where virus with extrachromosomal form was presented, were found. It appears that epigenetic changes can play the role in the development of this type of tumors, especially DNA methylation or mutation in the regulatory region of the virus. The methylation degree analysis on samples of tonsillar carcinomas with extrachromosomal and integrated form of the virus was conduced, as well as viral load of both groups was compared and the expression of E6 and E7 gene was confirmed. The results of methylation analysis showed increased methylation of the virus with integrated DNA. Mutations in the E2 protein binding sites are not revealed. The expression of the viral oncogenes were confirmed in all tumors regardless of the form of the viral genome. The mechanism of tumors induction, especially for virus with...
Keywords: HPV; integration; methylation; tonsil; tumor; HPV; integrace; metylace; nádor; tonsila

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/74701

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-344067


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses