Název: Studium epigenetických regulací HLA genů II. třídy v rámci příbuzenských vztahů.
Překlad názvu: The study of epigenetic regulation of gene HLA II. Clas within family relationships
Autoři: Chmel, Martin ; Černá, Marie (vedoucí práce) ; Urbanová, Jana (oponent)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2015
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Úvod: V současné postgenomické době představuje studium epigenetických regulací jeden z nástrojů pro porozumění funkci genů. Epigenetické regulace mohou přímo řídit časovou a prostorovou aktivitu genů či jejich umlčení. Molekulární podstata těchto regulací spočívá v modifikaci bází DNA, remodelaci chromatinu a RNA interferenci. Zároveň tyto mechanismy vykazují vlastní způsob přenosu dědičné informace do dalších generací nazývaný epigenetikcá dědičnost. V rámci mnoha chorob byla jako příčina prokázána deregulace epigenetické informace určitých genů. Z tohoto důvodu se jeví studium epigenomu HLA genů jako zvláště důležité, neboť tyto geny hrají zásadní roli v regulaci imunitního systému. Cíle: Cílem této práce je vytvořit popis epigenetických modifikací v rámci rodin. Jedná se o analýzu histonových modifikací a metylace DNA v promotorovém úseku genu HLA DQA1. Cílem bylo rovněž srovnat rozdíly v epigenetických modifikacích mezi alelami a také srovnání rozdílů v daných modifikacích mezi generacemi. Získané výsledky budou porovnány s analýzou míry exprese genu HLA DQA1. Metody: Z odebrané periferní krve dárců byly izolovány DNA, RNA a leukocyty. DNA byla použita ke genotypizaci. Další část vzorků DNA byla konvertována bisulfitovou metodou a posléze sekvenována. Ze získaných dat byla provedena analýza... Introduction: At our post-genomic era the studies of epigenetic regulation constitutes one of the tools for understanding the function of genes. Epigenetic regulation can directly control the temporal and spatial gene activity or silencing. The molecular basis of these regulations are DNA bases modifications, chromatin remodeling and RNA interference. At the same time, these mechanisms have a special way of transferring genetic information to subsequent generations called epigenetic inheritance. It has been proven epigenetic deregulation of certain genes as cause for many disease. For this reason, the study of epigenome HLA genes seems particularly important because these genes play a fundamental role in regulating the immune system. Aims: The aim of this work is to create a description of epigenetic modifications within families. It is an analysis of histone modifications and DNA methylation in the promoter region of the gene HLA DQA1. The aim was also to compare the differences in epigenetic modifications between alleles and compared the differences in these modifications between generations. The results will be compared with the analysis of the level of expression of the gene HLA DQA1. Methods: From collected peripheral blood of donors were isolated DNA, RNA, and leukocytes. DNA was used for...
Klíčová slova: DQA1; epigenetika; exprese mRNA; histonové modifikace; HLA II. třídy; metylace DNA; DNA methylation; DQA1; epigenetics; histone modifications; HLA class II; mRNA expression

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/2481

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-267904


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce