Original title: Image analysis of the movement of sub-cellular structures
Translated title: Obrazová analýza pohybu struktur uvnitř buněk
Authors: Matula, Pe. ; Ondřej, Vladan ; Kozubek, Stanislav
Document type: Papers
Conference/Event: Biophysics of the Genome, Brno (CZ), 2004-10-12 / 2004-10-13
Year: 2004
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Analysis of time-lapse series of images of living cells requires automation. This contribution concerns the main features of the software package developed for this purpose in our laboratory. Some improvements of our recently published method for tracking of sub-cellular structures based on graph theory are presented. The behaviour of the method is evaluated on images of centromeric heterochromatin defined by HPlbeta-GFP fusion protein. The results show that the method is very well applicable for this type of data. Analýza časových sérií obrázů živých buněk vyžaduje automatizaci. Tento příspěvek popisuje hlavní rysy softwarového balíku, který byl k tomuto účelu vytvořen v naší laboratoři. Prezentuje několik vylepšení námi nedávno publikované metody pro sledování pobybu buněčných struktur. Chování metody je vyhodnoceno na obrázcích heterochromatinových oblastí definovaných HP1beta-GFP fúzním proteinem. Výsledky ukazují, že pro tento typ dat je navržená metoda velmi vhodná.
Keywords: graph theory; image analysis; sub-cellular structures
Project no.: CEZ:AV0Z5004920 (CEP), GA202/04/0907 (CEP), IBS5004010 (CEP), IAA5004306 (CEP)
Funding provider: GA ČR, GA AV ČR, GA AV ČR
Host item entry: Biophysics of the Genome: Proceedings of the Workshop Held at Brno, ISBN 80-210-3560-9

Institution: Institute of Biophysics AS ČR (web)
Document availability information: Fulltext is available at the institute of the Academy of Sciences.
Original record: http://hdl.handle.net/11104/0015611

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-20424


The record appears in these collections:
Research > Institutes ASCR > Institute of Biophysics
Conference materials > Papers