Original title: Mer1 a Nam8 v regulaci sestřihu.
Translated title: Mer1 and Nam8 in splicing regulation
Authors: Marková, Michaela ; Abrhámová, Kateřina (advisor) ; Stejskalová, Eva (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2013
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Proteiny Mer1 a Nam8 vzájemnou kooperací aktivují sestřih čtyř specifických pre-mRNA genů: AMA1, MER2, MER3 a SPO22 potřebných pro meiotickou rekombinaci a jaderné dělení. Exprese těchto genů se v rámci buněčného cyklu nemění, ale k efektivnímu sestřihu jejich pre-mRNA dochází pouze v průběhu meiózy, protože pouze v meiotických buňkách je exprimován protein Mer1, který usnadňuje jejich sestřih. Všechny tyto pre-mRNA obsahují nekonsensuální 5'sestřihové místo (5'splice site, 5'ss), které je ve srovnání s konsensuální sekvencí hůře rozpoznatelné pro podjednotkou spliceosomu U1 snRNP. Na pre-mRNA těchto genů se nachází enhancerová oblast v blízkosti 5'ss, na kterou se váže Mer1p, jenž zefektivňuje vyvazování U1 snRNP. Mer1p spolupracuje prostřednictvím dalších proteinů s Nam8p, který je součástí U1 snRNP. Nam8p se váže na pre-mRNA downstream od 5'ss v blízkosti enhancerové oblasti. Mer1p a Nam8p společně usnadňují sestavování spliceosomu na nekonsensuálním 5'ss a následně sestřih pre-mRNA. By the mutual cooperation, Mer1 nad Nam8 proteins activate pre-mRNA splicing of four specific genes: AMA1, MER2, MER3 and SPO22, that are required for meiotic recombination and nuclear division. Expression of these genes does not change during the cell cycle, nevertheless, the efficient splicing of their pre-mRNA occures only during meiosis because Mer1 protein, which facilitates their splicing, is expressed only in meiotic cells. All these pre-mRNAs contain nonconsensual 5'splice site (5'ss) which is less recognizable for the spliceosomal subunit U1 snRNP in comparison with the consensual sequence. There is an enhancer area near to 5'ss on the pre-mRNA of this genes that serves as a binding site for Mer1p which makes recruitment of U1 snRNP more efficient. Mer1p cooperate via other proteins with Nam8p. Protein Nam8, a part of U1 sn RNP, is bound on pre-mRNA downstream from 5'ss close to the enhancer area. Mer1p in cooparation with Nam8p facilitates spliceosome assembly on the nonconsensual 5'ss and subsequently pre-mRNA splicing.
Keywords: Mer1p; Nam8p; pre-mRNA splicing; Saccharomyces cerevisiae; spliceosome; Mer1p; Nam8p; Saccharomyces cerevisiae; sestřih pre-mRNA; spliceosom

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/53541

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-322838


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses