Název: Image analysis of the movement of sub-cellular structures
Překlad názvu: Obrazová analýza pohybu struktur uvnitř buněk
Autoři: Matula, Pe. ; Ondřej, Vladan ; Kozubek, Stanislav
Typ dokumentu: Příspěvky z konference
Konference/Akce: Biophysics of the Genome, Brno (CZ), 2004-10-12 / 2004-10-13
Rok: 2004
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
Analysis of time-lapse series of images of living cells requires automation. This contribution concerns the main features of the software package developed for this purpose in our laboratory. Some improvements of our recently published method for tracking of sub-cellular structures based on graph theory are presented. The behaviour of the method is evaluated on images of centromeric heterochromatin defined by HPlbeta-GFP fusion protein. The results show that the method is very well applicable for this type of data. Analýza časových sérií obrázů živých buněk vyžaduje automatizaci. Tento příspěvek popisuje hlavní rysy softwarového balíku, který byl k tomuto účelu vytvořen v naší laboratoři. Prezentuje několik vylepšení námi nedávno publikované metody pro sledování pobybu buněčných struktur. Chování metody je vyhodnoceno na obrázcích heterochromatinových oblastí definovaných HP1beta-GFP fúzním proteinem. Výsledky ukazují, že pro tento typ dat je navržená metoda velmi vhodná.
Klíčová slova: graph theory; image analysis; sub-cellular structures
Číslo projektu: CEZ:AV0Z5004920 (CEP), GA202/04/0907 (CEP), IBS5004010 (CEP), IAA5004306 (CEP)
Poskytovatel projektu: GA ČR, GA AV ČR, GA AV ČR
Zdrojový dokument: Biophysics of the Genome: Proceedings of the Workshop Held at Brno, ISBN 80-210-3560-9

Instituce: Biofyzikální ústav AV ČR (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dokument je dostupný v příslušném ústavu Akademie věd ČR.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11104/0015611

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-20424


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Věda a výzkum > AV ČR > Biofyzikální ústav
Konferenční materiály > Příspěvky z konference