Název: Metodika identifikace původců fuzarióz klasu pomocí PCR
Překlad názvu: Method of identification of Fusarium species causing head blight by PCR
Autoři: Sumíková, Taťána ; Gabrielová-Slezáková, Ludmila ; Žabka, Martin
Typ dokumentu: Metodiky
Rok: 2009
Jazyk: cze
Nakladatel: Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
Abstrakt: [cze] [eng]
Cílem navrhované metodiky je uvedení kompletních protokolů k detekci následujících druhů r. Fusarium - F. avenaceum, F. culmorum, F. poae, F. graminearum, F. pseudograminearum, F. sporotrichioides - pomocí multiplex PCR. Sekvence použitých druhově specifických primerů jsou převzaté z literatury a byly vybrány tak, aby bylo možné je vzájemně a libovolně kombinovat, což umožňuje detekci jednoho nebo až všech šesti výše uvedených druhů v jedné PCR reakci. Reakce jsou optimalizovány pro použití v běžné laboratoři molekulární biologie. V metodice je nově zavedena technika pěstování mikromycet ve formě povrchových kultur na celofánu. Tato technika je speciálně určena pro následnou izolaci DNA z houbového mycelia. Technika pěstování povrchových kultur na celofánu umožňuje optimální manipulaci s napěstovaným myceliem, které se z celofánu snadno odstraní pomocí skalpelu, přičemž nedochází k nežádoucí kontaminaci vzorku agarovým kultivačním médiem nebo nečistotami z přirozeného substrátu (z napadeného vzorku). 1. Multiplex PCR reaction with reliable published primers, enabling an easy detection of selected Fusarium species in one reaction, without time consuming optimalization. 2. Method of micromycetes cultivation using medium covered with cellophane, that is very suitable for following DNA extraction (easier harvesting of mycelia, minimal risk of medium contamination).
Klíčová slova: detekce; Fusarium sp.;; fuzarióza klasu; mikromycety;; molekulární biologie; PCR;; reakce; fusarium head blight; micromycetes;; modulated signal detection; molecular biology; reaction
Číslo projektu: QG50076 (CEP), MZe0002700604
Poskytovatel projektu: Ministerstvo zemědělství ČR, Ministerstvo zemědělství ČR
Práva: Dílo je chráněno podle autorského zákona č. 121/2000 Sb.

Instituce: Výzkumný ústav rostlinné výroby (web)

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-123850


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Věda a výzkum > Veřejné výzkumné instituce > Výzkumný ústav rostlinné výroby
Analytické a metodické materiály > Metodiky